| 单环刺螠(Urechis unicinctus)微卫星标记开发及5个地理种群遗传结构分析 |
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| 作者姓名： | 常城 韩慧宗 王腾腾 马海涛 刘阳 王斐 张明亮 王力勇 姜海滨 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306;山东省海洋资源与环境研究院山东省海洋生态修复重点实验室 烟台 264006,山东省海洋资源与环境研究院山东省海洋生态修复重点实验室 烟台 264006,上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306;山东省海洋资源与环境研究院山东省海洋生态修复重点实验室 烟台 264006,中国科学院南海海洋研究所 广州 510301,上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306;山东省海洋资源与环境研究院山东省海洋生态修复重点实验室 烟台 264006,山东省海洋资源与环境研究院山东省海洋生态修复重点实验室 烟台 264006,山东省海洋资源与环境研究院山东省海洋生态修复重点实验室 烟台 264006,烟台市水产研究所 烟台 264003,山东省海洋资源与环境研究院山东省海洋生态修复重点实验室 烟台 264006 |
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| 基金项目： | 山东省良种工程项目“优质抗病速生鱼类良种选育”,2014-2017;国家现代农业产业技术体系项目,CARS-50-Z09号。 |
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| 摘 要： | 采用高通量测序法从单环刺螠基因组中开发微卫星标记,并通过一个秦皇岛单环刺螠野生群体对其进行多态性评价,利用获得的多态性引物对秦皇岛、烟台、潍坊、青岛、大连5个不同海区的野生单环刺螠群体进行了遗传多样性及遗传结构分析。结果表明:本实验设计的50个微卫星标记能稳定扩增的有38个,其中22个微卫星位点在5个群体中均表现为高多态性,等位基因数(Na)介于24—44之间,多态信息含量(PIC)介于0.921—0.967之间。5个群体总的平均有效等位基因数(N_e)范围为6.629—8.850,平均观测杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)范围分别为0.790—0.912、0.851—0.896,大连群体的杂合度最大(H_e=0.8962),潍坊群体的最小(H_e=0.8510),其中有12个微卫星位点在不同群体中出现显著偏离Hardy-Weinberg平衡的现象。平均遗传分化指数(FST)表明,群体分化水平处于中等分化水平(FST值为0.0880—0.1136);聚类分析显示烟台群体先与青岛群体聚为一支,再与秦皇岛群体聚类,然后跟潍坊群体聚为一支,大连群体单独聚为一支;遗传距离模式(IBD)显示单环刺螠群体的地理距离与遗传距离间不存在显著的线性关系。本研究开发的22对微卫星标记可以用于单环刺螠遗传结构分析研究,为下一步单环刺螠种质资源保护和人工繁育提供参考依据。
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| 关 键 词： | 单环刺螠 微卫星标记 地理种群 遗传结构 聚类分析 |
| 收稿时间： | 2016-11-02 |
| 修稿时间： | 2017-01-12 |
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