巨蛎属（Crassostrea）四种牡蛎精子Bindin蛋白海藻糖凝集素结构域（Fucose binding lectin）多样性研究

提取巨蛎属中熊本牡蛎、葡萄牙牡蛎和日本巨牡蛎的基因组DNA,应用PCR技术扩增了三种牡蛎的海藻糖凝集素结构域（Fucose binding lectin,F-lectin）,结合GenBank中长牡蛎海藻糖凝集素结构域的序列利用邻接法对得到的序列进行了系统进化分析,并利用非同义替换率和同义替换率之间的比值分析了巨蛎属四...     

虎斑乌贼(Sepia pharaonis)FMRFamide G蛋白偶联受体基因的克隆与表达定位研究

以FMRFamide为典型代表的FMRFamide相关肽,是目前已知的最大的神经肽家族。FMRFamide广泛参与多种生理过程,包括摄食、心跳、渗透平衡、变态、防御和免疫等。采用同源克隆法与RACE技术获得了虎斑乌贼FMRFamide的G蛋白偶联受体基因cDNA全长序列(命名为SpFaGPCR,OL765295),SpFaGPCR cDNA全长1514bp,包括222bp的5''-非编码区(5''-UTR)、35 bp的3''-UTR以及1257bp的开放阅读框(ORF),共编码418个氨基酸。预测相对分子量(MW)为49.8kDa,等电点(pI)为9.76,具有7个跨膜结构域、糖基化位点7个、磷酸化位点36个。同源序列比对分析表明,SpFaGPCR与曼氏无针乌贼的FaGPCR氨基酸序列相似度最高达98%。系统发育分析显示SpFaGPCR与双壳纲的FaGPCR聚为姐妹支。荧光定量结果显示SpFaGPCR在视叶、视腺、脑、缠卵腺中表达量相对较高(P<0.05)。进一步利用原位杂交技术检测到虎斑乌贼视叶的髓质区、视网膜的感光细胞和缠卵腺的瓣叶外层具有明显的阳性杂交信号。实验结果为进一步探讨FMRFamide通过FaGPCR的介导参与虎斑乌贼生理代谢功能奠定了前期基础。     

Rab蛋白的结构、功能与研究展望

Rab蛋白是小分子GTP结合蛋白，约由200个氨基酸组成，Rab蛋白在生物体中高度保守，由保守的G结构域和高度可变的N端和C端组成．Rab蛋白与上游调控子和下游特定的效应子相互作用，并与GTP的结合和水解过程相偶联，在囊泡运输的不同阶段发挥作用．     

多波束测深系统中凹凸变形地形的分析与处理

在平坦海区测量工作中,多波束测深系统质量监控窗口经常会显示出凹凸变形地形,如果处理不及时或处理不当,将会导致测量的海底地形呈现凹凸不平的伪地形,严重影响测量工程的质量。分析了多波束系统测量凹凸变形地形的原因,论述了在测量中以及数据后处理中解决测量凹凸变形地形故障的方法,实际应用证明方法有效、实用。     

复方中药及其与抗生素联用对斜带石斑鱼变形假单胞菌病的防治效果

通过药物体外抑菌效果及其对斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)抗病力影响的研究,筛选出有效治疗斜带石斑鱼变形假单胞菌(Pseudomonas plecoglossicida)病的复方中药与中西药联用配方。在不同复方中药实验组投喂饲料中添加不同比例黄连、黄芪与黄柏,设定三联复方中药实验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ（黄连、黄芪、黄柏质量比分别为0.9∶〖KG-*2〗1.3∶〖KG-*2〗0.9、1.2∶〖KG-*2〗0.9∶〖KG-*2〗1.0、1.0∶〖KG-*2〗1.0∶〖KG-*2〗1.0）;复方中药与抗生素联用组中, 将不同质量比的中药黄连、黄芪、黄柏与抗生素恩诺沙星添加入饲料,分别设定为中西药联用实验组Ⅳ、V、VI。各三联中药与中西药联用实验组均添加占饲料2.2%质量分数的药物。研究结果为：三联复方中药浓度为60 mg/mL,黄连、黄芪、黄柏质量比为1.2∶〖KG-*2〗0.9∶〖KG-*2〗1.0时,抑制变形假单胞菌的效果最好,为复方中药组中最佳配方。养殖实验进行至40 d时,鱼死亡率由高到低分别为：对照组Ⅱ>对照组Ⅳ>对照组Ⅲ>实验组Ⅰ>实验组Ⅲ>实验组Ⅱ>实验组V>实验组VI >实验组Ⅳ>对照组Ⅰ。实验组Ⅱ（饲料中添加质量比为1.2∶〖KG-*2〗0.9∶〖KG-*2〗1.0的黄连∶〖KG-*2〗黄芪∶〖KG-*2〗黄柏）为药效最好的复方中药配方,实验组Ⅳ（黄连∶〖KG-*2〗黄芪∶〖KG-*2〗黄柏∶〖KG-*2〗恩诺沙星比为 0.9∶〖KG-*2〗1.3∶〖KG-*2〗0.9∶〖KG-*2〗1.3）为治疗鱼病效果最好的中西药联用配方。中西药联用相比复方中药治疗斜带石斑鱼变形假单胞菌病效果好,对于患变形假单胞菌病的斜带石斑鱼有较好的疗效。     

罗非鱼源无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)新型AI-2信号分子受体RbsB蛋白结晶生长研究

为了开展无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)核糖结合蛋白(Ribose binding protein B, RbsB)结构功能的研究,本实验根据已知无乳链球菌ZQ0910全基因组序列设计相关引物。采用PCR方法扩增其RbsB基因,随后将该基因定向克隆到原核表达载体pGEX-6p-1中,在大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中进行IPTG诱导表达;采用HRV3C蛋白酶切除GST标签,分子筛分离获得RbsB蛋白;运用生物信息学软件对RbsB基因序列进行分析,并对RbsB蛋白二级和三级结构进行预测;采用NeXtal Tubes JCSG Core Suite结晶试剂盒筛选蛋白结晶条件。研究结果表明,该基因全长为969碱基,编码322个氨基酸, RbsB蛋白理论分子量33.9ku,等电点为9.41,二级结构中α螺旋结构所占比重最高,建立RbsB蛋白三维结构模式图;经IPTG诱导后表达的融合蛋白分子量为59ku,筛选RbsB蛋白的初始结晶条件为(0.2mol/Ldi-Potassiumhydrogenphosphate,20%(W/V)PEG3350;1.5mol/L...     

蓝隐藻藻蓝蛋白结构与功能稳定性研究

以蓝隐藻(Chroomonas placiodea)藻蓝蛋白 PC-645为材料,通过改变环境 pH 和尿素质量浓度,监测其变性和复性过程中特征荧光谱和吸收谱的动力学变化,以期了解隐藻藻蓝蛋白的色基和蛋白结构稳定性及其与功能的关系。结果表明, PC-645在很宽的 pH 范围和一定质量浓度的尿素中维持结构和功能的稳定,空间结构具有很强的柔性。pH诱导的 PC-645蛋白构象与功能变化可分为3个不同的区段。(1)稳定区(pH 3.5~7)：吸收和荧光光谱都比较稳定,显示蛋白质构象和功能在此区域都保持正常。(2)次稳定区(pH 7~10)：光吸收依然保持平稳,亚基内部的色基的状态和疏水微环境都没有改变,但荧光传递效率降低,可能是由亚基表面局部构象变化、解离(四级结构变化)或者色素基团间的空间距离变化引起。(3)不稳定区(pH<3.5和 pH>10),吸光度和荧光强度都呈快速下降,色基在近紫外和可见光区的吸收峰位变动,蛋白构象处于快速崩溃期。PC-645在酸性条件下的稳定性高于在碱性环境下,是与隐藻藻蓝蛋白所处的特殊环境及生理功能相适应的。     

蛋白核小球藻在废水污泥中培养的研究

啤酒厂废水污泥中含有一定的营养元素和活性物质。本研究利用废水污泥培养蛋白核小球藻（Chlorellapyrenoidosa）取得了初步结果。将一定比例的活性污泥掺入普通培养液形成混合培养基,其中80：20试验组无论从蛋白核小球藻的生物量还是粗蛋白的含量均与普通培养基的培养产物近似,具有实践意义。结果表明,混合培养基培养某些藻类,不仅降低了养殖成本,还可净化环境,为废水污泥用于藻类养殖开辟了一条新途径。     

藻胆蛋白 与绿藻光合膜之间的激发能传递

研究了藻胆蛋白与绿藻光合膜之间激发能传递的关系.发现只有在别藻蓝蛋白存在时,藻红蛋白或藻蓝蛋白才能将其所吸收的光能传递给一起温育的绿藻类囊体光系统Ⅱ.传能效率与藻胆蛋白的种类有关.藻胆蛋白只能将激发能传递给经SDS-PAGE纯化的LHCⅡ,但不能传递给D₂蛋白.     

毛蚶血浆中抗菌蛋白的纯化及抗菌活性研究

采用硫酸铵分级盐析、Sephadex G-25柱脱盐和Bio—gel P-10柱层析等方法,从毛蚶(Scapharca subcrenata)血浆中分离纯化出了抗菌作用较强的蛋白组分。结果表明,该抗菌蛋白组分对供试革兰氏阳性细菌即金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、枯草杆菌(Bacillus subtilis)和四联微球菌(Micrococcus tetragenus)具有较强的抑菌活性,而对供试革兰氏阴性细菌即大肠杆菌(Escherichia coli)、普通变形菌(Proteus vulgaris)和副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)无抑菌活性;对供试真菌尖镰孢(Fusarium oxysporum)、细链格孢(Alternaria tenuis)、黑曲霉(Aspergillus niger)和灰葡萄孢(Botrytis cinerea)的菌丝生长有一定的抑制作用,对柑桔青霉(Penicillium citrinum)和松球壳孢菌(Sphaeropsis sapinea)无抑菌作用。性质试验表明,该抗菌蛋白组分具有很好的热稳定性,120℃处理30min其抑菌活性仍保持85％以上,对胰蛋白酶和蛋白酶K不敏感。     

A comparative linear and nonlinear ship motion study using 3-D time domain methods

This paper reports on 3D time domain seakeeping computations at different level of modeling of nonlinear effects. Four successively improved levels of computations are considered: (i) a linear computation, (ii) Froude-Krylov nonlinear computation, (iii) body nonlinear computation where the perturbation potential is computed based on the instantaneous hull under the mean free-surface, and finally (iv) the body-exact nonlinear computation, where the perturbation potential is determined based on the wetted hull under the incident wave profile after suitable mapping of the hull into a computational domain. Computations are carried out for a Wigley hull (having less ‘geometric’ nonlinearity due to vertical sides), and a S175 hull at different forward speeds. The results are obtained for both regular and irregular waves.     

单点系泊FPSO气隙预报的时域和频域分析

以单点系泊的FPSO为研究对象,Matlab软件为计算工具,在百年一遇的极限海况下,采用频域和时域方法对FPSO的气隙进行了数值模拟。针对频域计算结果,预报FPSO在不同浪向下的上浪危险点,并基于时域和频域计算结果,比较FPSO的气隙预报的差异。分析表明:频域方法能够用来快速预测气隙危险点的位置,但是会相对低估各个上浪分析点处的气隙高度值,而且无法考虑风标效应,频域方法无法模拟FPSO在实际环境中真实的气隙变化过程,这会高估在横浪下的FPSO的危险性。     

龙虎交战针法对膝骨关节炎大鼠丝裂原活化蛋白激酶信号通道的影响

目的：观察龙虎交战针法对膝骨关节炎家兔关节软骨组织中丝裂原活化蛋白激酶（MAPKs）信号通路蛋白表达的影响,以探讨其作用机制。方法：建立膝骨关节炎大鼠模型,随机分为正常组、模型组、普通针刺组和龙虎交战组。正常组和模型组均常规饲养,不予治疗。普通针刺组和龙虎交战组分别采用常规针刺法和龙虎交战针法治疗。对各组大鼠进行行为学评分;取大鼠膝关节软骨组织,观察其病理形态变化;采用免疫组化观察软骨组织中丝裂原活化蛋白激酶（MAPKs）信号通路中ERK、P38MAPK、JNK蛋白的表达。结果：与正常组比较,模型组大鼠行为学评分降低,JNK、ERK、P38蛋白活性的表达升高（P<0.05,P<0.01）;与模型组比较,普通针刺组、龙虎交战组大鼠行为学评分升高,JNK、ERK、P38蛋白表达降低（P<0.05,P<0.01）,且龙虎交战组优于普通针刺组（P<0.05,P<0.01）。结论：龙虎交战针法能有效地调节MAPKs信号通路中ERK、P38MAPK、JNK蛋白活性的表达,降低MAPKs活性,从而有效缓解关节疼痛,促进关节软骨修复。这可能是龙虎交战针法治疗膝骨关节炎起效的作用机制之一。     

甲壳动物JAK/STAT信号通路在免疫应答中的功能与调控机制

先天免疫是宿主抵抗病原感染的第一道防线,在病原的传播和疾病的发展过程中发挥重要的作用。甲壳动物属于无脊椎动物,仅具有先天免疫,而不具备适应性免疫,其主要依靠细胞免疫和体液免疫来实现免疫防御功能,抑制病原体增殖。JAK/STAT途径是调节无脊椎动物免疫反应的主要途径之一,本文主要从细胞因子受体(Dome)、JAK酪氨酸激酶(JAK)、信号传导及转录激活因子(STAT)、调节因子的结构、在宿主体内的表达及发挥的功能等来综述在养殖甲壳动物中JAK/STAT信号通路的研究现状。目前已在对虾、螯虾和蟹等近十种甲壳动物中报道了此通路的元件,而且各元件均具有保守的典型结构域,同类元件在不同种类甲壳生物中的结构有所差异,但是功能基本相似。这些元件均被证实通过调节JAK/STAT通路的信号转导来影响抗病能力。目前仅在凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）中鉴定出JAK/STAT信号通路的所有元件,对其他甲壳动物中剩余元件的鉴定仍有必要,并且甲壳动物JAK/STAT信号通路对其他信号通路的影响还有待深入研究。通过本文希望能为该通路在甲壳动物中调控机制研究提供理论基础和参考。     

Dynamics of ships and fenders during berthing in a time domain

When designing fixed or semi-fixed structures used for berthing ships, it is generally assumed that the entire kinetic energy of the ship is absorbed by the fender or the system of fenders. The fenders have the functions of ensuring a safe berthing both for the ships and the piers by absorbing shock loads and preventing direct contact between the berthed ship and the pier. In this study, the problem is analyzed in the stages of berthing, collision and leaving. Each of the stages is analyzed and solved in the time domain. The system is assumed to consist of three components: pier, fender and the ship. Environmental effects that simultaneously affect berthing are wave, current and wind effects. Cummins equation was assumed to be a good representation of the problem and was solved in time domain taking various factors into account. Nonlinear effects related to the instantaneous values of forces, moments and ship motions, which are time dependent, were studied by the Cummins equation and its later developments by Ogilvie. Fender forces were added to the calculation scheme by the authors. A case study for a passenger ferry operating in Izmir bay is presented.     

Hydroelastic analysis of cantilever plate in time domain

Numerical solutions for the hydroelastic problems of bodies are studied directly in the time domain using Neumann–Kelvin formulation. In the hydrodynamic part of problem, the exact initial boundary value problem is linearized using the free stream as a basis flow, replaced by the boundary integral equation applying Green theorem over the transient free surface Green function. The resultant boundary integral equation is discretized using quadrilateral elements over which the value of the potential is assumed to be constant and solved using the trapezoidal rule to integrate the memory or convolution part in time. In the structure part of the problem, the finite element method is used to solve the hydroelastic problem. The Mindlin plate as a bending element, which includes transverse shear effect and rotary inertia effect are used. The present numerical results show acceptable agreement with experimental, analytical, and other published numerical results.     

随机波浪下Truss Spar平台垂荡运动时域分析

研究Truss Spar平台在随机波浪下的垂荡运动特性。采用ITTC双参数谱,考虑绕射作用,数值计算了平台所受的随机波浪力。利用已有的水动力试验和数值模拟结果及Morison方程,估计了Truss Spar平台垂荡方向的附加质量和粘滞阻尼大小。考虑非线性阻尼和瞬时波面的影响,运用Runge-Kutta数值迭代算法,比较了不同随机波浪参数对平台运动响应的影响,特别是波浪特征周期接近垂荡固有周期时。结果表明,当波浪特征周期接近平台垂荡固有周期时,平台产生大幅垂荡运动,频域的运动分析结果比时域结果偏小。     

偏异目标海域污染物域均浓度校正及年均浓度估算方法

1 引言自20世纪50年代末以来我国开展了一系列海洋环境质量调查或监测,其中大型海洋环境调查主要包括20世纪50年代末的第一次全国海洋综合调查、20世纪70年代中期的第一次全国海洋污染基线调查、20世纪80年代初的全国海岸带及海涂资源综合调查、20世纪90年代初开展的全国海岛资源综合调查、20世纪90年代末开展的第二次全国海洋污染基线调查以及2006年开展的我国近海海洋综合调查与评价等[1-3].     

深海热液区管状蠕虫Ridgeia piscesae中Ricin B-lectin型结构域基因的克隆与表达

作为一种重要的模式识别因子,凝集素在多个领域中均有着广泛的应用价值,因此,开发和利用新型凝集素将具有重要意义.本研究以生活在深海热液区极端环境条件下的管状蠕虫Ridgeia piscesae为材料,首次从管状蠕虫中克隆获得Ricin B-lectin基因rgal.序列分析表明,RGAL与已知序列的相似性较低,其含有2个Ricin B-lectin型结构域,并且该结构域具有该家族所特有的β-三叶草形三维结构.多方面的分析结果显示RGAL可能是一个新颖的凝集素蛋白.对RGAL进行了原核重组表达,并对其复性条件进行了摸索优化,成功获得了其可溶性表达产物,为后续RGAL的生物活性分析奠定了坚实的基础.     

A study on dynamical features of air-sea coupling waves in the tropics

The dynamical features of air-sea coupling waves and their stabilities in a simple coupled air-sea model in the tropics have been studied with respect to interaction occurring among different types of the free waves in the o-cean and in the atmosphere. It is pointed out that there exist a stable and an unstable air-sea interaction modes in the tropical coupled system , respectively. The propagation of the unstable mode relies greatly on the zonal space scale, i. e. only for wave length ranging from 5 000 km to 10 000 km can the disturbance unstably move slowly eastward. The waves that slowly propagate unstably eastward agree well with the observational facts. Finally,it is also proposed that the interaction between Kelvin wave in one medium and Rossby wave in another medium is a necessary condition for the occurrence of destabilization of the coupled air-sea system in the tropics.