蛤蜊科3种贝类16SrRNA基因片段及ITS2核苷酸序列分析 |
| |
作者姓名: | 孟学平 高如承 董志国 阎斌伦 程汉良 李艳杰 陈建安 |
| |
作者单位: | [1]淮海工学院海洋学院,江苏省海洋生物技术重点建设实验室,江苏连云港222005 [2]福建师范大学生命科学学院,福建福州350007 |
| |
基金项目: | 国家863计划项目资助(2004AA603140);江苏省海洋生物技术重点建设实验室开放课题项目(2005HS009);江苏省高校自然科学研究计划项目(05SJD240028);淮海工学院引进人才科研启动基金资助项目(KK01050). |
| |
摘 要: | 利用PCR技术分别扩增连云港及启东沿海蛤蜊科的西施舌(Coelomactra antiquata)、中国蛤蜊(Mactra chinensis)和四角蛤蜊(Mactra veneriformis)3种双壳贝的16SrRNA基因片段和ITS2核苷酸序列.测序后用DNAstar软件分析了核苷酸差异。结果显示:三种贝类16SrRNA基因片段长度相同,均为306bp(去除引物).核苷酸存在多态性。共有45个变异位点,54个核苷酸发生了变异。全部为碱基置换。西施舌与中国蛤蜊此片段核苷酸的同源性为88.9%.与四角蛤蜊的同源性为88.6%.中国蛤蜊与四角蛤蜊的同源性为90.6%。三种蛤蜊ITS2序列分别为390bp(西施舌)、441bp(四角蛤蜊)和466bp(中国蛤蜊)。存在长度多态性.ITS2核苷酸差异分析结果显示.西施舌与中国蛤蜊的同源性为70.9%-71.1%,西施舌与四角蛤蜊的为70.5%-71.0%。中国蛤蜊与四角蛤蜊的同源性为88.1%-88.8%。ITS2序列分析结果与16SrRNA基因片段分析结果一致.2种分子分析法均显示中国蛤蜊与四角蛤蜊的亲缘关系近。
|
关 键 词: | 西施舌 中国蛤蜊 四角蛤蜊 16S rRNA基因 ITS2 |
文章编号: | 1007-7995(2006)04-0008-06 |
收稿时间: | 2005-12-03 |
修稿时间: | 2005-12-03 |
本文献已被 维普 等数据库收录! |