| 合浦珠母贝基因组微卫星富集文库的构建与分析 |
| |
| 作者姓名： | 油九菊 范嗣刚 黄桂菊 郝博飞 陈飞飞 喻达辉 |
| |
| 作者单位： | 农业部南海渔业资源开发与利用重点实验室, 南海生物资源与开发利用协同创新中心, 中国水产科学研究院 南海水产研究所;上海海洋大学 水产与生命学院,农业部南海渔业资源开发与利用重点实验室, 南海生物资源与开发利用协同创新中心, 中国水产科学研究院 南海水产研究所,农业部南海渔业资源开发与利用重点实验室, 南海生物资源与开发利用协同创新中心, 中国水产科学研究院 南海水产研究所,农业部南海渔业资源开发与利用重点实验室, 南海生物资源与开发利用协同创新中心, 中国水产科学研究院 南海水产研究所;上海海洋大学 水产与生命学院,农业部南海渔业资源开发与利用重点实验室, 南海生物资源与开发利用协同创新中心, 中国水产科学研究院 南海水产研究所;上海海洋大学 水产与生命学院,农业部南海渔业资源开发与利用重点实验室, 南海生物资源与开发利用协同创新中心, 中国水产科学研究院 南海水产研究所 |
| |
| 基金项目： | 国家贝类产业技术体系项目(CARS-48); 国家自然科学基金项目(31372525); 广东省海洋渔业科技推广专项项目(A201301A02) |
| |
| 摘 要： | 采用生物素标记的(AC)_(15)探针和磁珠富集法构建合浦珠母贝(Pinctada fucata)基因组DNA微卫星富集文库。随机挑选2097个克隆进行筛选,得到483个候选克隆(23.03%),对其中135个阳性克隆测序分析发现122个克隆含有微卫星重复单元(90.37%)。进一步通过序列比对,最终得到65个具有特异微卫星序列的阳性克隆(53.28%),其中包含85个微卫星DNA结构域,其中完美型(perfect)70个,占82.36%;非完美型(imperfect)7个,占8.24%;混合型(compound)8个,占9.41%,重复次数主要分布在5~20(95.74%),平均重复次数为7.83,(AC/GT)n重复所占比例最高(75.53%)。基于微卫星两端的侧翼序列,利用Primer Premier 5.0设计引物,获得11对具有多态性的微卫星引物。本研究为开展合浦珠母贝分子育种及资源评价分析提供了基础资料。
|
| 关 键 词： | 合浦珠母贝(Pinctada fucata) 微卫星 磁珠富集 |
| 收稿时间： | 2014-12-20 |
| 修稿时间： | 2015-02-21 |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《海洋科学》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《海洋科学》下载全文 |
|
