基于网络药理学和免疫浸润探讨荜茇抗血吸虫病相关肝细胞癌的作用机制

目的：通过网络药理学和免疫浸润探讨中药荜茇抗血吸虫病相关肝细胞癌的作用机制。方法：通过TCMSP、TCMIP数据库查找荜茇主要化学成分及其作用靶点;通过GeneCards、OMIM、TTD数据库收集血吸虫病及肝细胞癌相关靶点,构建“药物-成分-靶点”和“成分-靶点-通路”网络图,对药物和疾病的交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析;通过R语言对交集靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;通过GEPIA和UALCAN数据库对潜在靶点进行表达差异及生存预后分析;通过TIMER数据库对核心靶点进行免疫浸润分析。结果：获得荜茇抗血吸虫病及肝细胞癌潜在靶点11个,其中肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-1β（IL-1β）、白细胞介素-6（IL-6）、白细胞介素-10（IL-10）、环加氧酶2（PTGS2）等可能是荜茇发挥作用的潜在靶点;KEGG通路富集主要涉及肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、C型凝集素受体信号通路等,生物信息学结果表明葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G6PD）可能在荜茇治疗血吸虫病相关肝细胞癌过程中发挥重要作用。结论：本研究初步预测了荜茇抗血吸虫病相关肝细胞癌的分子机制,为进一步深入研究及临床应用提供了理论依据。     

基于数据挖掘、网络药理学和分子对接研究中药治疗消化性溃疡的作用机制

目的：研究中药治疗消化性溃疡（PU）的作用机制。方法：检索2020年版《中华人民共和国药典》与药智数据库中中药治疗PU的处方,利用Spss Modeler进行数据挖掘得到核心药物。从TCMSP数据库中获取核心中药的主要活性成分及作用靶点,GeneCards、OMIM、DrugBank、DisGenet数据库中获取疾病靶点,取交集靶点。对交集靶点进行可视化分析,筛选后得到核心靶点与核心成分,并进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析和分子对接。结果：获得甘草、延胡索、白芍、白及、党参5味核心药物,药物聚为 3 类,核心活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、柚皮素、柱头甾醇,核心靶点为环加氧酶（PTGS2）、表皮细胞因子（EGF）、表皮生长因子受体（EGFR）、白细胞介素-6（IL-6）、胱天蛋白酶（CASP3）等16个。获得603条GO条目,主要涉及氧化应激反应、蛋白磷酸化、泛素蛋白连接酶等。KEGG富集条目共 118 条通路,核心靶点主要富集在肿瘤坏死因子、白细胞介素-17(IL-17)等信号通路。结论：5味中药治疗PU可能是通过调控PTGS2、EGF等靶点及TNF、IL-17、MAPK、HIF-1等通路的表达来实现。     

基于网络药理学探究补阳还五汤治疗颈椎病的作用机制

目的：基于网络药理学与分子对接技术分析补阳还五汤治疗颈椎病的作用机制。方法：使用TCMSP、化学专业数据库获取补阳还五汤的活性成分,并对潜在靶点进行预测及规范。分别从PharmGKB、DisGeNET、OMIM、GeneCards数据库中得到颈椎病疾病靶点,利用韦恩图获取补阳还五汤与颈椎病的交集靶点。通过CytoScape软件构建中药-活性成分-疾病靶点和蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,获得核心有效成分与关键靶点,利用David数据库对潜在靶点进行富集分析。最后运用AutoDock Vina软件对补阳还五汤核心有效成分与关键靶点进行分子对接验证。结果：共获得补阳还五汤治疗颈椎病的有效活性成分97个,包括槲皮素、山柰酚、黄芩素、木犀草素等;交集靶点64个,关键靶点有白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、白细胞介素-1B（IL-1B）等;主要涉及肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-17（IL-17）、磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）/蛋白激酶B（Akt）等信号通路,分子对接结果显示核心有效成分与关键靶点之间结合紧密,为补阳还五汤治疗颈椎病提供相应条件。结论：该研究在总体上预测了补阳还五汤治疗颈椎病的活性成分、靶点和信号通路,作用途径广泛,为下一步的临床应用提供参考及思路。     

基于网络药理学与分子对接探讨肝胃百合汤治疗胃食管反流病的作用机制

目的：基于网络药理学与分子对接技术分析肝胃百合汤治疗胃食管反流病(GERD)的作用机制。方法：运用TCMSP数据库获取肝胃百合汤的活性成分及作用靶点,通过OMIM、DisGeNET、DrugBank数据库检索GERD相关靶点,确定肝胃百合汤治疗GERD的潜在靶点。利用Cytoscape软件构建“中药-有效成分-靶点”网络,筛选核心成分及关键靶点。利用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,筛选核心靶点。利用DAVID数据库进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用AutoDock软件将核心成分与关键靶点进行分子对接。结果：肝胃百合汤治疗GERD的核心成分包括槲皮素、山柰酚、木犀草素、汉黄芩素、丹参酮IIA等;重要治疗靶点包括前列腺素内过氧化物合酶2（PTGS2）、白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）等;信号通路主要涉及细胞增殖、炎症反应、癌症相关等通路。PTGS2可能是肝胃百合汤治疗GERD的重要靶点,分子对接结果显示PTGS2与核心化合物具有较强结合能力。结论：肝胃百合汤可能通过多成分、多靶点、多通路作用于GERD,其中的核心靶点、先导化合物及通路为进一步研究其治疗机制提供了思路与依据。     

基于网络药理学和分子对接法探讨乙字汤治疗

目的：应用网络药理学和分子对接法探究乙字汤治疗痔病的活性成分和作用机制。方法：利用Pubchem和TCMSP数据库筛选乙字汤的有效活性成分并预测作用靶点,通过Genecards数据库获取痔病相关的疾病靶点,并用UniProt数据库标准化蛋白名称。取药物疾病共同靶点,以STRING平台进行蛋白互作（PPI）,借助Cytoscape3.8.0软件进行可视化分析,并构建中药-成分-靶点网络。利用Metascape数据库对交集基因进行KEGG通路分析和GO富集分析。使用Auto Dock 4对度值较高的药物成分与核心靶点进行分子对接验证,并借助Pymol和Lig Plot 2.2进行可视化分析。结果：乙字汤治疗痔病的活性成分126个,潜在靶点53个,以白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）、基质金属蛋白酶9（MMP9）、血管内皮生长因子A（VEGFA）等为核心靶点,主要通过IL-17、核因子-kappa B、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路治疗痔病。分子对接结果显示主要活性成分与核心靶点均有较好的结合活性。结论：乙字汤的主要活性成分通过调节IL-6、TNF、MMP9、VEGFA等多种细胞因子治疗痔病。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨瓜蒌薤白桂枝汤加减防治心绞痛的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接技术探讨瓜蒌薤白桂枝汤加减防治心绞痛（AP）的作用机制。方法：采用TCMSP数据库获取瓜蒌薤白桂枝汤加减的活性成分及靶点,并通过文献检索进行补充。采用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点网络模型。采用DrugBank、GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库筛选AP的关键靶点,与药物成分靶点取交集获取潜在基因作用靶点。使用软件的拓扑分析插件筛选核心成分与作用靶点。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。对成分-疾病交集靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。基于Autodock软件将核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果：共筛选到300个活性成分靶点,获取疾病靶点1216个,取交集获得潜在基因作用靶点124个,筛选出核心靶点30个,对应100个核心药物成分,发挥作用的核心成分为槲皮素、山柰酚等,核心靶点为肿瘤细胞坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（Akt1）、前列腺素G/H合酶2(PTGS2）等。富集分析推测瓜蒌薤白桂枝汤加减主要经过癌症调节、脂质与动脉粥样硬化通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路等20条相关通路发挥作用。分子对接结果显示瓜蒌薤白桂枝汤加减中槲皮素、山柰酚与TNF、Akt1结合性较好。结论：瓜蒌薤白桂枝汤加减可能通过核心成分槲皮素与山柰酚、核心靶点TNF、Akt1,经由脂质与动脉粥样硬化信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路发挥防治AP的作用。     

葛根芩连汤异病同治牙周炎与溃疡性结肠炎的网络药理学及分子对接研究

目的：运用网络药理学及分子对接技术探讨葛根芩连汤异病同治牙周炎和溃疡性结肠炎的作用机制。方法 ：通过TCMSP数据库挖掘葛根芩连汤化学成分及作用靶点;利用GeneCards、DisGeNET、OMIM数据库获取两种疾病靶点,对上述预测所得活性成分作用靶点及疾病相关靶点利用微生信绘图工具绘制Venn图取交集,获得药物与疾病共同作用靶点;基于Cytoscape 3.9.1软件构建药物-成分-靶点网络,利用STRING数据库分析共有靶点,建立蛋白互作网络（PPI）并进行可视化分析,在DAVID数据库对共有靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用AutoDock Tools软件对药物核心成分及关键靶点进行分子对接。结果：葛根芩连汤通过槲皮素、β-谷甾醇等核心成分作用于肿瘤坏死因子（TNF）、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、白细胞介素-6（IL-6）、白细胞介素-1β（IL-1β）、血管内皮生长因子A（VEGFA）等关键靶点,发挥抗氧化应激、抗细胞凋亡、调节糖脂代谢作用,涉及晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、癌症通路等;分子对接结果显示药物核心成分与关键靶点有良好的对接活性。结论：葛根芩连汤通过多靶点、多途径异病同治牙周炎和溃疡性结肠炎。     

基于网络药理学探讨赤芍抗血吸虫病及肝纤维化的作用机制

目的：通过网络药理学方法探讨赤芍有效成分治疗血吸虫病及肝纤维化的潜在作用机制。方法：通过TCMSP数据库检索并收集赤芍有效成分及其对应的作用靶点,借助UniProt数据库将靶点蛋白的genename转换为genesymbol;通过GeneCards、OMIM、TTD疾病数据库搜集血吸虫病及肝纤维化相关靶点;将赤芍成分靶点和疾病靶点取交集,获得赤芍治疗血吸虫病及肝纤维化的潜在靶点,利用Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”和“成分-靶点-通路”网络;通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析,采用Cytoscape 3.8.2软件进行分析和可视化呈现;通过Metascape数据库进行基因本体（GO）功能、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选得到赤芍活性成分29种,成分靶点与血吸虫病及肝纤维化疾病的交集靶点19个,其中肿瘤抑制蛋白（TP53）、前列腺素内过氧化物合酶（PTGS2）、肿瘤坏死因子（TNF）、基质金属蛋白酶9（MMP9）、白细胞介素-6（IL-6）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、白细胞介素8（IL-8）、缺氧诱导因子1A（HIF1A）、转化生长因子B1（TGFB1）、基质金属蛋白酶2（MMP2）为核心靶点,涉及的主要信号通路为癌症信号通路、乙型肝炎、糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体（AGE-RAGE）信号通路、动脉粥样硬化。结论：本研究初步预测了赤芍抗血吸虫病及肝纤维化的作用机制,可为今后药效物质基础研究提供参考。     

基于网络药理学和分子对接探析养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接技术探析养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病的作用机制。方法：应用TCMSP、Herb、TCMID平台检索养心活血通脉汤成分及作用靶点;经GeneCards、OMIM、DisGeNET平台获取稳定性冠心病靶点;运用Cytoscape 3.9.1建立“药物-活性成分-靶点”网络及蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,筛选核心靶点。由Metascape平台进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用Auto Dock Tools软件进行有效成分与和核心靶点分子对接。结果：养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病主要成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、芒柄花黄素、黄芩素、丹参酮ⅡA,关键靶点为肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）、丝氨酸/苏氨酸激酶1（AKT1）、白细胞介素-1β（IL-1β）、血管内皮生长因子（VEGFA）,关键通路为脂质和动脉粥样硬化（Lipid and atherosclerosis）、磷脂酰肌醇3激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1信号通路（PI3K-Akt信号通路）、肿瘤坏死因子信号通路（TNF信号通路）、丝裂原活化蛋白激酶信号通路（MAPK信号通路）、糖基化终产物/受体信号通路（AGE-RAGE信号通路）等。分子对接结果显示各有效成分与各核心靶点结合活性较好。结论：养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病作用机制主要为降脂、抗动脉粥样硬化、抗炎、抗心肌损伤。     

基于网络药理学探讨金银花治疗2019-nCoV感染合并心肌炎的作用机制

目的：通过网络药理学方法预测中药金银花治疗新型冠状病毒(2019-nCoV)感染合并心肌炎的潜在关键靶点和通路,为新药研发及临床应用提供参考。方法：利用TCMSP数据库和UniPort数据库检索并规范金银花的药物成分和药物靶点,GeneCards、pharmGKB等数据库得到疾病靶点,通过Venn图获得药物与疾病的交集靶点。将交集靶点上传至STRING数据库对其进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析,构建药物-活性成分-靶点-疾病网络图,对交集靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,将主要活性成分与血管紧张素转化酶II(ACE2）和新型冠状病毒3C样蛋白水解酶（SARS-CoV-2 3CL）进行分子对接。结果：获得金银花作用于2019-nCoV感染合并心肌炎的7种活性成分和50个作用靶点,涉及509个生物学进程和148条通路。其活性成分木犀草素、槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等通过调节丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、胱天蛋白酶3(CASP3)、趋化因子配体2(CCL2)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-10（IL-10）等关键靶点治疗2019-nCoV感染合并心肌炎;主要涉及蛋白质结合、酶结合、趋化因子活性等生物过程和癌症通路、糖尿病并发症晚期糖基化终产物及其受体（AGE-RAGE）信号通路、脂质与动脉粥样硬化通路、白细胞介素-17信号通路等。分子对接结果显示,其主要活性成分与SARS-CoV-2 3CL和ACE2结合度较好。结论：本研究初步证实了金银花可通过多种活性成分、多个靶点和多条通路发挥防治2019-nCoV感染合并心肌炎的作用。     

基于网络药理学和分子对接分析消炎利胆片治疗慢性胆囊炎的作用机制

目的：通过网络药理学方法预测消炎利胆片治疗慢性胆囊炎的核心有效成分和靶点,并通过分子对接初步验证结果的稳健性。方法：利用TCMSP、CancerHSP、BATMAN-TCM数据库检索消炎利胆片有效成分及对应靶点,借助UniProt数据库对靶点进行规范化。通过GeneCards、DisGeNET和OMIM数据库检索慢性胆囊炎相关靶点。运用R软件筛选药物与疾病交集靶点;分别通过Bioconductor平台、STRING数据库对交集靶点进行富集分析和蛋白相互作用分析。通过Cytoscape软件筛选出核心有效成分和靶点,将核心有效成分与核心靶点进行分子对接评估结合活性以验证结果稳健性。结果：共获得23种有效成分,对应190个药物作用靶点,从数据库中获取723个疾病相关靶点,药物与疾病之间有48个交集基因;富集结果显示多与细胞对炎症反应相关,筛选得到槲皮素、汉黄芩素、非瑟酮等核心有效成分,白细胞介素-1β(IL-1β)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等核心靶点;分子对接结果显示核心有效成分与核心靶点之间均有较好的结合活性。结论：消炎利胆片中的槲皮素、汉黄芩素、非瑟酮等核心有效成分可能通过参与调控炎症相关信号通路作用于IL-1β、MMP9、VEGFA等核心靶点,从而发挥治疗慢性胆囊炎的作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨十味温胆汤治疗心绞痛的作用机制

目的：采用网络药理学及分子模拟对接的研究方法探讨十味温胆汤治疗心绞痛的潜在作用机制。方法：通过TCMSP、TCMID数据库获取十味温胆汤组方（半夏、陈皮、茯苓、黄芪、人参、熟地黄、酸枣仁、五味子、远志、枳实）的有效成分及对应的靶蛋白;使用GeneCard、OMIM数据库筛选出与心绞痛密切相关的作用靶点。运用CytoScape软件构建中药-组分-靶点网络图,运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图。利用R软件对中药-疾病交集靶点进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果:十味温胆汤治疗心绞痛的核心药物成分是柚皮素、山柰酚、β-谷甾醇、槲皮素、川陈皮素等;核心靶点有肿瘤坏死因子(TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-1β(IL-1β)等;十味温胆汤主要通过晚期糖基化终产物受体（AGE-RAGE）、脂质代谢、流体剪切应力、前列腺癌、乙型肝炎等信号通路来治疗心绞痛;分子模拟对接结果显示,十味温胆汤中槲皮素、山柰酚与Akt1、TNF均能实现较好的结合。结论：十味温胆汤可能通过调控细胞增殖与凋亡、血管生成、炎症反应、抗氧化应激等作用协同治疗心绞痛。     

基于网络药理学和分子对接技术研究黄芪-白花蛇舌草治疗非小细胞肺癌的作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术,探讨黄芪-白花蛇舌草抗非小细胞肺癌（NSCLC）的潜在活性成分和作用机制。方法：利用TCMSP和Uniprot数据库获取黄芪-白花蛇舌草的主要活性成分及靶点基因;GeneCards、OMIM数据库获取NSCLC靶点基因;绘制韦恩图得到疾病和活性成分共同靶点;STRING数据库构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;Cytoscape 3.9.1软件绘制成分-靶点网络图,通过网络拓扑分析筛选出关键靶点及成分;DAVID数据库及Bioinformatics平台进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;PyMol软件和AotoDock软件绘制相应的分子对接图。结果：经筛选共得到653个黄芪-白花蛇舌草活性成分靶点和6178个疾病靶点,两者交集靶点154个。GO功能富集到747个生物过程、83个分子功能和150个细胞组分,KEGG通路富集分析得到167条信号通路。分子对接结果显示,PTGS1蛋白与活性成分槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素均结合稳定。结论：黄芪-白花蛇舌草可能通过槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素等成分,PTGS1、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶（AKT1）、白细胞介素-6（IL-6）等靶点,丝裂原激活的蛋白激酶（MAPK）、磷脂酰肌醇3 激酶-蛋白激酶 B（PI3K-Akt）等信号通路治疗NSCLC,初步预测了黄芪-白花蛇舌草对NSCLC的作用机制,为深入揭示其治疗NSCLC的分子机制提供了理论基础。     

基于网络药理学探讨凉血五花汤加味治疗玫瑰痤疮的作用机制

目的：基于网络药理学探讨凉血五花汤加味治疗玫瑰痤疮的作用机制。方法：通过TCMSP获取凉血五花汤加味的有效活性成分及其对应靶点,从GeneCards、DrugBank、OMIM、TTD数据库检索玫瑰痤疮靶点,运用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点网络图,借用STRING数据库构建药物和疾病交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,通过DAVID数据库与微生信在线生物信息学分析可视化云平台对核心靶点基因进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：从凉血五花汤加味中筛选出42个活性成分,关键成分包括槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-胡萝卜素、青蒿素等,预测靶点222个,药物疾病共同靶点45个,核心靶点为白细胞介素-6（IL-6）、表皮生长因子受体（EGFR）、肿瘤坏死因子（TNF）、半胱氨酸蛋白酶-3（CASP3）、基质金属蛋白酶-9（MMP9）等;GO功能和KEGG通路富集分析筛选出114条信号通路,主要涉及TNF、白细胞介素-17（IL-17）、高级糖基化终末产物-受体（AGE-RAGE）、NOD样受体（NLR）信号通路等。结论：凉血五花汤加味可能基于多成分、多靶点、多通路的特点,相互协同发挥对玫瑰痤疮的治疗作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨麻黄附子细辛汤合肾四味汤治疗变应性鼻炎的作用机制

目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨麻黄附子细辛汤合肾四味汤治疗变应性鼻炎(AR)的作用机制。方法：利用TCMSP数据库,获取并筛选麻黄附子细辛汤合肾四味汤的活性成分和潜在靶点;通过多个数据库挖掘AR的相关靶点,并与麻黄附子细辛汤合肾四味汤的潜在靶点取交集,获得麻黄附子细辛汤合肾四味汤治疗AR的核心靶点,同时进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络构建,利用R语言对核心靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;采用分子对接技术将主要活性成分与核心靶点进行分子对接。结果：麻黄附子细辛汤合肾四味汤中的67个有效成分可以通过白细胞介素-17受体通路、Toll样受体通路、低氧诱导因子受体通路（HIF-1 Signaling Pathway）等多种受体通路治疗AR。分子对接结果显示槲皮素与基质金属蛋白酶9（MMP9）、木犀草素与白细胞介素-6大分子蛋白有良好的结合性。结论：麻黄附子细辛汤合肾四味汤可以从多靶点、多通路治疗AR,为后续研究提供了新的方向。     

基于网络药理学与分子对接探讨青风藤干预膝骨关节炎的作用机制

目的：应用网络药理学与分子对接技术探讨青风藤治疗膝骨关节炎（KOA）的作用机制。方法：从TCMSP数据库中提取青风藤的化学成分,获得药物靶点及疾病相关基因,筛选交集靶点,获得青风藤治疗 KOA 的作用靶点。对交集靶点及相关信号通路利用数据库进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。通过分子对接平台进行分子对接。结果：获得青风藤化合物主要化学成分6种、疾病基因643个、药物与疾病交集靶点11个。网络分析结果显示,青风藤通过调控肿瘤信号通路、糖尿病并发症中的糖基化终末产及其受体信号通路（AGE-RAGE）、细胞凋亡信号通路、肿瘤抑制蛋白p53 信号通路（p53）、血清素突触信号通路等作用于前列腺素 G/H 合酶 1（PTGS1）、前列腺素-内过氧化物酶合酶 2（PTGS2）、过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARG）、B淋巴细胞瘤-2（Bcl-2）、转化生长因子β-1前蛋白（TGFB1）、胱天蛋白酶3（CASP3）等关键靶点,通过干预细胞凋亡、抑制炎症等发挥治疗KOA的作用。分子对接结果显示,青风藤核心成分β-谷甾醇（beta-sitosterol）、青藤碱（Sinomenine）与核心靶点结合高度稳定。结论：青风藤治疗KOA是多通路、多靶点共同作用的结果,其作用机制与细胞凋亡、炎症关系最为密切。     

基于网络药理学与分子对接探讨六味地黄丸治疗肾阴亏虚型老年性便秘的作用机制

目的：运用网络药理学与分子对接技术探究六味地黄丸治疗肾阴亏虚型老年性便秘的作用机制。方法：通过TCMSP、TCMID、SwissTargetPrediction获取药物的活性成分并筛选,在Genecards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库检索与该疾病相关的主要靶点;运用韦恩图获取六味地黄丸与老年性便秘的交集靶点。将以上数据通过STRING获得交集靶点的蛋白网络,构建药物-活性成分-靶点及蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图,进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,并对药物有效成分和核心靶点进行分子对接验证。结果：共获得58个有效活性成分和675个对应靶点,主要有效成分有槲皮素、羟基芫花素、泽泻醇B等;药物-疾病交集靶点296个,包括丝氨酸/ 苏氨酸蛋白激酶 1 (AKT1)、肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）等。GO功能富集共有3175个条目,KEGG通路富集得到215条通路,主要有癌症通路、磷脂酰肌醇3-激酶/苏氨酸蛋白激酶信号通路、癌症中的蛋白聚糖、丝裂原活化蛋白激酶信号通路等。分子对接显示该药物主要有效成分和核心靶点蛋白有较好的结合力。结论：该研究在总体上预测了六味地黄丸治疗肾阴亏虚型老年性便秘的活性成分、靶点和信号通路,表明了其多成分-多靶点-多途径的治疗特点。     

基于网络药理学探讨鹅不食草治疗鼻咽癌的作用机制

目的：应用网络药理学与分子对接技术探讨鹅不食草治疗鼻咽癌（NPC）的作用机制。方法：从TCMSP、Batman-TCM、ETCM数据库获取鹅不食草的活性成分和作用靶点;利用OMIM、GeneCards、TTD、Pharmgkb数据库筛选NPC相关靶点;使用Venny 2.0.1平台筛选药物与疾病作用的交集靶点;采用Cytoscape 3.8.0软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络;利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;将所获得的交集靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;使用AutoDock Vina对鹅不食草的核心活性成分及NPC的关键靶点进行分子对接。结果：获得鹅不食草化学成分17种,相关靶点420个,NPC疾病相关靶点共2332个,鹅不食草-NPC交集靶点140个。鹅不食草主要活性成分包括槲皮素、豆甾醇、谷甾醇等。治疗NPC的关键靶点包括蛋白激酶 B1（AKT1）、肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）等,主要涉及凋亡等生物过程及癌症、炎症、凋亡等信号通路。分子对接结果验证了主要活性成分及核心靶点均具有较好的结合能力。结论：鹅不食草通过多成分-多靶点-多通路治疗NPC,本研究为进一步深入研究其治疗NPC的作用机制奠定了的基础。     

基于网络药理学及分子对接研究桃仁-红花治疗膝骨关节炎的作用机制

目的：基于网络药理学及分子对接技术研究桃仁-红花治疗膝骨关节炎（KOA）的作用机制。方法：采用TCMSP及Uniprot数据库收集整合桃仁、红花的活性成分及其药理作用靶点,在GeneCards数据库检索KOA的靶点基因,通过Venny获取疾病-药物交互靶点,借助STRING 数据库及Cytoscape软件构建蛋白互作网络图并上传Metascape数据库进行GO功能和 KEGG通路富集分析,最后运用 AutoDock和Pymol将核心有效成分与相应的关键靶点进行分子对接预测。结果：1）桃仁-红花有效活性成分45个,主要成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素等;2）KOA与药物的共同靶点120个,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、转录因子AP-1（JUN）、肿瘤坏死因子（TNF）、细胞肿瘤抗p53（TP53）、转录因子p65（RELA）、丝裂原激活的蛋白激酶1（MAPK1）、白细胞介素6（IL-6）、热休克蛋白（HSP90AA1）、血管内皮生长因子A （VEGFA）、丝裂原激活的蛋白激酶8（MAPK8）等为关键靶点;3）分子对接结果显示山柰酚可靶向结合AKT1、TNF;4）GO功能富集分析得出桃仁-红花治疗KOA主要涉及细胞增殖、生长因子的反应、细胞应激反应的调节、细胞死亡的正调控等生物合成过程;5）KEGG通路富集分析显示白细胞介素17（IL-17）、雌激素信号通路为桃仁-红花干预KOA的主要信号通路。结论：桃仁-红花中的槲皮素、山柰酚、木犀草素等有效成分通过AKT1、JUN、TNF、TP53、RELA、MAPK1、IL-6、HSP90AA1、VEGFA、MAPK8等关键靶点与IL-17和雌激素信号通路等主要通路发挥抗炎、调控细胞增殖、凋亡及应激反应的方式治疗KOA。     

基于网络药理学及分子对接探讨牛膝-杜仲-桑寄生治疗膝骨关节炎的作用机制

目的：利用网络药理学平台整合分析牛膝-杜仲-桑寄生治疗膝骨关节炎（KOA）的分子机制,为药组的使用提供理论依据。方法：通过TCMSP平台筛选药组有效成分及靶点,与KOA靶点取交集制作韦恩图,构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图,筛选关键成分和核心基因,对核心靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选出药组有效成分41种,作用靶点239个;主要有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、黄芩素、汉黄芩素、β-胡萝卜素等关键成分;磷酸激酶B1（AKT1）、半胱氨酸蛋白酶3（CASP3）、白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）、血管内皮生长因子（VEGF)等核心基因。关键信号通路有晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）通路、TNF通路、脂肪与动脉粥样硬化通路、磷脂酰肌醇3-激酶/磷酸激酶B（PI3K/Akt）通路等,分子对接结果显示活性成分与核心基因结合能力较强。结论：牛膝-杜仲-桑寄生药组可以通过多靶点、多通路发挥抗炎、抗氧化、调控细胞凋亡及稳定关节内环境的作用,达到治疗膝骨关节炎的目的。