| 抑制性消减杂交技术结合cDNA MICROARRAY技术在中国明对虾WSSV感染后差异表达基因研究上的应用 |
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| 引用本文： | 王兵,桂朗,李富花,相建海.抑制性消减杂交技术结合cDNA MICROARRAY技术在中国明对虾WSSV感染后差异表达基因研究上的应用[J].海洋与湖沼,2008,39(5):455-461. |
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| 作者姓名： | 王兵 桂朗 李富花 相建海 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院海洋研究所,青岛,266071
2. 中国科学院海洋研究所,青岛,266071;中国科学院研究生院,北京,100049 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金
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国家高技术研究发展计划(863计划)
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| 摘 要： | 以中国明对虾WSSV感染6h的头胸部组织为实验材料,提取总RNA分别进行正反向抑制性PCRcDNA消减杂交,消减杂交后的PCR产物经纯化并克隆到T载体,进而转化成正反向消减文库。消减文库库容分别为:正向库,3.7×104;反向库,1.2×104。利用消减文库的克隆构建了cDNA表达谱芯片,共有1536个靶点,其中正、反向文库各768个。使用该cDNA芯片对WSSV感染后6h的对虾组织进行了表达谱分析,对其中80个出现明显表达调控变化的阳性克隆进行了测序。结果显示,在WSSV感染后6h,病毒基因开始大量表达,而宿主糖酵解,嘌呤、嘧啶代谢以及精氨酸代谢等代谢途径的关键基因出现明显下调。这表明病毒已在宿主体内大批量复制并开始抑制宿主代谢。病毒上调表达的WSV482可能与病毒毒力的增强有关,而宿主蛋白的管家基因如Actin,EFα的下调表达提示:在利用基因表达技术研究WSSV病毒的实验中,管家基因的选择要十分慎重。此外,根据作者已有的研究结果,TPI基因是比较好的候选管家基因。而WSV414、WSV215和WSV482是对WSSV进行RNA干涉实验较好的候选靶标基因。
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| 关 键 词： | 中国明对虾 消减文库 基因芯片 |
| 收稿时间： | 2007/7/15 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2007/9/30 0:00:00 |
SCREENING OF DIFFERENTIAL EXPRESSION GENES IN WSSV CHALLENGED CHINESE SHRIMP, FENNEROPENAEUS CHINENSIS USING SSH AND cDNA MICROARRAY |
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| WANG Bing,GUI Lang,LI Fu-Hua and XIANG Jian-Hai.SCREENING OF DIFFERENTIAL EXPRESSION GENES IN WSSV CHALLENGED CHINESE SHRIMP, FENNEROPENAEUS CHINENSIS USING SSH AND cDNA MICROARRAY[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2008,39(5):455-461. |
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| Authors: | WANG Bing GUI Lang LI Fu-Hua and XIANG Jian-Hai |
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| Institution: | Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao, 266071;Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao, 266071; Graduate School, Chinese Academy of Sciences, Beijing, 100049;Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao, 266071;Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao, 266071 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Fenneropenaeus chinensis SSH library Microarray |
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