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6种笛鲷属鱼类Cyt b基因片段序列的比较
引用本文:周发林,江世贵,苏天凤,吕俊霖.6种笛鲷属鱼类Cyt b基因片段序列的比较[J].热带海洋学报,2004,23(4):87-92.
作者姓名:周发林  江世贵  苏天凤  吕俊霖
作者单位:中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300
基金项目:广东省科技兴海重大项目(A200099A01),中国水产科学研究院人才基金项目
摘    要:采用聚合酶链式反应直接测序法,获得紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus)、白星笛鲷(L.stellatus)、千年笛鲷(L.sebae)、勒氏笛鲷(L.russelli)、红鳍笛鲷(L.erythropterus)5种笛鲷属鱼的线粒体细胞色素b(Cyt b)425bp序列,并结合基因库中的斜带笛鲷(L.decussatus)Cytb同源序列进行比较分析,共发现88个核苷酸位点存在变异(20.7%)。用MEGA2.1软件中的Pairwise distance工具计算了6种笛鲷属鱼类的相对遗传距离,表明6种笛鲷属鱼类的序列差异在0.096-0.129之间,其中红鳍笛鲷和紫红笛鲷序列差异最大为0.129,千年笛鲷与红鳍笛鲷的序列差异最小为0.096;序列变异的转换/颠换比值较低,平均只有2.160。

关 键 词:笛鲷属(Lutjanus)  细胞色素b  序列比较:遗传距离
文章编号:1009-5470(2004)04-0087-06
修稿时间:2003年4月30日

COMPARISON OF MITOCHONDRIAL CYTOCHROME B GENE FRAGMENTS AMONG SIX SPECIES OF LUTJANUS
Abstract:The DNA sequences of 425 bp mitochondrial cytochrome b of Lutjanus argentimaculatus, L. stellatus,L. erythropterus, L. sebae, L. russelli and L. decussatus were analyzed. The result indicated that there were 88 nucleotide sites substituted ((20.7)%). "Pairwise distance" of MEGA2.1 was used to compute the genetic distances among 6 species in Lutjanus. The substitutions (transition transversion) among the six sequences ranged from 0.096 to 0.129, with an average of 0.109. The highest substitution occurred at L. argentimaculatus and L. erythropterus (0.129) and the lowest subsitution at L. erythropterus and L. sebae (0.096). The transition-transversion ratios of the sequence substitutions of 6 species in Lutjanus ranged from 1.095 to 3.594, with an average of 2.160.
Keywords:Lutjanus  Cyt b gene  sequence comparison  genetic distances
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