| 藻类磷酸甘露糖异构酶基因的序列结构特点及系统进化分析 |
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| 引用本文： | 张亚兰,王绪敏,王大鹏,夏艳,刘涛,池姗.藻类磷酸甘露糖异构酶基因的序列结构特点及系统进化分析[J].海洋湖沼通报,2013(1):75-84. |
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| 作者姓名： | 张亚兰 王绪敏 王大鹏 夏艳 刘涛 池姗 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学海洋生命学院;中国科学院北京基因组研究所 |
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| 基金项目： | 转基因生物新品种培育科技重大专项(2009ZX08009-100B);国家863计划(2012AA10A406);高校基本科研业务费项目资助 |
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| 摘 要： | 磷酸甘露糖异构酶基因(phosphomannose isomerase,PMI)编码磷酸甘露糖异构酶(PMI),可逆催化甘露糖-6-磷酸和果糖-6-磷酸之间的相互转化,在GDP-D-甘露糖的合成中起重要的作用,后者是生物体合成糖蛋白和糖脂必需的前体物质。本文根据在Genbank中已经登录的部分藻类PMI基因序列,与部分细菌、真菌、植物和动物的PMI基因序列做比较,研究其进化趋势和规律及其基因结构,为以后在大型藻类中研究该基因奠定基础。系统进化分析表明,藻类的PMI基因有2个进化方向,绿藻类的PMI基因与高等植物的进化趋势一致;而杂色藻类(硅藻和褐藻)则单独形成一个进化分支。多序列比对表明,磷酸甘露糖异构酶蛋白有3个保守区,其中有4个氨基酸残基位点是金属离子结合位点,分别为2个Glu和2个His。对部分藻类的PMI基因进行结构分析表明:在比较低等的藻类中,PMI基因没有内含子插入,而较高等的藻类中则有不同数目和长度的内含子插入。对部分藻类PMI基因的生物信息学分析结果显示,PMI基因编码的蛋白为酸性蛋白,分子量在40到60kDa之间;二级结构中均以α-螺旋和无规则卷曲为主;三级结构与二级结构相吻合。
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| 关 键 词： | 藻类 磷酸甘露糖异构酶基因 系统进化 基因结构 生物信息学 |
STRUCTURAL FEATURE AND PHYLOGENETIC ANALYSIS OF PHOSPHOMANNOSE ISOMERASE GENE IN ALGAE |
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| ZHANG Yalan,WANG Xumin,WANG Dapeng,XIA Yan,LIU Tao,and CHI Shan.STRUCTURAL FEATURE AND PHYLOGENETIC ANALYSIS OF PHOSPHOMANNOSE ISOMERASE GENE IN ALGAE[J].Transaction of Oceanology and Limnology,2013(1):75-84. |
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| Authors: | ZHANG Yalan WANG Xumin WANG Dapeng XIA Yan LIU Tao and CHI Shan |
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| Institution: | 1(1.College of Marine Life Sciences,Ocean University of China,Qingdao 266003,China; 2 Beijing Institute of Genomics,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100029,China) |
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