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基于全基因组重测序对ARTP诱变的一株高产淀粉酶韩国普李斯特氏菌的关键基因研究
作者姓名:何伟  王灵  刘景川  黄仕新  李菁菁  黄家琪  龙腾  吴鹏  范坚强  邓小华  陈善义  陈义强  唐旭
作者单位:福建中烟工业有限责任公司技术中心,福建 厦门 361021;自然资源部第三海洋研究所,福建 厦门 361005;龙岩烟草工业有限责任公司,福建 龙岩 364320;福建省海洋碳汇重点实验室,厦门大学,福建 厦门361102
基金项目:福建中烟技术开发合作项目 (FJZYHZJH2020006);国家自然科学基金(42188102);福建省海洋碳汇重点实验室(厦门大学)开放基金课题(FKLMCS2023006,FKLMCS2023005);厦门市海洋发展局青年科技创新项目(23YYZP010QCA18)
摘    要:为提高一株海洋来源的韩国普李斯特氏菌(Priestia koreensis FS 1)产淀粉酶的能力,对该株菌采用常压室温等离子体(atmospheric and room temperature plasma, ARTP)技术进行了诱变选育。结果显示:经过诱变选育后得到一株产淀粉酶活力较原始菌株提高了90%且稳定遗传的突变菌株P. koreensis FS 103。为解析该突变菌株酶活力增加的分子机制,对突变菌株P. koreensis FS 103进行了全基因组重测序及比对分析研究。相关分析显示:首先,P.koreensis FS 103的基因组中乙酰化修饰、抗氧化作用以及同义突变相关的基因发生了遗传变异;其次,对COG(clusters of orthologous groups)功能和变异基因进行富集分析,P. koreensis FS 103转录、翻译和翻译后修饰过程相关基因均上调。经过ARTP诱变以后的突变菌株P. koreensis FS 103淀粉酶活力提升的原因是以上功能基因发生上调效应。

关 键 词:海洋生物学  常压室温等离子体(ARTP)  韩国普李斯特氏菌  淀粉酶  全基因组重测序
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