| 斑马鱼GSTM单核苷酸多态性与低温耐受性的相关分析 |
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| 引用本文： | 王 倩,尤 锋,辛梦娇,胡金伟,谭训刚.斑马鱼GSTM单核苷酸多态性与低温耐受性的相关分析[J].海洋科学,2015,39(1):1-7. |
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| 作者姓名： | 王 倩 尤 锋 辛梦娇 胡金伟 谭训刚 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院 海洋研究所，实验海洋生物学重点实验室，山东 青岛 266071; 中国科学院大学，北京100049
2. 中国科学院 海洋研究所，实验海洋生物学重点实验室，山东 青岛 266071 |
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| 基金项目： | 国家973 计划资助项目(2010CB126304); 国家863 计划资助项目(2012AA10A408, 2012AA092203); 国家科技基础条件平台建设运行项目-水产种质资源平台运行服务(2006DKA30470017) |
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| 摘 要： | 为分析谷胱甘肽硫-转移酶M基因(glutathione S-transferases M,GSTM)与鱼类低温耐受性的相关性,本实验运用PCR-SSCP技术研究了130尾斑马鱼(Danio rerio)GSTM基因5?UTR、3?UTR和第一内含子序列的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs),同时分析了筛选到的基因型与其低温耐受性状的关联性。结果显示,在其5UTR区域检测到AB、BC、AC 3种基因型个体,共A、B、C 3个等位基因,其观测杂合度和期望杂合度分别是1.000和0.570,多态信息含量为0.472,所检测群体在该座位偏离了Hardy-Weinberg平衡;第1内含子中检测到DD、DE和EE 3种基因型个体,共D、E两个等位基因,其观测杂合度和期望杂合度分别为0.408和0.477,多态信息含量为0.362,群体在该座位符合Hardy-Weinberg平衡。3'UTR区域中没有发现多态性。上述2个SNP座位与斑马鱼低温耐受性状的关联分析结果表明,5'UTR区3种基因型与低温耐受性状均没有显著相关性(χ2=4.029,P0.05)。而第1内含子3种基因型与低温耐受性状显著相关(χ2=8.498,P0.05):DD基因型在耐低温群体中占优势(50.00%),并表现为对受低温胁迫斑马鱼的保护性因素(OR=0.520,95%CI=0.255–1.061),而DE基因型在不耐低温群体中占优势(51.31%),表现为低温胁迫下斑马鱼的危险因素(OR=3.012,95%CI=1.413–6.419)。研究结果为GSTM基因SNPs位点与斑马鱼低温耐受性能关联分析提供了依据,也将为海水经济鱼类抗寒标记筛选育种提供参考。
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| 关 键 词： | 斑马鱼(Danio rerio) GSTM PCR-SSCP SNPs 低温耐受相关 |
| 收稿时间： | 3/4/2014 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2014/5/16 0:00:00 |
Correlation analysis between polymorphisms of GSTM gene and cold-tolerance trait in zebrafish, Danio rerio |
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| WANG Qian
,
YOU Feng
,
XIN Meng-jiao
,
HU Jin-wei
,
TAN Xun-gang.Correlation analysis between polymorphisms of GSTM gene and cold-tolerance trait in zebrafish, Danio rerio[J].Marine Sciences,2015,39(1):1-7. |
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| Authors: | WANG Qian YOU Feng XIN Meng-jiao HU Jin-wei TAN Xun-gang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Danio rerio GSTM PCR-SSCP SNPs association to cold tolerance |
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