| 12种石鲈科鱼类线粒体16S rRNA基因的部分序列分析 |
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| 引用本文： | 任岗,章群,钱开诚,徐忠能,林小涛.12种石鲈科鱼类线粒体16S rRNA基因的部分序列分析[J].热带海洋学报,2007,26(3):48-52. |
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| 作者姓名： | 任岗 章群 钱开诚 徐忠能 林小涛 |
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| 作者单位： | 1. 暨南大学水生生物研究所,广东,广州,510632;绍兴文理学院生命科学学院,浙江,绍兴,312000
2. 暨南大学水生生物研究所,广东,广州,510632 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;广东省自然科学基金 |
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| 摘 要： | 分析了5属12种石鲈科鱼类的线粒体16S rRNA基因部分序列特征,并参照RNA二级结构模型区分配对区和非配对区。结果表明,配对区对G有偏好(33.5%),非配对区对A有偏好(38.5%);与配对区相比,非配对区存在更多的变异和系统发育信息。从序列的Jukes-Cantor遗传距离结果看,石鲈科胡椒鲷属Plectorhynchus、矶鲈属Parapristipoma、石鲈属Hapalogenys、髭鲷属Pomadasys、Haemulon属5个属属间的差异水平都接近或超过了其与外类群科间的差异水平。从构建的ME系统发育树结果看,石鲈科鱼类分成二大分支,未能形成单一类群。在亲缘关系上,胡椒鲷属和矶鲈属较近,石鲈属和Haemulon属较近,髭鲷属与其它4个属较远,髭鲷属在鲈亚目中的分类地位可能应提高到科的水平。初步确定研究中选用的16S rRNA基因片段基本适用于石鲈科属间和属内种间关系的研究。
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| 关 键 词： | 石鲈科 线粒体16S rRNA 基因 RNA二级结构 序列分析 系统发育 |
| 文章编号： | 1009-5470（2007）03-0048-05 |
| 收稿时间： | 2006-08-11 |
| 修稿时间： | 2006-08-112006-10-23 |
Sequence analysis of twelve grunt fishes based on 16S ribosomal RNA gene fragments |
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| REN Gang,ZHANG Qun,QIAN Kai-cheng,XU Zhong-neng,LIN Xiao-tao.Sequence analysis of twelve grunt fishes based on 16S ribosomal RNA gene fragments[J].Journal of Tropical Oceanography,2007,26(3):48-52. |
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| Authors: | REN Gang ZHANG Qun QIAN Kai-cheng XU Zhong-neng LIN Xiao-tao |
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| Institution: | 1. Institute of Hydrobiology, Jinan University, Guangzhang 510632, China; 2. College of Life and Science, ShaoxingUniversity, Shaoxing 312000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Haemulidae mitochondrial 16S ribosomal RNA gene RNA secondary structure sequence analysis phylogenetics |
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