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| 坚强芽孢杆菌(Bacillus firmus)16S—23S rDNA 间区的克隆及多态性分析 | |
| 引用本文： | 王海亮,李 赟,董萍萍,宋晓玲,黄 倢.坚强芽孢杆菌(Bacillus firmus)16S—23S rDNA 间区的克隆及多态性分析[J].海洋与湖沼,2013,44(2):519-524. |
| 作者姓名： | 王海亮 李 赟 董萍萍 宋晓玲 黄 倢 |
| 作者单位： | 1. 中国海洋大学水产学院 青岛 266003; 中国水产科学院黄海水产研究所 青岛 266071 2. 中国海洋大学水产学院 青岛 266003 3. 中国水产科学院黄海水产研究所 青岛 266071 4. 中国水产科学院黄海水产研究所 青岛 266071; 中国海洋大学水产学院 青岛 266003 |
| 基金项目： | 公益性行业(农业)科研专项经费资助, 201103034 号; 现代农业产业技术体系专项资金资助, CARS-47 号 |
| 摘 要： | 采用16S和23SrDNA保守区设计的引物对两株坚强芽孢杆菌(Bacillus firmus)16S—23SrDNA间区(Intergenic spacer region,ISR)进行了PCR扩增,并克隆到pMD18-T载体上进行测序;利用生物信息学进行了16S—23SrDNA间区序列及其内所含tRNA基因的分析。2株坚强芽孢杆菌共得到11条16S—23SrDNA间区特征区带(包括300、400、500和600bp等)序列,ISR类型包括ISR0、ISRG、ISRIA和ISRGLV四种,其中ISR0、ISRG和ISRIA可能在坚强芽孢杆菌中普遍存在。相同类型的ISR序列具有较高的相似性(达52.2%—100.0%),而不同类型的ISR序列间差异较大。此外,ISR序列在靠近16S和23S区域存在不同长度的保守区域,可能成为针对坚强芽孢杆菌特异性检测的引物和探针的靶区,这也为坚强芽孢杆菌新的检测方法的建立奠定了基础。坚强芽孢杆菌的16S—23SrDNA间区序列及其多态性分析均为首次报道。 |
| 关 键 词： | 坚强芽孢杆菌 16S—23SrDNA间区 tRNA基因 多态性分析 |
| 收稿时间： | 2012/5/29 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2012/7/24 0:00:00 |
CLONING AND ANALYSIS OF THE POLYMORPHISM OF THE 16S-23S rDNA INTERGENIC SPACER REGIONS OF BACILLUS FIRMUS |
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| WANG Hai-Liang,LI Yun,DONG Ping-Ping,SONG Xiao-Ling and HUANG Jie.CLONING AND ANALYSIS OF THE POLYMORPHISM OF THE 16S-23S rDNA INTERGENIC SPACER REGIONS OF BACILLUS FIRMUS[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2013,44(2):519-524. | |
| Authors: | WANG Hai-Liang LI Yun DONG Ping-Ping SONG Xiao-Ling and HUANG Jie |
| Institution: | Fishery College, Ocean University of China;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences;Fishery College, Ocean University of China;Fishery College, Ocean University of China;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences |
| Abstract: | |
| Keywords: | Bacillus firmus 16S-23S rDNA intergenic spacer region tRNA gene polymorphic analysis |
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