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| 溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统vscP基因的克隆与生物信息学分析 | |
| 作者单位： | ;1.广东海洋大学水产学院;2.广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室;3.广东省教育厅水产经济动物病害控制重点实验室;4.仲恺农业工程学院 |
| 摘 要： | 根据NCBI上登录的溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)全基因组序列,设计一对克隆溶藻弧菌HY9901株Ⅲ型分泌系统"分子尺"蛋白VscP全长基因的特异性引物,PCR扩增获得基因的全长片段。结果显示,vsc P(Gen Bank登录号FR780678)开放阅读框ORF为1 206 bp,共编码401个氨基酸残基。根据推导的氨基酸序列预测其分子质量约为44.4 ku,等电点为5.72。Signal 4.1 Server和TMHMM Server 2.0预测结果表明,VscP无信号肽与跨膜结构域。Soft Berry-Psite预测结果显示,VscP含有3个N端糖基化位点,2个cAMP及c GMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点,5个蛋白激酶C磷酸化位点,9个酪蛋白激酶II磷酸化位点,2个N端豆蔻酰基化位点,1个酰胺化位点和3个微体C末端靶信号位点。运用MEGA6.0构建的VscP系统进化树显示,溶藻弧菌VscP与副溶血弧菌(V.parahaemolyticus)聚为一簇。应用SWISS-MODEL软件构建VscP亚基三维结构模型发现,其与鞭毛Fil K蛋白有相似构型。 |
| 关 键 词： | 溶藻弧菌 Ⅲ型分泌系统 基因克隆 生物信息学分析 vscP |
Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of Yop Secretion Protein P(VscP) from Vibrio alginolyticus Strain HY9901 |
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