| 大菱鲆(Scophthalmus maximus)微卫星序列的开发与分析 |
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| 引用本文： | 李 猛,马爱军,岳 亮,邹 杰,王广宁,田岳强,马本贺,夏丹丹. 大菱鲆(Scophthalmus maximus)微卫星序列的开发与分析[J]. 海洋与湖沼, 2013, 44(5): 1365-1371 |
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| 作者姓名： | 李 猛 马爱军 岳 亮 邹 杰 王广宁 田岳强 马本贺 夏丹丹 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院黄海水产研究所,上海海洋大学水产与生命学院;中国水产科学研究院黄海水产研究所;中国水产科学研究院黄海水产研究所;中国水产科学研究院黄海水产研究所;中国水产科学研究院黄海水产研究所;中国水产科学研究院黄海水产研究所;中国水产科学研究院黄海水产研究所;中国水产科学研究院黄海水产研究所 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项资金资助, CARS-50-G01号。 |
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| 摘 要： | ![]()
采用FIASCO (Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing repeats)法和标记初步筛选法, 进行了大菱鲆(Scophthalmus maximus)微卫星标记开发的研究, 分析了大菱鲆基因组中微卫星DNA序列的特征, 并进行了拟作图标记的初步筛选。结果表明, FIASCO法的富集效率为78.56%, 二次筛选出655个阳性克隆, 测序后经分析有469条含有微卫星位点的单一序列, 共得到597个微卫星位点。其中完美型占51.76%, 非完美型占34.67%, 复合型占13.57%; 核心序列的重复次数在3—96次之间, 平均重复数为13.39次; 重复单元类别最多的是(CA/GT)n, 占77.6%。利用Primer Premier 5.0共设计413对引物, 其中有360对能够得到稳定表达的产物; 再经标记初筛试验得知, 183对引物(50.8%)的PCR产物有多态性, 其中110个微卫星位点(30.6%)符合遗传连锁图谱作图标准。
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| 关 键 词： | 大菱鲆 微卫星标记 标记开发 序列分析 标记初筛 |
| 收稿时间： | 2012-10-16 |
| 修稿时间： | 2012-11-27 |
ISOLATION AND ANALYSIS OF MICROSATALLITE MARKERS IN THE GENOME OF TURBOT SCOPHTHALMUS MAXIMUS |
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| LI Meng,MA Ai-Jun,YUE Liang,ZOU Jie,WANG Guang-Ning,TIAN Yue-Qiang,MA Ben-He and XIA Dan-Dan. ISOLATION AND ANALYSIS OF MICROSATALLITE MARKERS IN THE GENOME OF TURBOT SCOPHTHALMUS MAXIMUS[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2013, 44(5): 1365-1371 |
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| Authors: | LI Meng MA Ai-Jun YUE Liang ZOU Jie WANG Guang-Ning TIAN Yue-Qiang MA Ben-He XIA Dan-Dan |
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| Affiliation: | Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences,Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences |
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| Abstract: | ![]()
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| Keywords: | turbot Scophthalmus maximus microsatellite markers marker isolation sequence analysis preliminary screening |
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