| 泥蚶(Tegillarca granosa)血细胞转录组序列中免疫相关基因的结构与mRNA表达量分析 |
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| 引用本文： | 钟爱华,储张杰,王伟洪,牟毅.泥蚶(Tegillarca granosa)血细胞转录组序列中免疫相关基因的结构与mRNA表达量分析[J].海洋与湖沼,2020,51(2):354-363. |
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| 作者姓名： | 钟爱华 储张杰 王伟洪 牟毅 |
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| 作者单位： | 浙江海洋大学水产学院 舟山 316022;浙江海洋大学水产学院 舟山 316022;浙江海洋大学水产学院 舟山 316022;浙江海洋大学水产学院 舟山 316022 |
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| 基金项目： | 浙江省"水产"一流学科开放课题,20160012号;国家自然科学基金项目,31700322号。 |
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| 摘 要： | 贝类血细胞直接参与异物吞噬和包囊作用,还在伤口修复、炎症反应过程中发挥重要作用,是机体免疫防御的承担者。本研究采用RNA-seq测序技术研究了鳗弧菌感染前后泥蚶血细胞的转录组序列,通过序列组装,获得了α-葡萄糖苷酶(GAA)、α-甘露糖苷酶(LAMAN)、芳基硫酸酯酶B(ASB)、天冬酰胺氨基葡萄糖酶(AGA)、整合素β3亚基(ITB3)、热休克蛋白9(HSPA9)和Toll相互作用蛋白(TOLLIP)序列,利用Orffinder获得了其编码蛋白序列,并对蛋白序列进行了理化性质、二级结构、保守结构域和三级结构分析。结果表明:7种蛋白质二级结构均含有α螺旋、β折叠及无规则卷曲,泥蚶和人类ITB3和TOLLIP具有相同的保守结构域, Swiss-model同源建模获得的三级结构与模板同源性均超过35%(TOLLIP除外)。鳗弧菌刺激后,GAA、LAMAN、ASB、AGA和HSPA9的表达量显著增加,ITB3和TOLLIP表达量变化不明显。该研究补充和完善了对泥蚶免疫相关基因的认识,并为进一步开展泥蚶抗病机理研究提供了重要的理论依据。
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| 关 键 词： | 泥蚶 血细胞 转录组测序 免疫基因 |
| 收稿时间： | 2019/12/8 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/1/6 0:00:00 |
ANALYSIS OF THE STRUCTURE AND EXPRESSION OF IMMUNE-RELATED GENES IN BLOODY CLAM TEGILLARCA GRANOSA BASED ON HAEMOCYTE TRANSCRIPTOME SEQUENCING |
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| ZHONG Ai-Hu,CHU Zhang-Jie,WANG Wei-Hong and MOU Yi.ANALYSIS OF THE STRUCTURE AND EXPRESSION OF IMMUNE-RELATED GENES IN BLOODY CLAM TEGILLARCA GRANOSA BASED ON HAEMOCYTE TRANSCRIPTOME SEQUENCING[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2020,51(2):354-363. |
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| Authors: | ZHONG Ai-Hu CHU Zhang-Jie WANG Wei-Hong and MOU Yi |
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| Institution: | School of Fishery, Zhejiang Ocean University, Zhoushan 316022, China,School of Fishery, Zhejiang Ocean University, Zhoushan 316022, China,School of Fishery, Zhejiang Ocean University, Zhoushan 316022, China and School of Fishery, Zhejiang Ocean University, Zhoushan 316022, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | bloody clam Tegillarca granosa haemocyte RNA sequencing immune-related gene |
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