基于网络药理学探讨麻杏苡甘汤加味抗新型冠状病毒肺炎的作用机制

目的：探讨麻杏苡甘汤加味治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的分子靶标及可能的机制。方法：从TCMSP以及BATMAN-TCM数据库中按照一定规定方法挑选出麻杏苡甘汤加味的活性成分及主要分子靶标。从OMIM及GeneCards中获得COVID-19的靶点。利用Bioinformatics & Evolutionary Genomics平台获得麻杏苡甘汤加味-COVID-19的共同靶点,然后将共同目标靶点导入STRING数据库,获得蛋白质网络模型,构建“有效成分－靶标”网络,并对共同目标靶点进行GO富集分析和KEGG富集分析。结果：麻杏苡甘汤加味中有118个活性成分可能通过46个靶点发挥抗COVID-19作用,GO富集分析及KEGG富集分析显示麻杏苡甘汤加味在治疗COVID-19的过程中,主要是通过影响脂多糖、细菌源分子、金属离子作用于氧化应激、凋亡信号通路等生物过程。方中的有效活性物质主要通过AGE-RAGE、肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素（IL）-17等信号通路,影响细胞因子与配体的有效结合、磷酸酶的生成、血红素集合等有关。结论：麻杏苡甘汤加味中有118种成分具有抗COVID-19的作用,这些分子可能的作用机制为影响血管通透性及凝血组织因子基因的表达、抗病毒、抗炎,从而缓解新冠病毒所致的肺损伤以及凝血功能障碍、微小血栓形成等。     

刍议新型冠状病毒肺炎的中医药防治

新型冠状病毒肺炎为严重的急性呼吸道传染病,流行爆发于湖北省武汉市再蔓延到全国各地,具有传染性强、传遍迅速、变证复杂等特点,目前尚无特效药物。对于该病的治疗仍处于探索的阶段。从以往对SARS、H1N1、MERS等传染病的防治来看,中医药治疗有着独特的优势。充分利用中医独特诊疗方法、发挥中医药毒副作用小、取材方便等特色防治新型冠状病毒肺炎有着广阔的治疗前景和重要意义。     

从艾灸防治疫病角度浅谈新型冠状病毒肺炎的预防

艾灸防疫主要是通过艾灸消毒空气和提升人体正气的作用来达到防疫的目的,在中国有着悠久的历史。本文通过总结分析艾灸治未病和防疫病的相关历史文献,以及艾灸防疫作用机制的现代研究文献,提出预防新型冠状病毒肺炎的具体施灸穴位为神阙、气海、关元、中脘、肺俞、大椎;操作方法为依次悬灸,每穴灸5～10 min,灸后饮用100～150 ml温开水,每天1次;并总结了5条注意事项,以期为艾灸参与新型冠状病毒肺炎的预防提供参考。     

基于网络药理学探讨金银花治疗2019-nCoV感染合并心肌炎的作用机制

目的：通过网络药理学方法预测中药金银花治疗新型冠状病毒(2019-nCoV)感染合并心肌炎的潜在关键靶点和通路,为新药研发及临床应用提供参考。方法：利用TCMSP数据库和UniPort数据库检索并规范金银花的药物成分和药物靶点,GeneCards、pharmGKB等数据库得到疾病靶点,通过Venn图获得药物与疾病的交集靶点。将交集靶点上传至STRING数据库对其进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析,构建药物-活性成分-靶点-疾病网络图,对交集靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,将主要活性成分与血管紧张素转化酶II(ACE2）和新型冠状病毒3C样蛋白水解酶（SARS-CoV-2 3CL）进行分子对接。结果：获得金银花作用于2019-nCoV感染合并心肌炎的7种活性成分和50个作用靶点,涉及509个生物学进程和148条通路。其活性成分木犀草素、槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等通过调节丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、胱天蛋白酶3(CASP3)、趋化因子配体2(CCL2)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-10（IL-10）等关键靶点治疗2019-nCoV感染合并心肌炎;主要涉及蛋白质结合、酶结合、趋化因子活性等生物过程和癌症通路、糖尿病并发症晚期糖基化终产物及其受体（AGE-RAGE）信号通路、脂质与动脉粥样硬化通路、白细胞介素-17信号通路等。分子对接结果显示,其主要活性成分与SARS-CoV-2 3CL和ACE2结合度较好。结论：本研究初步证实了金银花可通过多种活性成分、多个靶点和多条通路发挥防治2019-nCoV感染合并心肌炎的作用。     

基于网络药理学探讨党参治疗2型糖尿病的作用机制

目的：基于网络药理学方法探讨党参治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在作用机制。方法：通过中药系统药理学分析平台数据库（TCMSP）及OMIM、TTD、Drugbank等网络数据库分别获取药物有效成分、活性靶点、疾病靶点,并取药物成分和疾病的交集靶点,构建药物活性成分与关键靶点网络、蛋白质相互作用（PPI）网络,并对靶蛋白进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果：得到药效活性成分21种,药物靶点108个,T2DM靶点2402个,两者匹配映射得到关键靶点28个。党参治疗T2DM的主要成分为木樨草素、7-甲氧基-2-甲基-异黄酮、豆甾醇、黄豆黄素等,关键靶点为白细胞介素-6（IL-6）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、过氧化物酶体增殖物激活受体r（PPARG）等,关键的生物学进程包括药物反应、葡萄糖稳态;关键通路为PI3K-Akt 信号通路、AMPK信号通路、FoxO信号通路、胰岛素抵抗。结论：党参治疗T2DM具有多成分、多靶点、多途径的特点。     

基于网络药理学探讨参芪复方治疗2型糖尿病的作用机制

目的：运用网络药理学方法探讨参芪复方治疗2型糖尿病（T2DM）的作用靶点及机制。方法：采用TCMSP平台筛选出参芪复方8味中药的活性成分及成分相关靶点,运用GeneCards、OMIM数据库筛选出与T2DM相关的疾病靶点,成分靶点与疾病靶点的交集基因即为参芪复方治疗T2DM的潜在作用靶点。通过STRING数据库和Cytoscape 3.7.2 软件构建可视化网络并寻找核心作用靶点,利用DAVID数据库对核心靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选出参芪复方药物活性成分152种及成分相关靶点218个,T2DM的相关靶点12648个,成分与疾病的交集靶点共210个,其中AKT丝氨酸/苏氨酸激酶1（AKT1）、肿瘤蛋白P53（TP53）、白细胞介素6（IL-6）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）等可能是参芪复方发挥效应的关键靶点;GO功能分析共涉及255个条目,主要涉及细胞核、RNA转录、DNA等,KEGG通路分析共涉及96条通路,主要包括核因子激活的B细胞的κ-轻链增强（NF-κB）信号通路、环磷酸腺苷（cAMP）信号通路、雷帕霉素靶蛋白（mTOR）信号通路、转化生成因子-β（TGF-β）信号通路等。结论：参芪复方可能通过多种活性成分介导多靶点、多通路发挥治疗T2DM的作用。     

基于网络药理学预测青皮治疗抑郁症的作用机制

目的：运用网络药理学研究青皮治疗抑郁症的作用机制。方法：采用中药系统药理学分析平台（TCMSP）检索青皮的有效成分及其作用靶点;采用OMIM、GeneCards数据库检索抑郁症的疾病靶点;应用R语言等计算软件获取青皮有效成分的作用靶点和抑郁症疾病靶点的交集基因;运用Perl软件与Cytoscape 3.7.0软件联合构建青皮-有效成分-靶点-抑郁症调控网络;使用STRING构建PPI网络;应用DAVID数据分析软件和Metascape数据库,对所筛选出的“核心基因”进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,最终获得预测结果。结果：通过以上方法,获得青皮的5个有效成分,有效成分的基因靶点与抑郁症基因靶点的交集基因有30个。通过对青皮-有效成分-靶点-抑郁症调控网络的可视化分析,发现有效成分中的川陈皮素（nobiletin）所对应的交集基因最多。运用PPI网络预测到雌激素受体1（ESR1）、胱天蛋白酶3（CASP3）、过氧化物酶体增生激活受体γ（PPARG）等25个基因是青皮治疗抑郁症所干预的重要靶点。GO功能富集分析和KEGG富集分析结果显示,青皮有效成分在分子层面对抑郁症基因的干预有较好的作用。结论：青皮治疗抑郁症的机制主要是作用于ESR1、CASP3、PPARG等25个基因,并在分子层面起到改变抑郁症基因的转录翻译等作用。     

基于网络药理学探讨酸枣仁汤的作用机制

目的：采用网络药理学方法探讨酸枣仁汤的作用机制。方法：借助TCMSP平台预测酸枣仁汤中药成分的作用靶点与通路,利用Cytoscape软件分别构建成分-靶点网络、PPI网络,使用DIVID数据库进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。结果：经筛选获得酸枣仁汤中五味中药酸枣仁、川芎、知母、茯苓、甘草含有的135种活性成分,332个相应靶点;PPI网络包括293个节点;GO条目146个,其中生物过程为94个,分子功能条目34个,细胞组成条目18个;KEGG通路22条。结论：酸枣仁汤不仅可以用于治疗失眠、焦虑等精神系统疾病,还可以用于治疗肿瘤、循环系统等疾病,同时参与5-羟色胺、氮素代谢等生物过程,揭示了酸枣仁汤多成分、多靶点、多通路的药理作用特点。     

基于网络药理学探讨化痰祛瘀汤治疗缺血性中风的潜在作用机制

目的：基于网络药理学研究方法,探讨化痰祛瘀汤治疗缺血性中风的潜在作用机制。方法：运用TCMSP和相关文献记载检索筛选化痰祛瘀汤的主要活性化合物及相关作用靶点,通过Uniprot数据库获取作用靶点的标准名称,通过GeneCards数据库获取疾病的相关靶标,通过STRING数据库和Cytoscape 3.6.1软件构建与本病相关的核心靶点蛋白互作PPI网络。利用R语言软件对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果：根据筛选条件得到化痰祛瘀汤207个有效化合物和176个药物相应靶点,根据平均度值7.43,筛选出核心靶点48个。GO功能富集分析得到条目89条（P＜0.05）,KEGG通路富集分析得到158条通路与本病有关（P＜0.05）。化痰祛瘀汤中的活性化合物可能通过乙肝信号通路、MAPK信号通路、AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、Th17细胞分化信号通路、C型凝集素受体信号通路、内分泌抵抗信号通路、细胞凋亡信号通路、Toll样受体信号通路等途径作用于JUN、MAPK3、MAPK1、TNF、IL6、AKT1、ESR1等核心靶点发挥其疗效。结论：化痰祛瘀汤与缺血性中风发病过程中的炎症反应、动脉粥样硬化、神经细胞凋亡、免疫反应等生物过程具有潜在的关联性与治疗作用。本研究为本药的临床应用及后续的效应机制研究提供了一定的理论基础。     

基于网络药理学和分子对接研究半夏泻心汤治疗反流性食管炎的潜在分子机制

目的：通过网络药理学方法结合分子对接技术研究半夏泻心汤治疗反流性食管炎（RE）的潜在有效成分及分子作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）查找半夏泻心汤活性成分和药物潜在靶点。基于GeneCards、OMIM、DrugBank和TTD数据库获取RE疾病靶点,使用R语言4.0.4得到药物和疾病的交集靶点。采用Cytoscape 3.8.0分析软件筛选并构建“中药-活性成分-靶点”网络,结合STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作网络分析,使用R软件进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。利用AutoDock Vina 1.1.2对关键活性成分与作用靶点进行分子对接验证。结果：半夏泻心汤治疗RE共收集到162个活性化学成分和151个靶点,Cytoscape 3.8.0软件筛选出Jun激酶（JUN）、信号传导与转录激活因子3（STAT3）、MYC基因（MYC）、丝裂原活化蛋白激酶3（MAPK3）、肿瘤蛋白p53（TP53）、丝裂原活化蛋白激酶14（MAPK14）、蛋白激酶（AKT1）、丝裂原活化蛋白激酶8（MAPK8）、核转录因子-κB/p65（RELA）、丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）、肿瘤坏死因子（TNF）、细胞周期蛋白D1（CCND1）等核心靶点和槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、柚皮素、黄芩素等关键活性成分。GO富集条目2740个,包括2470个生物过程、84个细胞组成和186个分子功能;KEGG通路富集得到糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物-晚期糖基化终产物受体、白细胞介素17、TNF、p53和缺氧诱导因子-1等信号通路。分子对接结果显示半夏泻心汤的关键活性成分可以对JUN、STAT3、MYC、MAPK3、TP53、MAPK14、AKT1、MAPK8等核心靶点产生调控作用。结论：半夏泻心汤可以通过多成分、多靶点、多通路治疗RE,为半夏泻心汤治疗RE作用机制的进一步阐明提供了指引。     

基于网络药理学及分子对接探讨银地消庀汤治疗银屑病的潜在机制

目的：运用网络药理学及分子对接方法探究银地消庀汤治疗银屑病的潜在机制。方法：通过TCMSP平台、GeneCards等数据库获得银地消庀汤的活性成分、药物靶点、疾病靶点,将药物靶点、疾病靶点取交集获得共同靶点,构建“药物-活性成分-共同靶点”网络及蛋白质-蛋白质相互作用网络,并进行基因本体功能和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。结果：银地消庀汤包含槲皮素、山柰酚、木犀草素等248种活性成分,涉及219个共同靶点,富集分析主要涉及调节脂质与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子信号通路、白细胞介素-17信号通路。结论：银地消庀汤治疗银屑病的潜在药理学机制及其活性化合物可能与脂质代谢、免疫调节、炎症诱导等多途径协同调节有关。     

基于网络药理学研究肝复方治疗肝癌的分子机制

目的：基于网络药理学方法,探究肝复方有效活性物质治疗肝癌的相关作用靶点及潜在分子机制。方法：通过检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及国内外文献筛选出肝复方药味中的化合物以及相关靶点蛋白。通过GeneCards数据库获取肝癌相关疾病靶点。运用Cytoscape 3.2.1软件构建“药物-有效成分-靶点”网络、蛋白相互作用（PPI）网络,并通过网络拓扑分析筛选出核心靶点。最后,通过DAVID进行基因本体（GO）和KEGG信号通路富集分析。结果：通过口服生物利用度（OB）≥30%,类药性（DL）≥0.18的筛选获得有效成分104种,药物对应的靶点1135个,肝癌相关靶点16490个;豆甾醇、人参皂苷、β-谷甾醇为主要核心成分;白细胞介素6（IL-6）、表皮生长因子受体（EGFR）、胱天蛋白酶3（CASP3）为关键靶点。结论：肝复方治疗肝癌具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,其作用机制可能是通过IL-6、血管内皮生长因子（VEGF）A、EGFR、CASP3等核心靶点来调节,涉及VEGF、PI3K-Akt与p53等相关信号通路。本研究应用网络药理学预测肝复方治疗肝癌的分子机制,为其临床应用提供了理论依据。     

基于数据挖掘和网络药理学的冠心病中医用药研究

目的：对冠心病中医病案进行用药规律的挖掘分析,运用网络药理学阐释作用机制。方法：运用Excel表格及Python软件将中国知网、万方数据及维普中文科技期刊数据库中收集的343 例冠心病临床病案的证素以及用药进行频数统计、权值计算,获得核心中药。通过检索TCMSP、UniProt、TTD、Genecards、OMIM、DRUGEBANK等数据库,获得核心药物的活性成分、潜在作用靶点及冠心病相关的作用靶点。将药物与疾病的交集基因导入STRING平台构建PPI网络图,运用Cytoscape 3.9.0对图形进行修改并运用插件MCODE分析潜在蛋白质功能模块。将交集基因导入DAVID平台进行GO与KEGG富集分析,运用R语言对结果进行可视化展示。结果：通过数据挖掘发现治疗冠心病的潜在药对“丹参-郁金”。网络药理学分析发现,“丹参-郁金”包含柚皮素、隐丹参酮、黄芩苷、β-谷甾醇、木犀草素等在内的20个主要化合物和148个潜在靶基因,与筛选的4027个冠心病靶基因共有120个交集基因。对120个交集基因的GO富集分析发现566个生物进程,71个细胞组分,80个分子功能,KEGG富集分析得到108条信号通路。结论：“丹参-郁金”主要通过调控PI3K-Akt、HIF-1、FoxO、TNF、NF-κB和MAPK等信号通路诱导的炎症反应、细胞凋亡、细胞增殖、氧化应激等病理过程对冠心病起到治疗作用。     

基于网络药理学探讨青风藤治疗糖尿病肾病的作用机制

目的：运用网络药理学对青风藤治疗糖尿病肾病（DN）的作用机制进行研究。方法：通过TCMSP数据库筛查出青风藤的活性成分以及作用靶点,并在TTD、DrugBank、DisGeNet数据库中共同筛选出DN的基因靶点,通过Venny 2.1.0得出青风藤和DN基因靶点的交集,运用STRING 11.0数据库和Cytoscape 3.8.2软件制作蛋白互作网络图,运用Web Gestal数据库对相应基因靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。结果：共筛选出6种有效活性成分,潜在靶点蛋白58个,其中治疗DN有效活性成分4种,潜在作用靶点18个。GO功能以及KEGG通路富集分析发现,青风藤治疗DN与凋亡通路、AGE-RAGE信号通路相关,并通过调控这些通路降低尿蛋白的产生、保护细胞组织、延缓肾小球纤维化及肾脏硬化。结论：青风藤可以通过多靶点、多通路的协同作用,延缓DN的进展,可为临床用药提供依据。     

基于网络药理学探讨芎芷地龙汤治疗偏头痛的作用机制

目的：分析芎芷地龙汤的活性成分,预测其治疗偏头痛的作用靶点及信号通路。方法：通过TCMSP平台收集芎芷地龙汤活性成分并进行ADME筛选,收集活性成分潜在靶点;通过GeneCards数据库收集偏头痛的相关疾病靶点,并与药物活性成分靶点取交集得到共同靶点,进行PPI分析;使用Cytoscape构建“药物-靶点-疾病”网络并进行分析,通过DAVID数据库对共同靶点进行GO富集与KEGG富集分析。结果：共筛选出芎芷地龙汤85个潜在活性成分和145个潜在治疗靶点;芎芷地龙汤治疗偏头痛关键靶点为JUN、TNF、MAPK1、AKT1、RELA等;可能参与的通路有Pathway in cancer通路、HIF-1信号、TNF信号通路、TLR信号通路、神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、T细胞受体信号通路等。结论：槲皮素、β-谷甾醇等是芎芷地龙汤中的主要活性成分;TNF、MAPK1、AKT1等基因可能在治疗偏头痛时参与调控;芎芷地龙汤主要通过调节氧化应激反应、低氧反应、炎性因子释放、神经递质传递、血管张力等机制治疗偏头痛。     

基于网络药理学探讨抗病毒颗粒治疗呼吸道感染的作用机制

目的：通过网络药理学探讨抗病毒颗粒治疗呼吸道感染的作用靶点及信号通路,并阐述其作用机制。方法：运用TCMSP、TCMID及BATMAN-TCM数据库筛选抗病毒颗粒中中药的主要化学成分及作用靶点,通过UniProt和PubMed等数据库查询靶点对应的基因,使用DisGeNET数据库获取呼吸道感染相关靶点基因,运用Cytoscape 3.7.2软件构建药材-化合物-靶点（基因）-疾病网络,采用STRING数据库创建蛋白相互作用核心网络（PPI）,再通过DAVID数据库进行GO和KEGG分析。结果：抗病毒颗粒中有槲皮素、木犀草素、汉黄芩素、山柰酚等89个活性成分,作用在PTGS2、TNF、AKT1、NOS2、IL-6等靶点蛋白上,通过肿瘤坏死因子（TNF）、核转录因子κB（NF-κB）、低氧诱导因子1（HIF-1）等信号通路发挥抗病毒的治疗作用。结论：抗病毒颗粒治疗呼吸道感染的作用机制可能与其活性化合物通过多靶点、多通路发挥抗病毒、抗炎、免疫调节等作用有关,这为进一步探讨其作用的物质基础以及作用机制提供了参考。