| 环境16S rDNA和16S rcDNA序列分析湖光岩玛珥湖的浮游细菌组成 |
| |
| 引用本文： | 秦青英,曾永辉,郭倩茹,简纪常,鲁义善,吴灶和.环境16S rDNA和16S rcDNA序列分析湖光岩玛珥湖的浮游细菌组成[J].广东海洋大学学报,2013(3):1-9. |
| |
| 作者姓名： | 秦青英 曾永辉 郭倩茹 简纪常 鲁义善 吴灶和 |
| |
| 作者单位： | 1. 广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室,广东 湛江,524088
2. 广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室，广东 湛江 524088; 仲恺农业工程学院，广东 广州 510000 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金青年项目，广东省自然科学基金博士启动项目 |
| |
| 摘 要： | 通过提取环境总16S rDNA和总16S rRNA分别构建DNA克隆文库和反转录cDNA文库,并进行克隆测序和序列分析,探讨湖光岩玛珥湖浮游细菌和浮游活性细菌的遗传多样性。结果表明:构建两个水层的4个克隆文库,即1 m和10 m水层总菌的16S rDNA文库和总活性菌的16S rcDNA文库,共获得413条序列,分属15门、32目、52科;1 m水层的rDNA文库与rcDNA文库中Verrucomicrobia类群所占比例最大(36.8%和32.1%),其次为Alphaproteobacteri(a 15.1%和16%)和Betaproteobacteri(a 17.9%和16%);在10 m水层的2个文库中,Alphaproteobacteria类群均占绝对优势,分别为63.5%(rDNA)和43.8%(rcDNA),其次为Verrucomicrobia(11.5%和14.3%),其他细菌类群包括Acidobacteria、Chloroflexi、Firmicutes、待定门OD1、Planctomycetes、Spirochetes和Deltaproteobacteria,比例在0.8%~3.8%之间;在科的水平上,SAR11为湖光岩玛珥湖最为丰富的类群,占总克隆数的26.9%,其中在10 m水层的比例高达51.5%。序列同源性分析表明,绝大多数序列(89.8%)来源于新种,其中19.6%的序列可能来自于新属,69%的序列可能来自于全新的科。湖光岩玛珥湖浮游细菌群落结构较为独特,有大量的浮游细菌种类尚未获得相应的纯培养物,蕴含着丰富而新颖的微生物资源。
|
| 关 键 词： | 湖光岩玛珥湖 浮游细菌 浮游活性菌 16S rDNA 16S rRNA 系统发育分析 遗传多样性 |
Bacterioplankton Composition in Huguangyan Maar Lake Revealed by Environmental 16S rDNA and 16S rcDNA Sequence Analysis |
| |
| QIN Qing-ying
,
ZENG Yong-hui
,
GUO Qian-ru
,
JIAN Ji-chang
,
LU Yi-shan
,
WU Zao-he.Bacterioplankton Composition in Huguangyan Maar Lake Revealed by Environmental 16S rDNA and 16S rcDNA Sequence Analysis[J].Journal of Zhanjiang Ocean University,2013(3):1-9. |
| |
| Authors: | QIN Qing-ying ZENG Yong-hui GUO Qian-ru JIAN Ji-chang LU Yi-shan WU Zao-he |
| |
| Institution: | 1,2(1.Guangdong Provincial Key Laboratory of Pathogenic Biology and Epidemiology for Aquatic Economic Animals,Fisheries College,Guangdong Ocean University,Zhanjiang 524088,China;2.Zhongkai University of Agriculture and Engineering,Guangzhou 510000,China) |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Huguangyan Maar Lake bacterioplankton active planktonic bacteria 16S rDNA 16S rRNA phylogenetic analysis genetic diversity |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
