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网箱养殖海区底泥产芽孢细菌多样性
引用本文:温 丹,张德民,初 航.网箱养殖海区底泥产芽孢细菌多样性[J].海洋与湖沼,2009,40(5):615-621.
作者姓名:温 丹  张德民  初 航
作者单位:宁波大学生命科学与生物工程学院,"应用海洋生物技术"教育部重点实验室,宁波,315211
基金项目:浙江省自然科学基金人才培养项目,R305333号;;长江学者和创新团队发展计划(PCSIRT)资助;;“高效海水养殖与灾害响应机制”,IRT0734号;;国家科技基础条件平台建设项目(2005DKA2120609)资助
摘    要:采用培养与16S rRNA基因序列比对的方法,对海水网箱养殖区底泥中的可培养细菌进行研究。结果表明,网箱正下方的产芽孢细菌比例高达50%,随着离网箱距离的增加,产芽孢细菌的比例明显降低,200m远时,其比例降至17%。从3个采样点分离纯化出91株产芽孢细菌,对其菌落形态、菌体形态的研究和部分菌株16S rRNA基因的DGGE带型和序列分析表明,91株产芽孢细菌中,有85株属于芽孢杆菌属(Bacillus)的10个种,25个发育型;6株属于盐芽孢杆菌属(Halobacillus)的1个种,3个发育型。芽孢杆菌属的B.marisflavi、B.baekryungensis、B.aquaemaris、B.pumilu等4个种为优势类群。此外,接近半数的产芽孢细菌能代谢含硫化合物,部分菌株能够还原硝酸盐或分解无机磷化合物,仅有3株菌具有亚硝酸盐还原作用。

关 键 词:产芽孢细菌  海水网箱养殖  底泥  16S  rRNA基因  多样性  
收稿时间:2008/3/27 0:00:00
修稿时间:2008/5/19 0:00:00

DIVERSITY OF SPORE-FORMING BACTERIA IN MARINE SEDIMENTS BELOW FISH-CAGE
WEN Dan,ZHANG De-Min and CHU Hang.DIVERSITY OF SPORE-FORMING BACTERIA IN MARINE SEDIMENTS BELOW FISH-CAGE[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2009,40(5):615-621.
Authors:WEN Dan  ZHANG De-Min and CHU Hang
Institution:Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology;Ministry of Education;Faculty of Life Science and Biotechnology;Ningbo University;Ningbo;315211
Abstract:Spore-forming bacteria have been widely studied for their capability to secrete various extracellular enzymes such as proteaes,amylase etc.,but less for their distribution and ecological roles in natural environment.The diversity of spore-forming bacteria in marine sediments of cage culture area were investigated in this paper.Results indicate that the proportion of spore-forming bacteria in sediment just below cage is as much as 50% of culturable heterotrophic bacteria.Distant from cage,the proportion of s...
Keywords:Spore-forming bacteria  Marine cage culture  Sediment  16s rRNA gene  Diversity  
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