低盐胁迫下凡纳滨对虾鳃丝抑制性消减杂交cDNA文库构建及差异ESTs分析 |
| |
引用本文: | 刘泓宇,谭北平,董晓慧,迟淑艳,杨奇慧.低盐胁迫下凡纳滨对虾鳃丝抑制性消减杂交cDNA文库构建及差异ESTs分析[J].海洋湖沼通报,2014(1). |
| |
作者姓名: | 刘泓宇 谭北平 董晓慧 迟淑艳 杨奇慧 |
| |
作者单位: | 广东海洋大学水产学院水产动物营养与饲料实验室; |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金(30871928);广东省自然科学基金(9152408801000006);广东省“千百十”工程国家级人才培养项目;广东省“珠江学者”GDUPS(2011)项目资助 |
| |
摘 要: | 本研究以凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)为对象,分别以低盐度胁迫下(4 ppt)凡纳滨对虾鳃丝cDNA为检测子,正常海水中凡纳滨对虾鳃丝cDNA为驱动予,采用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建了急性低盐胁迫诱导下凡纳滨对虾鳃丝消减cDNA文库。文库的重组率均高于95%,插入片段集中在250~750 bp之间,随机测序后在线拼接得到15组片段重叠群和37个单一序列共52个非重复序列。同源检索发现30个非重复序列与GenBank中的已知基因序列有较高的相似性。按差异表达基因编码的蛋白具体功能可分为6小类,依次为:(1)离子通道及转运蛋白;(2)蛋白合成翻译及转录因子;(3)应激抗氧化因子;(4)能量代谢;(5)信号受体和转导;(6)细胞纤维及骨架蛋白,所占比例分别为23.3%、20.0%、20.0%、16.7%、10.0%和10.0%。经功能聚类分析发现文库中含有大量离子通道蛋白及功能转运酶、胞内信号传导分子、细胞骨架蛋白等渗透调节和应激适应性相关基因,表明急性低盐胁迫诱导凡纳滨鳃丝抑制性消减杂交cDNA文库构建成功。
|
关 键 词: | 凡纳滨对虾 鳃丝 低盐胁迫 抑制性消减杂交 表达序列标签 |
本文献已被 CNKI 等数据库收录! |
|