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| 长石莼(缘管浒苔)(Ulva linza)rbcL全长基因的克隆与序列分析 | |
| 引用本文： | 应成琦,蔡春尔,尹顺吉,徐 韧,LIN Sen-Jie,周志刚,马家海,何培民. 长石莼(缘管浒苔)(Ulva linza)rbcL全长基因的克隆与序列分析[J]. 海洋与湖沼, 2010, 41(4): 555-562 |
| 作者姓名： | 应成琦 蔡春尔 尹顺吉 徐 韧 LIN Sen-Jie 周志刚 马家海 何培民 |
| 作者单位： | 1. 上海海洋大学,农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海,201306;中国水产科学研究院东海水产研究所中国水产科学研究院盐碱地渔业工程技术中心,上海,200090 2. 上海海洋大学,农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海,201306 3. 国家海洋局东海环境监测中心,上海,200137 4. Department,of,Marine,Sciences,University,of,Connecticut,Groton,CT,06340,USA |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，教育部博士点基金资助项目，上海市优秀学科带头人计划项目，上海市科委"长三角联合攻关"项目，上海市教委优势(重点)学科资助项目 |
| 摘 要： | 克隆分离了长石莼(缘管浒苔)光合作用第一关键酶Rubisco大亚基全长基因(rbcL)。首先应用PCR和RT-PCR方法扩增rbcL大片段DNA序列和大片段cDNA序列,结果表明,获得的2个克隆序列完全相同,该rbcL大片段基因不存在内含子。其次应用基因步移方法分别对rbcL基因的5′上游未知序列和3′下游未知序列进行扩增,在此基础上,将3个片段序列进行拼接,获得了rbcL全长基因序列(NCBI登陆号:DQ813497)。序列全长2124bp,其中编码区序列长1425bp,为单外显子基因,编码474个氨基酸;5′非翻译区序列长225bp,转录起始位点为位于翻译起始密码子ATG上游第47个核苷酸G,在距离转录起始位点-9bp—-48bp的范围内有推测的类似原核生物的启动子序列(-10区:TAAAAT、-35区:TTGAAA);3′非翻译区序列长474bp,在距离转译终止密码子TAA下游54—98bp处有一段较长的回文序列,可形成一个22bp的茎结构。密码子偏好性分析结果表明,长石莼(缘管浒苔)rbcL基因偏向使用第三位核苷酸碱基为A和T的密码子。 |
| 关 键 词： | 长石莼(缘管浒苔) 全长序列 基因步移 |
| 收稿时间： | 2009-08-20 |
| 修稿时间： | 2009-10-18 |
CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF THE FULL-LENGTH rbcL GENE FROM ULVA LINZA |
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| YING Cheng-Qi,CAI Chun-Er,YIN Shun-Ji,XU Ren,LIN Sen-Jie,ZHOU Zhi-Gang,MA Jia-Hai and HE Pei-Min. CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF THE FULL-LENGTH rbcL GENE FROM ULVA LINZA[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2010, 41(4): 555-562 | |
| Authors: | YING Cheng-Qi CAI Chun-Er YIN Shun-Ji XU Ren LIN Sen-Jie ZHOU Zhi-Gang MA Jia-Hai HE Pei-Min |
| Affiliation: | Aquatic Genetic Resources & Aquacultural Ecology Key Lab of the Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University;Research Center for Saline Fisheries Technology, East China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences;Aquatic Genetic Resources & Aquacultural Ecology Key Lab of the Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University;Aquatic Genetic Resources & Aquacultural Ecology Key Lab of the Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University;East Sea Department of State Oceanic Administration;Department of Marine Sciences, University of Connecticut, Groton;Aquatic Genetic Resources & Aquacultural Ecology Key Lab of the Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University;Aquatic Genetic Resources & Aquacultural Ecology Key Lab of the Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University;Aquatic Genetic Resources & Aquacultural Ecology Key Lab of the Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University |
| Abstract: | |
| Keywords: | rbcL |
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