波吉卵囊藻胞外滤液对铜绿微囊藻转录水平的影响 |
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引用本文: | 王孝谦,黄翔鹄,李长玲,罗国玲,张宁,王新宇,张玉蕾.波吉卵囊藻胞外滤液对铜绿微囊藻转录水平的影响[J].广东海洋大学学报,2021(2). |
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作者姓名: | 王孝谦 黄翔鹄 李长玲 罗国玲 张宁 王新宇 张玉蕾 |
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作者单位: | 广东海洋大学水产学院;广东海洋大学广东省藻类养殖及应用工程技术研究中心 |
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基金项目: | 广东省普通高校青年创新人才项目(2018KQNCX102,2018KQNCX110)。 |
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摘 要: | 【目的】探索波吉卵囊藻胞外滤液对铜绿微囊藻的抑制机理。【方法】采用Illumina平台,对使用BG11培养基(对照组)和波吉卵囊藻胞外滤液(实验组)培养的铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)进行转录组测序,筛选差异表达基因并进行通路富集分析,并对部分差异表达基因进行qRT-PCR验证。【结果】与对照组相比,波吉卵囊藻胞外滤液处理后的铜绿微囊藻组中筛选1483个表达差异显著的基因,其中上调表达基因788个,下调表达基因695个。GO功能分析将差异基因划分为35个子类别,包括催化活性、结合、代谢过程、细胞过程、膜、膜部分等。KEGG通路分析中,所有差异基因聚集在108个通路,其中84个差异基因注释在代谢功能类别中,而氧化磷酸化通路富集最显著。氧化磷酸化通路中,相关基因表达以上调为主(26个DEGs,20个上调,6个下调)。qRT-PCR验证结果与转录组测序结果的表达变化趋势一致。【结论】波吉卵囊藻滤液引起铜绿微囊藻氧化磷酸化途径上基因表达上调,ATP合成效率提高。
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关 键 词: | 铜绿微囊藻 胞外滤液 转录组 波吉卵囊藻 化感作用 差异表达基因 基因功能 |
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