基因间隔序列（ITS）在水产动物种质鉴定和遗传多样性分析中的应用

近年来，由于国内外市场对水产品的需求不断增长，水产业因此获得了长足的发展，许多水产种类的养殖量有了大幅度的增加，在给我国国民经济的增长作出贡献的同时，已经不可避免的带来了许多弊端，一些方面甚至在一定程度上会影响未来水产业的发展。其中最应该引起关注的是由于目前捕捞强度的增加、生态环境的恶化等，导致许多种群的数量大量减少，产量也随之降低，种质资源遭到前所未有的破坏和衰退。因此，种质鉴定、种群分析及保护和遗传多样性的研究已经成为当前水产研究的当务之急。     

基因间隔序列(ITS)在水产动物种质鉴定和遗传多样性分析中的应用

近年来,由于国内外市场对水产品的需求不断增长,水产业因此获得了长足的发展,许多水产种类的养殖量有了大幅度的增加,在给我国国民经济的增长作出贡献的同时,已经不可避免的带来了许多弊端,一些方面甚至在一定程度上会影响未来水产业的发展。其中最应该引起关注的是由于目前捕捞强度的增加、生态环境的恶化等,导致许多种群的数量大量减少,产量也随之降低,种质资源遭到前所未有的破坏和衰退。因此,种质鉴定、种群分析及保护和遗传多样性的研究已经成为当前水产研究的当务之急[2-7]。随着分子生物学技术的发展,理论与实际应用以前所未有的速度…     

紫红笛鲷随机扩增多态性DNA及遗传多样性分析

采用RAPD技术分析了湛江近海紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus Forskal)的遗传多样性。从120个随机引物中筛选出了14个引物。14个引物共检测到173个位点，其中多态位点比例(P)为68．79％，遗传距离(D)为0．2228，遗传多样性指数(日)为0．1904。结果表明，目前湛江近海的紫红笛鲷自然群体的遗传多样性仍然维持在良好水平，捕捞尚未对其造成明显影响。     

长江下游鳊鱼遗传多样性的RAPD分析

应用RAPD技术对长江下游鳊鱼群体的遗传多样性进行分析,从40个随机引物中筛选出28个引物对鳊鱼24个个体的基因组DNA进行扩增,共检测到178个位点,分子片段在0.2～2.0kb之间,其中多态位点83个,占46.63%;个体间最大的遗传距离为0.1326,最小的遗传距离为0.0476,平均遗传距离为0.0885;群体的Nei基因多样性指数为0.2593,Shannon多样性指值为0.0986。与其他鱼类的遗传多样性研究结果相比,长江下游鳊鱼群体的遗传多样性处于中等水平。     

紫红笛鲷随机扩增多态性DNA及遗传多样性分析

采用RAPD技术分析了湛江近海紫红笛鲷 (LutjanusargentimaculatusForsk l)的遗传多样性。从 12 0个随机引物中筛选出了 14个引物。 14个引物共检测到 173个位点 ,其中多态位点比例 (P)为 6 8.79%,遗传距离 (D)为 0 .2 2 2 8,遗传多样性指数 (H)为 0 .190 4。结果表明 ,目前湛江近海的紫红笛鲷自然群体的遗传多样性仍然维持在良好水平 ,捕捞尚未对其造成明显影响。     

近江牡蛎两个野生种群的遗传多样性分析

采用RAPD分子标记和rDNA-ITS1序列分析了近江牡蛎Crassostrea rivularis湛江官渡和阳江程村野生种群的遗传多样性。12个RAPD引物共扩增出8838条片段,157个位点,平均每个引物可产生13个位点,片段长度在200～2200bp之间。湛江种群和阳江种群的多态位点比例分别为89.62%和89.57%,遗传多样性指数分别为0.4170和0.4334。种群间平均遗传距离为0.0327,平均遗传相似性为0.9681,平均遗传分化系数为0.0437。得到近江牡蛎18S、5.8S部分序列和ITS1全部序列,其中ITS1序列片段长度为478～485bp,共有11个变异位点,两个为转换(A/G),其他为插入/缺失(A/-、T/-)。湛江和阳江种群各获得8个单倍型,其中有一个单倍型为两个种群共享。两个种群的CG碱基平均含量较高,分别为58.29%和58.41%。种群间的遗传分化系数0.0254。结果说明,近江牡蛎湛江种群和阳江种群间具有较高的遗传多样性和较低的遗传分化。     

凡纳滨对虾IHHNV群体遗传多样性的SSR分析

利用SSR标记分析广西凡纳滨对虾育种中心选育的凡纳滨对虾品种中抗传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)家系的遗传多样性,为凡纳滨对虾抗IHHNV育种亲本材料的选择提供参考。通过体外攻毒试验,从育种中心构建的凡纳滨对虾家系中筛选出抗IHHNV的家系,然后利用SSR标记对筛选出的抗IHHNV品种的遗传多样性进行分析。结果表明,6对引物在上述抗病毒品种中共检测到162个等位变异,每对引物平均为3个,引物的多态信息含量(PIC)在0.372 8～0.479 7之间,平均为0.434 1;抗病品种间的遗传相似系数平均为0.894 2,表明筛选出的抗病品种遗传多样性较高。     

运用RAPD技术分析3种罗非鱼的遗传多样性

应用RAPD技术,从7个系列140种随机引物中筛选出15个,对尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、奥利亚罗非鱼(O.aureus)和星洲银罗非鱼(O.sp.)进行遗传多样性分析。结果表明,尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼、星洲银罗非鱼的多态位点比例(P)分别为54.7%、44.4%和56.0%,种内个体间遗传距离分别为0.145 0、0.115 6和0.141 3,种内遗传相似系数分别为0.855 0、0.884 6和0.858 7;种间遗传距离的聚类分析表明,星洲银罗非鱼与尼罗罗非鱼亲缘关系较近,一定程度上验证了星洲银罗非鱼的分类地位。     

两种体色画眉笛雕的遗传多样性及分子标记

根据体侧纵带颜色差异,暂将画眉笛鲷(Lutjanus vitta)分为黄带画眉笛鲷和褐带画眉笛鲷,应用RAPD技术,选用22个引物对黄带画眉笛鲷与褐带画眉笛鲷进行遗传多样性及分子标记研究。结果表明,黄带画眉笛鲷与褐带画眉笛鲷的遗传距离为0.832 9,其多态位点比例(P)分别为66.99%和85.28%,遗传多样性指数(H)分别为0.161 7和0.289 3,种内遗传距离(D)分别为0.243 5和0.431 9,表明褐带画眉笛鲷的遗传多样性比黄带画眉笛鲷丰富。共得到OPP14-629bp和OPP14-674bp等11个特异性分子标记,可用于两种笛鲷的鉴定。     

凡纳滨对虾4个选育群体遗传多样性的SSR分析

采用9对微卫星引物分析了凡纳滨对虾4个选育群体(Molokai、OI、SIS和Kona Bay)的遗传多样性。结果表明:9对微卫星引物共检测到32个等位基因,每个位点等位基因数2～7个,平均3.555 6个,平均有效等位基因数2.472 7;各位点的观测杂合度(Ho)0.026 0～0.623 4,期望杂合度(He)0.263 1～0.785 5;各群体平均观测杂合度从小到大依次为SIS(0.383 3)相似文献   

红鳍笛鲷微卫星DNA标记的开发与遗传多样性分析

以三亚外海的红鳍笛鲷(Lutjanus erythropterus)自然群体为研究对象,利用磁珠富集法开发19个适用于红鳍笛鲷的微卫星DNA标记,其中16个为多态性标记,等位基因数为2～11,期望杂合度为0.242～0.896,观测杂合度为0.156～1.000,Ler 14、Ler 29、Ler 49等3个位点偏离哈迪-温伯格平衡(P<0.0031),Ler9-Ler18、Ler12-Ler19、Ler46-Ler47、Ler46-Ler49、Ler18-Ler50、Ler14-Ler51等6对位点间检测到明显的连锁(P<0.05),Ler29、Ler13、Ler49、Ler19、Ler24、Ler25、Ler14、Ler51、Ler18、Ler9等10个位点属于高度多态位点[多态信息含量(PIC)>0.5],Ler47、Ler12、Ler15、Ler46等4个为中度多态位点(0.25>PIC>0.5)。     

Isozymes Analysis of the Golden Cuttlefish Sepia esculenta (Cephalopoda: Sepiidae)

1　Introduction　ThegoldencuttlefishSepiaesculenta,aneriticanddemersalspecies,livesinthedepthof 1 0 - 1 0 0meters,andsometimesinseabottomsand .Itiswidelydistrib utedfromcentralHonshutoVietnamandthePhilip pines .Thegoldencuttlefishisalsoanimportantobjectof…     

洪湖微齿眼子菜种群遗传多样性研究

采用RAPD方法研究了洪湖微齿眼子菜种群的遗传多样性，矛初步探讨了它的遗传结构及影响因素。在97个脚标记中有28条（28．87％）是多态性标记，Shannon信息多样性指数分析表明该种群总的遗传多样性为0.193，说明洪湖微齿眼子菜种群的遗传多样性水平较低。研究发现距离和种群发展历史对洪湖微齿眼子菜种群的遗传结构有重要影响。     

洪湖微齿眼子菜种群遗传多样性研究

采用RAPD方法研究了洪湖微齿眼子菜种群的遗传多样性,并初步探讨了它的遗传结构及影响因素。在97个RAPD标记中有28条(28.87%)是多态性标记,Shannon信息多样性指数分析表明该种群总的遗传多样性为0.193,说明洪湖微齿眼子菜种群的遗传多样性水平较低。研究发现距离和种群发展历史对洪湖微齿眼子菜种群的遗传结构有重要影响。     

胡子鲇3个养殖群体遗传结构的AFLP分析

应用AFLP方法,从64对引物中筛选出5对用于分析胡子鲇(Claris fuscus)厦门(XM)、江门(JM)、玉林(YL)等3个养殖群体共90个个体群体内、群体间遗传多样性。扩增共得到289条清晰谱带,引物多态性介于47.8%～63.8%,平均多态性比率为56.4%。胡子鲇群体总遗传杂合度(Ht)、遗传分化系数(Hs)、遗传分化度(Gst)和基因流(Nm)分别为0.161 1、0.153 6、0.051 1和8.501 8,表明胡子鲇多态性处于中等偏下水平,群体内部遗传分化系数较高,三个群体间无较大分化,群体间基因流动较好。其中,JM群体多态性比率、有效等位基因数Ne、Nei’s指数和Shannon指数都较XM群体和YL群体高,种内分化程度较好。对群体进行两两比较发现,XM群体和YL群体间分化程度最大,XM群体和JM群体次之,JM群体和YL群体最小。基于杂交优势,推断XM和YL群体繁殖所产生的后代将具有比亲代更为优良的性状。