| 不同抗流能力大黄鱼(Larimichthys crocea)肌肉转录组学差异分析 |
| |
| 引用本文： | 张静静,王亚冰,王倩,韩多彩,彭士明.不同抗流能力大黄鱼(Larimichthys crocea)肌肉转录组学差异分析[J].海洋与湖沼,2023,54(5):1507-1516. |
| |
| 作者姓名： | 张静静 王亚冰 王倩 韩多彩 彭士明 |
| |
| 作者单位： | 中国水产科学研究院东海水产研究所 上海 200090;中国农业科学院研究生院 北京 100081 |
| |
| 基金项目： | 中国水产科学研究院基本科研业务费,2020XT1001号;财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系,CARS-47号;中国水产科学研究院东海水产研究所基本科研业务费,2021Z01号。 |
| |
| 摘 要： | 为揭示不同抗流能力的大黄鱼(Larimichthyscrocea)肌肉基因表达水平的变化,筛选抗流相关基因,解析大黄鱼抗流性状形成的分子基础,收集福建福鼎沙埕湾主养区1 000尾大黄鱼,在设计制作的抗流实验水槽中,以流速1.0m/s为筛选条件,将抗流时间>30 min的大黄鱼归为抗流组(HM组),抗流时间<5 min的大黄鱼归为非抗流组(SM组),对其肌肉进行转录组分析,并统计抗流分组后48 h内大黄鱼的累计死亡率。转录组结果显示, HM组与SM组文库共富集到1806个差异表达基因(DEGs),其中1090个上调,716个下调。GO功能注释发现显著富集的条目主要集中在肌肉收缩相关功能, KEGG富集分析发现上调的DEGs主要富集在心肌收缩、氧化磷酸化、黏着斑、ECM-受体相互作用、AGE-RAGE、MAPK、心肌细胞中的肾上腺素能等相关通路;下调的DEGs主要富集在真核生物核糖体的发生、蛋白酶体、内质网中的蛋白加工、RNA转运、泛素介导的蛋白水解信号通路等。此外,RT-qPCR结果表明,随机选取的DEGs与RNA-seq结果的表达趋势一致。48h的累计死亡率结果显示,SM组...
|
| 关 键 词： | 大黄鱼 抗流性状 转录组 差异表达基因 |
| 收稿时间： | 2023/2/16 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/5/21 0:00:00 |
TRANSCRIPTOME ANALYSIS OF MUSCLE TISSUE OF LARIMICHTHYS CROCEA WITH DIFFERENT FLOW RESISTANCE |
| |
| ZHANG Jing-Jing,WANG Ya-Bing,WANG Qian,HAN Duo-Cai,PENG Shi-Ming.TRANSCRIPTOME ANALYSIS OF MUSCLE TISSUE OF LARIMICHTHYS CROCEA WITH DIFFERENT FLOW RESISTANCE[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2023,54(5):1507-1516. |
| |
| Authors: | ZHANG Jing-Jing WANG Ya-Bing WANG Qian HAN Duo-Cai PENG Shi-Ming |
| |
| Institution: | East China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Shanghai 200090, China;Graduate School of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
|
| 点击此处可从《海洋与湖沼》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《海洋与湖沼》下载免费的PDF全文 |
|
