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白色噬琼胶菌QM38β-琼胶酶基因agaD02 的克隆与表达
引用本文:王 静,马吉飞,苗婷婷,李兆杰,杜宗军.白色噬琼胶菌QM38β-琼胶酶基因agaD02 的克隆与表达[J].海洋科学,2010,34(8):6-10.
作者姓名:王 静  马吉飞  苗婷婷  李兆杰  杜宗军
作者单位:1. 威海出入境检验检疫局,山东,威海,264200
2. 山东大学,威海分校,海洋学院,山东,威海,264209
基金项目:山东省自然科学基金项目 (ZR2009EQ009); 国家海洋局海洋生物活性物质与现代分析技术重点实验室开放基金项目(MBSMAT-2009-07);山东大学自主创新基金资助
摘    要:从白色噬琼胶菌(Agarivorans albus)QM38基因组中扩增到一段编码β-琼胶酶的DNA序列,命名为agaD02。序列相似性分析的结果表明,基因agaD02和弧菌Vibrio sp.JT0107及Vibrio sp.PO-303的琼胶酶基因具有同源性,其相似性程度分别为98.7%和97.4%,而同GenBank中的其他序列同源性很低。对此基因的序列进行了分析,结果表明,其开放阅读框长度为2 868 bp,编码的蛋白质包含955个氨基酸,在蛋白数据库中的编号为ABM90422,推测其分子质量为106 ku,等电点为4.87。利用网上数据库资源和生物学软件对预测的琼胶酶蛋白序列进行了同源性分析和结构分析。设计两端含酶切位点的特定引物,克隆agaD02基因,构建入表达载体pET24a(+),转化大肠杆菌BL21(DE3),转化后提取质粒进行酶切和电泳验证,转化后的大肠杆菌经诱导可产生胞外琼胶酶。

关 键 词:琼胶酶    白色噬琼胶菌(Agarivorans  albus)    克隆    序列分析    表达
收稿时间:2010/2/12 0:00:00
修稿时间:6/3/2010 12:00:00 AM

Cloning and expression of the beta-agarase gene agaD02 from Agarivorans albus QM38
WANG Jing,MA Ji-fei,MIAO Ting-ting,LI Zhao-jie and DU Zong-jun.Cloning and expression of the beta-agarase gene agaD02 from Agarivorans albus QM38[J].Marine Sciences,2010,34(8):6-10.
Authors:WANG Jing  MA Ji-fei  MIAO Ting-ting  LI Zhao-jie and DU Zong-jun
Institution:WANG Jing1,MA Ji-fei2,MIAO Ting-ting2,LI Zhao-jie1,DU Zong-jun2(1.Weihai Entry-Exit Inspection And Quarantine Bureau,Weihai 264200,China,2.College of Marine Science,Shandong University at Weihai,Weihai 264209,China)
Abstract:
Keywords:aragase  Agarivorans albus  clone  sequence analysis  expression
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