| 基于16S rRNA与COI基因40种石斑鱼亚科鱼类分子系统进化关系 |
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| 引用本文： | 梁日深,陈铭,廖国威,等. 基于16S rRNA与COI基因40种石斑鱼亚科鱼类分子系统进化关系[J]. 海洋学报,2020,42(6)：9–19 doi: 10.3969/j.issn.0253-4193.2020.06.002 |
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| 作者姓名： | 梁日深 陈铭 廖国威 张卓为 张癸新 陈轶之 林蠡 |
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| 作者单位： | 1.仲恺农业工程学院 动物科技学院,广东 广州 510225;;2.广东省水环境与水产品安全工程技术研究中心,广东 广州 510225;;3.广州市水产病害与水禽养殖重点实验室,广东 广州 510225;;4.深圳市里维生鲜科技开发有限公司,广东 深圳 518052 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31802300);广东省自然科学基金(2018A0303130104);广东省重点领域研发计划项目(2019B020215001);广东省科技计划(2017A040403060)。 |
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| 摘 要： | 
本研究采集了分布在西太平洋的石斑鱼亚科10属共40种鱼类,采用PCR扩增及测序技术获得所有样品16S rRNA、COI基因部分序列,利用最大似然法构建系统进化树并分析。结果表明：40种鱼类COI基因为651 bp,编码227个氨基酸,16S rRNA基因同源序列566 bp,序列存在一定的碱基插入与缺失,各物种16S rRNA基因序列变异比COI要少,序列较为保守。
构建的系统进化树上,在本研究的石斑鱼亚科10个属中,鳃棘鲈属分类地位最原始,位于进化树基部,6种鳃棘鲈能聚成一个单系;烟鲈属与九棘鲈属关系较近,两者聚为一支,侧牙鲈属的进化地位介于鳃棘鲈属与九棘鲈属之间;石斑鱼属的进化地位最高,位于进化树顶部,形成两个平行分支,但是石斑鱼属种类未能聚成一个单系;驼背鲈属、鸢鮨属、下美鮨属、光腭鲈属及宽额鲈属均未能形成独立分支,而是与石斑鱼属种类聚在一起,显示其与石斑鱼属有很近的亲缘关系,部分可能是石斑鱼属的特化类群。
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| 关 键 词： | 石斑鱼亚科 16S rRNA COI 系统进化 |
| 收稿时间： | 2019-09-11 |
| 修稿时间： | 2019-12-02 |
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