| 龙须菜微卫星DNA标记筛查及系统分析 |
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| 引用本文： | 张学成,贺扬,徐涤.龙须菜微卫星DNA标记筛查及系统分析[J].中国海洋大学学报(自然科学版),2009,39(2). |
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| 作者姓名： | 张学成 贺扬 徐涤 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学海洋生命学院,山东,青岛,266003 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，国家高技术研究发展计划(863计划) |
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| 摘 要： | 利用生物信息学方法,从龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)公共核苷酸数据库中筛查到8条含有微卫星DNA的序列,并根据筛查出的微卫星DNA序列设计合成了5对引物,此外还使用了细江蓠的4对已知微卫星DNA引物共9对引物在采集自青岛的26株野生龙须菜个体中进行扩增,结果筛选到2对引物可扩增出具有多态性的产物.然后利用5对龙须菜的微卫星引物对6个龙须菜品系和另外2个种外物种细基江蓠和菊花心江蓠进行系统学分析.根据计算得到的不同样品之间Nei氏遗传相似系数进行聚类分析,显示青岛野生龙须菜QD与栽培品系981、石岛的龙须菜样品SD与龙须岛的龙须菜样品LD之间的遗传相似系数最高,而来自委内瑞拉的龙须菜样品LV与青岛野生龙须菜之间的差异远远高于种内水平的差异.
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| 关 键 词： | 龙须菜 微卫星DNA 多态性分析 系统分析 |
Screening Microsatellite Sequences from Gracilaria lemaneiformis and It's Phylogenetic Analysis |
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| ZHANG Xue-Cheng,HE Yang,XU Di.Screening Microsatellite Sequences from Gracilaria lemaneiformis and It''s Phylogenetic Analysis[J].Periodical of Ocean University of China,2009,39(2). |
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| Authors: | ZHANG Xue-Cheng HE Yang XU Di |
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| Institution: | College of Marine Life Sciences;Ocean University of China;Qingdao 266003;China |
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| Abstract: | Eight microsatellite-containing sequences of Gracilaria lemaneiformis were identified from dbEST/GenBank and 5 primer pairs have been designed from these identified microsatellite sequences. Then 4 primer pairs of microsatellite of G. gracilis were used together with the other 5 pairs to detect their polymorphism among 26 individuals of wild G. lemaneiformis sampled in Qingdao. Only 2 pairs of primer were identified as having the polymorphic PCR band pattern. Furthermore, those 5 pairs of primers designed f... |
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| Keywords: | Gracilaria lemaneiformis microsatellites polymorphic analysis phylogenetic analysis |
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