宽体沙鳅(Botia reevesae)β-肌动蛋白基因的cDNA克隆与表达分析 |
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作者姓名: | 覃川杰 陈立侨 岳兴建 李二超 王永明 邹远超 谢碧文 齐泽民 |
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作者单位: | 内江师范学院生命科学学院;华东师范大学生命科学学院;内江师范学院生命科学学院;华东师范大学生命科学学院;内江师范学院生命科学学院;内江师范学院生命科学学院;内江师范学院生命科学学院;内江师范学院生命科学学院 |
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基金项目: | 四川省教育厅项目, 11ZB025 号; 四川省科技厅项目, 2011NZ0075 号; 国家科技支撑计划课题资助项目, 2012BAD25B03号; 公益性行业(农业)科研专项资助项目, 201203065 号; 内江师范学院大学生创新性实验计划项目, X201207 号 |
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摘 要: | 利用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术首次克隆了宽体沙鳅(Botia reevesae)-肌动蛋白基因的cDNA全序列,该序列全长为1795bp,由长100bp的5非翻译区(untranslated region,UTR)、570bp的3非翻译区和1125bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)组成,编码375个氨基酸。宽体沙鳅-actin氨基酸序列包含1个糖基化位点、9个N-豆寇酰化位点、3个actin信号位点等主要结构区域。PSI-BLAST比对表明,宽体沙鳅-actin氨基酸与真鲷、罗非鱼、虹鳟等鱼类同源性达99%。NJ法系统进化分析显示宽体沙鳅-actin首先与鲢聚在一起,然后与、尖头等鱼类聚在一起。荧光定量PCR检测-actin基因在宽体沙鳅脑、鳃、心脏、肝、胃等12个组织的表达无显著差异(P<0.05),具有良好的稳定性。
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关 键 词: | 肌动蛋白 宽体沙鳅 cDNA 组织表达 |
收稿时间: | 2012-05-27 |
修稿时间: | 2012-07-29 |
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