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雌、雄弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏转录组比较分析
引用本文:董忠典,黎学友,廖健,张宁,郭昱嵩,王中铎.雌、雄弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏转录组比较分析[J].海洋与湖沼,2020,51(5):1203-1213.
作者姓名:董忠典  黎学友  廖健  张宁  郭昱嵩  王中铎
作者单位:广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖重点实验室 湛江524088
基金项目:国家自然科学基金项目,41806195号,31201996号;广东省科技厅项目,2017A030303075号;广东海洋大学创新强校项目,230419069号,230419055号;广东海洋大学“南海学者计划”青年人才项目,QNXZ201903号;广东海洋大学博士启动项目,521202279号
摘    要:为发掘弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏功能基因、开发环境检测标记基因,本研究采用RNA-Seq技术分别测定了性成熟雌、雄弓背青鳉肝脏转录组,并获得80095044和87043984条clean reads,合并拼接出49912个unigenes(N50=2394bp)。基因表达差异分析显示在雌、雄弓背青鳉肝脏组织中存在571个差异基因(DEGs),其中364个在雄鱼中高表达,207个在雌鱼中高表达。GO和KEGG分析表明差异基因主要参与激素合成、免疫反应、氧化还原反应及卵黄发生等生物学过程。进一步,在转录组中筛选到了多个环境雌激素相关标记基因(vtgs,chgs,er,cyp450等),且这些基因在雌鱼肝脏中的表达水平显著高于雄鱼。研究结果丰富了弓背青鳉的基因资源,为研究基因功能提供了数据,也有助于进一步研究鱼类肝脏在不同性别之间的功能。

关 键 词:弓背青鳉  肝脏  转录组测序  差异基因  生物标志物
收稿时间:2019/12/24 0:00:00
修稿时间:2020/3/1 0:00:00

COMPARATIVE TRANSCRIPTOME ANALYSIS OF MALE AND FEMALE LIVER OF ORYZIAS CURVINOTUS
DONG Zhong-Dian,LI Xue-You,LIAO Jian,ZHANG Ning,GUO Yu-Song,WANG Zhong-Duo.COMPARATIVE TRANSCRIPTOME ANALYSIS OF MALE AND FEMALE LIVER OF ORYZIAS CURVINOTUS[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2020,51(5):1203-1213.
Authors:DONG Zhong-Dian  LI Xue-You  LIAO Jian  ZHANG Ning  GUO Yu-Song  WANG Zhong-Duo
Institution:Guangdong South China Sea Key Laboratory of Aquaculture for Aquatic Economic Animals, Fisheries College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China
Abstract:
Keywords:
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