荣成湾孔鳐群体线粒体DNA cytb部分序列的遗传多样性分析 |
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引用本文: | 刘梦侠,王丽娟,孔令怡,刘洪军,吴志昊,辛梦娇,张 伟,尤 锋. 荣成湾孔鳐群体线粒体DNA cytb部分序列的遗传多样性分析[J]. 海洋科学, 2012, 36(10): 85-92 |
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作者姓名: | 刘梦侠 王丽娟 孔令怡 刘洪军 吴志昊 辛梦娇 张 伟 尤 锋 |
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作者单位: | 1. 山东海水养殖研究所, 山东 青岛 266002 2. 中国科学院 海洋研究所, 山东 青岛 266071 3. 中国海洋大学 海洋生命学院, 山东 青岛 266003 |
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基金项目: | 国家海洋公益性行业科研专项(200805069) |
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摘 要: | 对2009 年和2011 年采自荣成湾的孔鳐(Raja porosa)群体共54 尾鱼的线粒体DNA 细胞色素b基因(cytb)部分序列进行测定, 以分析其遗传多样性和群体遗传结构。结果显示, 在所获得的782 bp 序列中, 共检测到11 个单倍型、15 个多态位点, 其单倍型多样性指数(H)为0.498±0.081, 核苷酸多样性指数(π)为0.0018±0.0005, 遗传多样性水平较低。其中, 2009 年样品检测到3 种单倍型、4 个单一变异位点, 其H 和π 值分别为0.378±0.181 和0.0010±0.0006; 2011 年样品检测到9 种单倍型、6 个单一变异位点和6 个简约信息位点, 其H 和π 值分别为0.352±0.086 和0.0020±0.0006。分子方差分析(AMOVA)分析显示它们的遗传变异主要集中在同年度个体间(98.22%), 而不同年度个体间的遗传变异远远小于同年度内个体间的变异。Kimura’s 2-parameter 模型分析得到的2009, 2011 年度孔鳐间的遗传距离为0.0013, 遗传分化系数为0.01778, 也表明2009 年和2011 年孔鳐的遗传分化程度低, 没有明显的遗传变异。中性检验表明, 荣成湾孔鳐群体可能发生过种群扩张。
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关 键 词: | 孔鳐(Raja porosa) 荣成湾 细胞色素b基因(cytb)部分序列 群体遗传多样性 |
收稿时间: | 2012-05-17 |
修稿时间: | 2012-08-21 |
Genetic diversity analysis of partial sequences of mtDNA cytb in Raja porosa stock of the Rongcheng Bay |
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Abstract: |
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Keywords: | Raja porosa the Rongcheng Bay cytochrome b gene (cytb) partial sequence population genetic diversity |
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