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浮游植物metacaspase的分布、结构及其功能特性
引用本文:苏金净,蔡伟聪,李桂玲,李健,曾珺,刘静雯. 浮游植物metacaspase的分布、结构及其功能特性[J]. 海洋与湖沼, 2019, 50(5): 1059-1069
作者姓名:苏金净  蔡伟聪  李桂玲  李健  曾珺  刘静雯
作者单位:集美大学食品与生物工程学院;福建省食品微生物与酶工程重点实验室
基金项目:国家自然科学基金项目,41576166号;福建省自然科学基金项目,2019J01696号;福建省科技计划重点项目,2015Y0039号;福建省食品微生物与酶工程重点实验室开放基金项目,B18097-1号。
摘    要:精氨酸/赖氨酸特异性半胱氨酸蛋白酶(Metacaspase)在浮游植物程序性细胞死亡(programmed cell death.PCD)过程中起着关键作用。本文利用生物信息学方法分析metacaspase基因在浮游植物中的分布,并以海洋球石藻(Emilianiahuxleyi)metacaspases(EhMCs)为代表分析其结构和功能,依据Uniprot和String数据库挖掘与metacaspase功能相关并参与浮游植物PCD过程的互作蛋白。结果发现:共计29条、四种类型的metacaspases分布于11种浮游植物中,它们的metacaspase蛋白一级结构存在明显差异,但位于p20的组氨酸和半胱氨酸活性位点均具有高度的保守性;EhMCs三级结构与酵母的metacaspase十分相似,暗示它们具有类似的功能;浮游植物metacaspases与多种蛋白存在直接或间接的互作关系,在细胞PCD过程、响应环境胁迫和能量代谢等方面发挥重要作用。另外.metacaspase的磷酸化修饰可能在浮游植物PCD信号转导过程中起调节作用。

关 键 词:浮游植物  程序性细胞死亡(PCD)  metacaspase  结构与功能  互作蛋白
收稿时间:2019-03-16
修稿时间:2019-05-20

DISTRIBUTION, STRUCTURE, AND FUNCTION OF PHYTOPLANKTON METACASPASES
SU Jin-Jing,CAI Wei-Cong,LI Gui-Ling,LI Jian,ZENG Jun and LIU Jing-Wen. DISTRIBUTION, STRUCTURE, AND FUNCTION OF PHYTOPLANKTON METACASPASES[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2019, 50(5): 1059-1069
Authors:SU Jin-Jing  CAI Wei-Cong  LI Gui-Ling  LI Jian  ZENG Jun  LIU Jing-Wen
Affiliation:College of Food and Bioengineering, Jimei University, Xiamen 361021, China;Fujian Provincial Key Laboratory of Food Microbiology and Enzyme Engineering, Xiamen 361021, China,College of Food and Bioengineering, Jimei University, Xiamen 361021, China;Fujian Provincial Key Laboratory of Food Microbiology and Enzyme Engineering, Xiamen 361021, China,College of Food and Bioengineering, Jimei University, Xiamen 361021, China,College of Food and Bioengineering, Jimei University, Xiamen 361021, China,College of Food and Bioengineering, Jimei University, Xiamen 361021, China and College of Food and Bioengineering, Jimei University, Xiamen 361021, China;Fujian Provincial Key Laboratory of Food Microbiology and Enzyme Engineering, Xiamen 361021, China
Abstract:
Keywords:phytoplankton  programmed cell death (PCD)  metacaspase  structure and function  protein-protein interaction
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