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深圳杨梅坑海域造礁石珊瑚共生藻分类和遗传多样性研究
作者姓名:陈文静  佟飞  陈丕茂  朱爱意  张露  李丹丹  龙鑫玲
作者单位:浙江海洋大学,浙江 舟山 316022;中国水产科学研究院南海水产研究所,广东 广州 510300;中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地,广东 深圳 518108,中国水产科学研究院南海水产研究所,广东 广州 510300;中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地,广东 深圳 518108,中国水产科学研究院南海水产研究所,广东 广州 510300;中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地,广东 深圳 518108,浙江海洋大学,浙江 舟山 316022,中国水产科学研究院南海水产研究所,广东 广州 510300;中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地,广东 深圳 518108,浙江海洋大学,浙江 舟山 316022;中国水产科学研究院南海水产研究所,广东 广州 510300;中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地,广东 深圳 518108,中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地,广东 深圳 518108
基金项目:深科技创新〔2016〕86号资助项目(JCYJ20160331141759795);国家海洋公益性行业科研专项经费资助项目(201405020-2)
摘    要:通过核糖体ITS(Internal Transcribed Spacer)的核苷酸序列研究了深圳杨梅坑海域20种47个造礁石珊瑚样本的共生藻。通过ITS序列分析,与GenBank上的4种不同的共生藻构建Neighbor-Joining聚类树,进行石珊瑚共生藻分类和遗传多样性分析。结果表明,该海域的造礁石珊瑚共生藻属于2种不同的种类(亚系群),19个样品属于C1亚系群共生藻,1个样品属于C15亚系群共生藻,C1和C15两个亚系群共生藻之间的遗传距离为0. 01。将深圳杨梅坑海域得到的ITS序列与NCBI数据库上的福建东山海域、广东徐闻地区的C1系共生藻进行比对,只有深圳杨梅坑海域藻类样本平均(A+T)碱基含量为49. 4%,(A+T)含量小于(G+C)含量。构建Neighbor-Joining聚类树表明,深圳杨梅坑海域石珊瑚共生藻与福建东山海域的亲缘关系较近,而与广东徐闻地区的亲缘关系较远,地理隔离是主要的因素。

关 键 词:海洋生物学  造礁石珊瑚  共生藻  ITS序列  遗传多样性  深圳杨梅坑海域
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