基于MALDI-TOF MS快速鉴定弧菌的数据库的扩展和应用

近年来由海洋细菌导致的感染越来越常见，弧菌是海洋细菌中最常见的细菌之一。目前，对弧菌缺乏快速有效的鉴定。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪（Matrix-assisted laser desorption ionization–time of flight mass spectrometry，MALDI-TOF MS）已成为快速鉴别细菌强有力的工具。然而，它的准确性取决于数据库中的菌株数量。本研究中，我们利用MALDI-TOF MS对弧菌数据库进行了扩展和应用。我们将74株弧菌纳入了新的数据库，构建了基于RpoB序列的进化树（邻接法和最大似然比法），并针对扩展后数据库和扩展前数据库进行了聚类分析。我们利用30株弧菌，对扩展后数据库进行了评价，并进行了主成分分析。本研究中，我们创建了一个新的数据库，促进了弧菌的快速准确鉴定。MSP(main spectrum profile)和PCA（Principal Component Analysis）分析为追踪弧菌感染的来源和发生率提供了理论支持。此外，特征峰和差异峰的发现对弧菌的鉴定也有帮助。