| 逆转座子序列插入——海湾扇贝过氧化物还原酶V 第1 内含子分析 |
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| 引用本文： | 李 娟,李 莉,张国范.逆转座子序列插入——海湾扇贝过氧化物还原酶V 第1 内含子分析[J].海洋科学,2013,37(2):1-6. |
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| 作者姓名： | 李 娟 李 莉 张国范 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院 海洋研究所, 山东青岛266071
2. 中国科学院 研究生院, 北京100049 |
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| 基金项目： | 国家公益性行业(农业)科研专项(3-35); 国家自然科学基金项目(30800842); 国家高技术研究发展计划项目(863 计划, 2010AA10A401) |
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| 摘 要： | 根据海湾扇贝(Argopecten irradians)过氧化物还原酶V(AiPrxV)的cDNA序列和部分基因组DNA序列设计引物,采用基因组步移方法扩增获得其第1内含子(I1)完整序列,并通过Blast比对、DNAMAN和RepFind搜索进行序列分析。AiPrxV I1长8 565bp,占AiPrxV基因全长的68%,AT%显著高于GC%。在5 900-6 700bp的区域中包含了不完整的编码区,经分析与文昌鱼、海胆的逆转录酶有极高的相似性,其N端与多种动植物逆转座子的逆转录酶C端具有相似特征。此外,发现AiPrxV I1中包含283个重复序列,在3 500-4 000bp和6 800-7 200bp区域尤为密集。以上特点提示海湾扇贝过氧化物还原酶V第1内含子可能是由一个非长末端重复元件逆转座子(non-LTR retrotransposons)插入,逐渐演变而形成的。
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| 关 键 词： | 海湾扇贝(Argopectenirradians) 过氧化物还原酶V 内含子 逆转座子 非长末端重复元件 |
| 收稿时间： | 2012/1/12 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2012/4/21 0:00:00 |
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