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大菱鲆钙激活型钾离子通道基因TSKCa的克隆和序列分析
引用本文:韩光,丛柏林,黄晓航,刘胜浩,刘晨临,林学政.大菱鲆钙激活型钾离子通道基因TSKCa的克隆和序列分析[J].海洋科学进展,2008,26(2):207-213.
作者姓名:韩光  丛柏林  黄晓航  刘胜浩  刘晨临  林学政
作者单位:国家海洋局,第一海洋研究所,山东,青岛,266061;海洋生物活性物质国家海洋局重点实验室,山东,青岛,266061
摘    要:钙激活型钾离子通道蛋白(KCa)是位于细胞膜表面调节细胞功能的一类膜蛋白.通过设计特异性引物,以我国海水养殖大菱鲆(Scophthalmus maximus L.)血液cDNA为模板,利用RT-PCR 技术克隆获得了一条基因片段.生物信息学分析证实该片段来自钙激活型钾离子通道基因SKCa (小电导钙激活型钾通道)家族.设计巢式PCR引物,通过5′RACE和3′RACE分别克隆得到了该基因的5′端序列和3′端序列.使用生物学软件拼接3段序列得到了大菱鲆钙激活型钾离子通道TSKCa基因的全长序列.TSKCa基因cDNA全长为1 698 bp,其中开放阅读框长度为1 632 bp,编码的TSKCa蛋白有544个氨基酸.比对TSKCa蛋白与GenBank中已有的SKCa蛋白序列,证实其序列同源性很高.使用网络DAS和srsbin服务器对TSKCa蛋白进行跨膜结构预测和疏水性分析,并结合已有的研究结果推测TSKCa蛋白的结构由S1~S6六个跨膜结构域和一个孔道区(P区)组成.

关 键 词:钙激活  钾离子通道  大菱鲆  基因克隆

Cloning and Sequence Analysis of Calcium Activated Potassium Channel Gene From Turbot (Scophthalmus maximus L.)
HAN Guang,CONG Bai-lin,HUANG Xiao-hang,LIU Sheng-hao,LIU Chen-lin,LIN Xue-zheng.Cloning and Sequence Analysis of Calcium Activated Potassium Channel Gene From Turbot (Scophthalmus maximus L.)[J].Advances in Marine Science,2008,26(2):207-213.
Authors:HAN Guang  CONG Bai-lin  HUANG Xiao-hang  LIU Sheng-hao  LIU Chen-lin  LIN Xue-zheng
Abstract:
Keywords:
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