硬壳蛤(Mercenaria mercenaria)生长性状转录组差异分析

经济物种的生长性状直接影响其经济产值。本研究以生长速度具有显著差异的同龄硬壳蛤(Mercenaria mercenaria)成贝为研究对象, 利用转录组测序探究生长快慢个体组间基因表达差异, 并探寻可能影响硬壳蛤生长速度的关键基因。结果显示, 快速生长与缓慢生长的硬壳蛤群体间共有1 590个差异基因, 通过对差异基因进行功能富集分析发现, 这些差异基因主要在PPAR信号转导、免疫、消化等相关通路上显著富集。编码蛋白磷酸酶调节亚基和过氧化物酶体酰基辅酶A的基因可能在PPAR信号通路中影响硬壳蛤的糖代谢、物质传递等生命活动过程, 进而导致不同硬壳蛤生长速度的差异。这些基因表达量高的个体可能具有较强的细胞内的代谢和物质传递能力, 因此生长速度较快; 此外, 脂类消化代谢相关基因3-酮酰基-CoA硫解酶在生长快速的硬壳蛤中表达显著下调, 这表明生长快速的硬壳蛤可能脂肪酸降解速度较慢, 导致更多脂肪酸在生物体内积累; 另一方面, 多糖消化代谢相关通路中葡萄糖差向异构酶在生长快速的硬壳蛤中表达显著上调, 过氧化物蛋白酶、组织蛋白酶和蛋白磷酸酶等免疫相关基因在生长快速的硬壳蛤中表达显著上调。这表明生长快速的硬壳蛤群体可能具有更强的消化能力和免疫能力, 从而保证了其更快的生长速度。本研究结果为硬壳蛤的生长性状遗传机制提供了新的见解, 为下一步的育种工作提供了理论依据。