| 海洋细菌胞外蛋白酶PPC结构域序列特性与系统进化分析 |
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| 引用本文： | 黄嘉丰,刘 丹,杨兴昊,吴日帮,武翠玲,何海伦.海洋细菌胞外蛋白酶PPC结构域序列特性与系统进化分析[J].海洋科学,2015,39(1):13-23. |
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| 作者姓名： | 黄嘉丰 刘 丹 杨兴昊 吴日帮 武翠玲 何海伦 |
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| 作者单位： | 中南大学 生命科学学院 医学遗传学国家重点实验室,湖南 长沙,410013 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31370104, 31070061); 湖南省自然基金联合基金项目(13JJ9001); 国家星火计划项目(2013GA770009); 中南大学大学生创新创业训练计划项目(国家级)(201310533050) |
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| 摘 要： | PPC(Pre-Peptidase C-terminal)结构域广泛分布于分泌型海洋细菌蛋白酶的C末端,对蛋白酶的分泌,锚定及与底物相互吸附起到重要作用。对PPC结构域序列分析发现,PPC结构域存在两个较为保守序列区,且这两个保守区空间结构为β-折叠。尽管有的PPC结构域序列一致性较低,但不同结构域间存在相同的保守序列,且其三维结构相似。为了进一步对不同来源的PPC结构域的进化关系进行系统研究,本研究选取公开发表的PPC结构域,通过在NCBI数据库中搜索得到61条来自于39个细菌所分泌的不同蛋白酶的PPC的氨基酸序列进行系统发育分析。发现PPC结构域在生物进化过程中序列变异性大,保守性弱。其中,有些细菌PPC结构域可能来源于自身基因重复产生,有些细菌PPC结构域则可能由水平基因转移产生。
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| 关 键 词： | 蛋白酶 PPC结构域 保守区 系统进化树 基因水平转移 |
| 收稿时间： | 2014/5/19 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2014/7/22 0:00:00 |
Sequence characteristics and system evolution of PPC domain from marine bacterial extracellular protease |
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| HUANG Jia-feng
,
LIU Dan
,
YANG Xing-hao
,
WU Ri-bang
,
WU Cui-ling
,
HE Hai-lun.Sequence characteristics and system evolution of PPC domain from marine bacterial extracellular protease[J].Marine Sciences,2015,39(1):13-23. |
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| Authors: | HUANG Jia-feng LIU Dan YANG Xing-hao WU Ri-bang WU Cui-ling HE Hai-lun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Protease PPC domain Conservative region Phylogenetic analysis Horizonal gene transfer |
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