| 基于四种水产病原弧菌的简型芯片检测体系的优化 |
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| 引用本文： | 朱鹏飞,李壹,王宗灵,曲凌云.基于四种水产病原弧菌的简型芯片检测体系的优化[J].海洋科学进展,2015,33(2):257-269. |
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| 作者姓名： | 朱鹏飞 李壹 王宗灵 曲凌云 |
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| 作者单位： | 1. 国家海洋局第一海洋研究所,山东青岛,266061
2. 国家海洋局第一海洋研究所，山东青岛266061; 中国海洋大学海洋生命学院，山东青岛266003 |
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| 基金项目： | 国家海洋局海洋公益性行业科研专项---重要鱼类增养区致病细菌基因芯片检测技术研究开发与示范(201105007-1)；国家科技支撑计划---海洋水产病毒实用化检测及预警技术的建立与应用 |
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| 摘 要： | 基因芯片技术在病原菌检测领域展现出良好的前景,本文依托水产病原菌基因检测芯片的检测体系,以水产常见病原弧菌的hsp60、toxR基因检测探针为研究对象,系统研究不同点样液配方、寡核苷酸探针浓度、荧光标记物质浓度、杂交温度、杂交时长对芯片杂交效果的影响,并进行相应优化。结果表明,杂交温度为60℃、杂交时长为2h、探针浓度为1μmol/L、Cy3标记的随机引物的用量为150pmol时,芯片的经济性、灵敏度、检测效率达到均衡;以0.1mol/L磷酸氢二钠和25%二甲基亚砜混合溶液作为点样液,效果较好。优化后的芯片对4种弧菌的检测没有出现交叉杂交现象,探针特异性达到100%;对溶藻弧菌全基因组DNA检测灵敏度为10fg,高出PCR方法约2个数量级。
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| 关 键 词： | 弧菌 基因芯片 点样液 优化 |
Optimization of DNA Microarray Detection System for Aquaculture Pathogenic Vibrios |
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| ZHU Peng-fei,LI Yi,WANG Zong-ling,QU Ling-yun.Optimization of DNA Microarray Detection System for Aquaculture Pathogenic Vibrios[J].Advances in Marine Science,2015,33(2):257-269. |
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| Authors: | ZHU Peng-fei LI Yi WANG Zong-ling QU Ling-yun |
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| Institution: | ZHU Peng-fei;LI Yi;WANG Zong-ling;QU Ling-yun;The First Institute of Oceanography,SOA;College of Marine Life Sciences,Ocean University of China; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | vibrio DNA microarray spotting buffer optimization |
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