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基于SAMPL的一种微卫星筛选方法在中国明对虾中的尝试
引用本文:张留所,孔晓瑜,喻子牛,孔 杰,相建海. 基于SAMPL的一种微卫星筛选方法在中国明对虾中的尝试[J]. 海洋科学, 2006, 30(2): 1-4
作者姓名:张留所  孔晓瑜  喻子牛  孔 杰  相建海
作者单位:中国科学院,海洋研究所,实验海洋生物学重点实验室,山东,青岛,266071;中国海洋大学,教育部海水养殖重点实验室,山东,青岛,266003;中国科学院,研究生院,北京,100039;中国海洋大学,教育部海水养殖重点实验室,山东,青岛,266003;中国水产科学研究院,黄海水产研究所,山东,青岛,266071;中国科学院,海洋研究所,实验海洋生物学重点实验室,山东,青岛,266071
基金项目:国家863计划(2001AA620105),国家自然科学基金重点课题(30230280),海水养殖教育部重点实验室基金
摘    要:微卫星的发展主要受限于微卫星及其旁侧特异引物区的分离,在中国明对虾(Fenner-openaeus chinensis)中建立了选择性扩增多态微卫星位点(SAMPL,selective amplified mic-rosatellite polymorphic loci)技术体系,并初步尝试了基于SAMPL的一种微卫星筛选方法。通过5′端锚定引物引入微卫星序列,对传统SAMPL技术加以改进并以期富集简单重复序列。从测序胶上随机选择5条SAMPL条带(分别命名为S11,S13,S14,S22,S24)克隆测序,大小分别为161,157,147,152,298。其中S11,S13,S14,S22四个片段两端引物分别为AFLP选择性引物和SAMPL引物,S13和S22含微卫星序列重复,S24两端引物均为传统的AFLP引物,在此片断中有一(AG)39重复。

关 键 词:选择性扩增多态微卫星位点(SAMPL)  中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)  微卫星
文章编号:1000-3096(2006)02-0001-04
收稿时间:2004-10-15
修稿时间:2005-03-28

Preliminary isolation of microsatellite based on SAMPL technique in shrimp Fenneropenaeus chinensis
ZHANG Liu-suo,KONG Xiao-yu,YU Zi-niu,KONG Jie,XIANG Jian-hai. Preliminary isolation of microsatellite based on SAMPL technique in shrimp Fenneropenaeus chinensis[J]. Marine Sciences, 2006, 30(2): 1-4
Authors:ZHANG Liu-suo  KONG Xiao-yu  YU Zi-niu  KONG Jie  XIANG Jian-hai
Affiliation:1. Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, the Chinese Academy of Sci ences, Qingdao 266071 ,China; 2. Key Laboratory of Mariculture, Ministry of Education, Ocean University of China, Qingdao 266003,China; 3. Graduate School of the Chinese Academy of Sciences, Beijing 100039,China;4. Yellow Sea Institute of Fisheries, Chinese Academy of Fisherise Sciences, Qingdao 266071, China
Abstract:
Keywords:selective amplified microsatellite polymorphic loci(SAMPL)  Fenneropenaeus chinensis  microsatellite
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