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| 泥蚶HDAC1基因cDNA全长、内含子克隆及时空表达特征分析 | |
| 作者姓名： | 任付真 姚韩韩 董迎辉 周小龙 林志华 |
| 作者单位： | 1.上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306;浙江万里学院 生物与环境学院 浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室, 浙江 宁波 315100 |
| 基金项目： | 国家现代贝类产业技术体系项目（CARS-48）;浙江省自然科学基金重点项目（LZ12C19001）;浙江省重大科技专项（2012C12907-4）;国家水产种质资源平台项目（2015DKA30470）。 |
| 摘 要： | HDAC1作为HDACs家族中重要成员,可使组蛋白去乙酰化进而调节基因表达,在细胞分化和胚胎早期发育中起重要作用。本文利用SMART RACE技术克隆得到泥蚶HDAC1(Tg-HDAC1)基因的cDNA全长序列,并对其内含子进行扩增及不同组织、不同发育时期的定量表达。结果发现:Tg-HDAC1基因的cDNA序列全长为2275 bp,开放阅读框(ORF)1587 bp,编码528个氨基酸;Tg-HDAC1蛋白序列与斑马鱼、鸡、小鼠等的相似性都在80%以上,表明该蛋白氨基酸序列在物种进化过程中具有保守性;在Tg-HDAC1基因中扩增出13个内含子,均存在于开放阅读框中,且都遵循GT-AG原则;荧光定量PCR(qRT-PCR)分析结果显示,Tg-HDAC1基因在成体血液、内脏团、外套膜、鳃、斧足和闭壳肌6个组织中均有表达,而在足中的表达量最高,且与其余5组织中的表达量有极显著差异(P<0.01),说明它对该组织生长具有重要作用。不同发育时期的表达差异结果表明,Tg-HDAC1基因在担轮幼虫期表达量最高,显著高于其他发育时期(P<0.05)。 |
| 关 键 词： | 泥蚶 组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1) 基因克隆 内含子 表达分析 |
| 收稿时间： | 2015-10-23 |
| 修稿时间： | 2016-04-06 |
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