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| 海洋生境刀鲚菌群PCR-DGGE指纹图谱构建及分析 | |
| 引用本文： | 聂志娟,徐钢春,程起群,杜富宽,张 勇,顾若波. 海洋生境刀鲚菌群PCR-DGGE指纹图谱构建及分析[J]. 海洋科学, 2014, 38(10): 63-69 |
| 作者姓名： | 聂志娟 徐钢春 程起群 杜富宽 张 勇 顾若波 |
| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院 淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室,江苏 无锡,214081 2. 中国水产科学研究院 东海水产研究所 农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室,上海,200090 3. 南京农业大学 渔业学院,江苏 无锡,214081 |
| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2013JBFT04); 农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室开放课题; 国家科技支撑计划项目(2012BAD26B05); 公益性行业科研专项(201203065) |
| 摘 要： | 为了分析海洋生境刀鲚(Coilia nasus)体内及生长环境菌群结构,作者采用免培养16S r DNA的PCR-DGGE指纹图谱技术,对刀鲚鳃、肠道壁、肠道内容物及水体环境中的菌群结构进行了对比分析。结果表明:变性梯度为35%~55%、浓度为8%的聚丙烯酰胺凝胶,150V 60℃下电泳10 h,DGGE带谱的分离效果较好;刀鲚鳃、肠道壁、肠道内容物及水体样品指纹图谱上分别显示出24、19、14和29条信号强度不同的条带;相同样品重复组细菌结构相似度在80%以上,差异不显著;不同样品之间,刀鲚鳃与海水聚为一支,具有较高的相似度为52%,肠壁与肠内容物相似度为41%。样品菌群主要以未培养菌为主,主要包括变形菌、放线菌和厚壁菌。本文首次成功构建海洋生境刀鲚菌群16S r DNA的PCR-DGGE指纹图谱。 |
| 关 键 词： | PCR-DGGE 菌群 刀鲚(Coilia nasus) PCA |
| 收稿时间： | 2013-09-25 |
| 修稿时间： | 2014-02-26 |
Construction and analysis of PCR-DGGE gene fingerprint of bacterial community in Coilia nasus from sea |
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| NIE Zhi-juan , XU Gang-chun , CHENG Qi-qun , DU Fu-kuan , ZHANG Yong , GU Ruo-bo. Construction and analysis of PCR-DGGE gene fingerprint of bacterial community in Coilia nasus from sea[J]. Marine Sciences, 2014, 38(10): 63-69 | |
| Authors: | NIE Zhi-juan XU Gang-chun CHENG Qi-qun DU Fu-kuan ZHANG Yong GU Ruo-bo |
| Abstract: | |
| Keywords: | PCR-DGGE bacterial community Coilia nasus PCA |
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