| 深海囊螂蛤铁蛋白的环境选择压力分析 |
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| 引用本文： | 孔雪,王玮,蔡月凤,李亚男,张驰乐,张海滨,申欣.深海囊螂蛤铁蛋白的环境选择压力分析[J].海洋通报,2023(5). |
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| 作者姓名： | 孔雪 王玮 蔡月凤 李亚男 张驰乐 张海滨 申欣 |
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| 作者单位： | 江苏海洋大学 海洋科学与水产学院，江苏 连云港 222000；江苏海洋大学 江苏省海洋生物资源与环境重点实验室/江苏省海洋生物技术重点实验室，
江苏 连云港 222000;仲恺农业工程学院动物科技学院，广东 广州 510225;中国科学院深海科学与工程研究所，海南 三亚 572000 |
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| 基金项目： | 江苏省自然科学基金杰出青年基金（BK20190048）；江苏省自然科学基金青年基金（BK20210927）；江苏省高等学校基础科学（自然科学）研究面上省资助经费项目（21KJB170022）； 江苏省海洋生物资源与环境重点实验室开放
课题（SH20201208）； 江苏海洋大学人才引进科研基金项目（KQ19043）；江苏高校优势学科建设工程资助项目 |
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| 摘 要： | 深海环境常有高压、极端温度、富含重金属、黑暗、寡营养等特点。生活在该种特殊环境中的生物可能演绎出不同机制适应此生境。囊螂科贝类是深海冷泉/热液区的优势物种，拟通过对来自冷泉/热液区囊螂科贝类铁蛋白进行环境选择压力分析，以期解析其适应深海特殊生境（高铁环境、高静水压）的机制。首先，通过本地比对的方式获得了囊螂蛤和其近缘种铁蛋白的核苷酸和氨基酸序列，其均有ferritin保守功能域和相应的保守位点。其中，囊螂蛤铁蛋白Cmfer-2、Cmagfer-3、Pofer-3属于M型铁蛋白，其他归属为H型铁蛋白。 Cmagfer-4和Pofer-4可初步判断为分泌型铁蛋白，而其他囊螂蛤铁蛋白与胞质型铁蛋白聚为一支。为了探索环境因素对深海贝类铁蛋白的影响，运用PAML软件对深浅海铁蛋白进行了选择压力分析。 结果显示总共鉴定到8个正选择位点，其后验概率大于95%。其中，在含有嗜压氨基酸的对应组中，约50%浅海位点置换为嗜压的氨基酸，进一步证明了17A、 55R、171S氨基酸置换是铁蛋白适应深海压力变化的一种策略。更进一步研究发现69 K→I/T/M和171 E/K→S由带电荷的极性氨基酸置换为不带电荷的氨基酸，并且大部分受到选择的位点位于蛋白的N端和C端，深海囊螂蛤铁蛋白可能通过特定氨基酸极性的转变和分布区域的改变来适应深海特殊环境。本文通过深浅海贝类铁蛋白的分析来为深海生物对极端环境的适应研究提供一些信息和见解。
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| 关 键 词： | 铁蛋白 冷泉热液区 正选择 囊螂蛤 |
| 收稿时间： | 2022/8/1 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/12/12 0:00:00 |
Environmental selection pressure analysis of ferritin from deep-sea Vesicomyidae clams |
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| KONG Xue,WANG Wei,CAI Yuefeng,LI Yanan,ZHANG Chile,ZHANG Haibin,SHEN Xin.Environmental selection pressure analysis of ferritin from deep-sea Vesicomyidae clams[J].Marine Science Bulletin,2023(5). |
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| Authors: | KONG Xue WANG Wei CAI Yuefeng LI Yanan ZHANG Chile ZHANG Haibin SHEN Xin |
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| Institution: | School of Marine Science and Fisheries, Jiangsu Ocean University, Lianyungang 222000, China;Jiangsu Key Laboratory of Marine Bioresources and Environment/Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology,
Jiangsu Ocean University, Lianyungang 222000, China;Zhongkai University of Agriculture and Engineering, Guangzhou 510225, China;Institute of Deep-sea Science and Engineering, Chinese Academy of Sciences, Sanya 572000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | ferritin cold seep/hydrothermal vent positive selection Vesicomyidae |
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