鲤鱼血红蛋白信息核糖核酸(HbmRNA)的分离

信息核糖核酸(mRNA)是十分重要的生物活性物质。基因通过转录作用合成mRNA,再由mRNA翻译,编码特定的蛋白质顺序。因此,mRNA是基因和蛋白质之间的桥梁。不仅如此,某些病毒还可以用mRNA反转录编码DNA的程序。一些学者还发现某些高等动物     

氨基糖酸在药物分子设计与合成中的应用

用非天然的分子实体模拟天然活性分子以提高药物的活性和稳定性.是药物化学中的一个研究热点。氨基糖酸综合了糖和氨基酸结构特征和化学反应特性.是一类新型非天然的多肽模拟物构建模块,广泛的应用在多肽模拟学、组合化学和人工受体分子的构建中。本文综述了近年来氨基糖酸在药物分子设计与合成中的应用进展。     

对虾对饵料蛋白质及氨基酸吸收利用的研究

用51Cr₂O₃作指示物,研究了对虾(Penaeus orientalis)消化道不同部位对饵料蛋白质和结合态、游离态氨基酸的消化吸收特点;以[3H]赖氨酸作示踪剂,进一步研究了饵料游离氨基酸在对虾体内的转运、分布及参与蛋白质合成的问题,并了解不同投饵方式对这些过程的影响.结果表明,在胃中进行旺盛的消化活动,营养物质主要通过中肠腺吸收,由此进人循环系统,被输送到各组织器官,中肠也具有较强的消化吸收能力.饵料游离氨基酸不能与结合态氨基酸同步吸收,以致其结合率低下,多次投饵可提高其结合率.     

文蛤抗癌多肽对N-乙酰-β-D氨基葡萄糖苷酶活力的影响

从文蛤体中分离纯化得到了抗癌多肽,研究该多肽对N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(NAGase)活力的影响,结果显示文蛤抗癌多肽对该酶有明显的抑制作用.在本文中,我们将深入地研究其抑制作用机理和抑制效应类型,结果表明:随着文蛤多肽加入量的增大,该酶活力呈指数下降,测得导致酶活力下降50%的抑制剂浓度(IC50)为112.9 μg/cm3,该多肽对酶的抑制作用是一种可逆过程,抑制机理表现为混合型抑制类型,对游离酶(E)的抑制常数(KI)和酶-底物络合物的抑制常数(KIS)分别为77.03和697.44μg/cm3,说明文蛤抗癌多肽与游离酶的结合导致酶活力的丧失,明显的强于对酶-底物络合物的抑制效应,底物的存在对该酶被文蛤抗癌多肽抑制作用起了保护作用.     

废弃鱼骨中蛋白质的提取分离及酶解工艺研究

以蛋白提取率和多肽分子质量分布为评价指标,采用不同提取方法和不同蛋白酶对废弃鱼骨蛋白质的提取和酶解工艺进行了研究。结果表明,高压蒸煮法提取的鱼骨蛋白质中蛋白含量为86.15%,蛋白提取率为16.76%,明显高于恒温水浴和热回流提取法。中性蛋白酶酶解的多肽中蛋白含量为88.46%,多肽比例高达95%以上,明显高于其他三种酶。先利用高压提取法提取蛋白质,再利用中性蛋白酶酶解蛋白质制备多肽,可降低酶用量,该方法为多肽工业化生产提供参考及新思路。     

蛋白质的氨基酸和核酸的核苷酸顺序

氨基酸顺序是蛋白质结构的基础,核苷酸的顺序是RNA和DNA分子结构的基础。这些化合物是决定整个生物活性物质的性质的。在分析蛋白质的氨基酸顺序之前,必须先确定该蛋白质是否含有一条以上的肽链。多肽链的数目通常从测定每分子蛋白质所含N-末端氨基酸残基的数目推导出来。显然,每分子蛋白质所含N-末端的数目应与其肽链数目相等。如果肽链之间没有共价交联,可以用酸、碱、高浓度的盐或变性剂分离它们。     

仿刺参(Apostichopus japonicus)和海地瓜(Acaudina leucoprocta)体壁多肽的响应面法酶解和N末端测序

为充分开发利用海参资源,优化海参体壁酶解工艺,鉴定海参多肽,本文以水解度为指标,设计了3因素(时间、温度和加酶量)3水平的响应面实验,得到海参水解的最优条件是:仿刺参(Apostichopus japonicus)体壁在加酶量1.97%、温度55.7°C、水解136.8min的条件下,水解度为83.39%;海地瓜(Acaudina leucoprocta)体壁在加酶量1.70%、温度55.4°C、水解115.6min的条件下,水解度为63.68%。之后通过使用超滤膜、反相高效液相色谱(RP-HPLC)、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)技术和蛋白测序仪等分析手段从水解产物中分离鉴定出4种多肽。其中,经N端序列鉴定出仿刺参多肽S1、S2氨基酸残基序列分别为Gly-Pro-Val-Gly-Ala-Ser-Gly-Pro-Gln-Gly-ProGln-Gly-Pro-Gln-Gly-Leu-Ser-Ala-Leu和Trp-Pro-Pro-Gly-Asn-Ser-Gly-Ile-Gln-Gly。海地瓜多肽A1和A2氨基酸残基序列分别为Gly-Ala-Asn-Gly-Asn和Trp-Leu-Pro-Gly-Asp-Thr-Gly-Pro-Gln-GlyVal-Thr-Gly-Pro-Val-Gly-Pro-Ala-Gly。     

营养素对鱼类脂肪肝病变的影响

综述了营养性脂肪肝的病理特征与诱病因素,特别是饲料中脂肪、蛋白质和碳水化合物等主要营养素组配不平衡对鱼类脂肪肝病变的诱导作用。并对鱼类肝脏脂肪积累和转运的调节机制进行阐述,指出肝脏脂肪主要来自对饲料中脂肪的直接吸收以及饲料中过量蛋白质和糖类的转化合成,过多的脂肪累积于肝脏中则引起肝脏代谢紊乱。作为脂类载体,脂蛋白将脂肪转运出肝脏,然后再转运至其他组织中再利用或在脂肪组织中储存。介绍了高度不饱和脂肪酸、磷脂、胆碱、甜菜碱和肉碱等抗脂肪肝物质的作用途径和作用效果。最后指出通过平衡营养组成和调控肝脏中脂肪的来源与去路,可望实现对脂肪肝的预防和治疗。     

漳州西施舌线粒体基因组全序列:腔蛤蜊属存在新种的证据

利用长PCR扩增漳州西施舌线粒体DNA(ZZ-mtDNA),用引物步移法测序,获得线粒体基因组DNA全序列,研究其基因组特点。结合双壳类49个物种线粒体全基因组,分析基因间核苷酸和蛋白质氨基酸序列的差异,构建系统进化树,探讨漳州西施舌系统演化地位。研究结果表明:漳州西施舌线粒体基因组DNA全长17 199 bp,A+T含量为64.2%,编码36个基因,其中12个蛋白质编码基因,22个转运RNA基因(tRNAs),2个核糖体RNA基因(lrRNA 和srRNA),全部基因均位于重链上,tRNASer为单拷贝,tRNAMet为双拷贝;非编码区占10.9%(1 882 bp/17 199 bp),其中,主非编码区为882 bp,与RZ-mtDNA主非编码区差异明显,另有一个较大(400 bp)的非编码区为漳州西施舌特异性非编码区;以双壳纲帘蛤目文蛤属3种贝类、贻贝目贻贝属4种贝类、珍珠贝目牡蛎科的6种贝类为参照,对编码基因的核苷酸序列和蛋白质氨基酸序列进行差异分析显示,漳州西施舌与日照西施舌达到了种间差异水平。线粒体基因组编码的基因、tRNA组成、非编码区均揭示漳州西施舌是腔蛤蜊属的一个新种。     

核蛋白体

核蛋白体的化学组成是核糖核酸与蛋白质。它的结构也颇为复杂,由两种不同亚基组成,每种亚基有一套独特的核糖核酸(rRNA)和结构蛋白质。在行使蛋白质合成时,单独一种亚基起不了作用,然而两种亚基各自履行着不同的职责。 核蛋白体的两个亚基,一个较小,另一个较大,分别称为“小亚基”和“大亚基”,它们以s值表示     

海洋活性多肽的研究进展

根据海洋活性多肽是近年来新药研究热点的现状 ,本文对天然存在的海洋活性多肽和海洋蛋白酶解活性肽的研究进展进行了综述。为进一步开展海洋活性多肽的研究提供参考。     

应用新一代测序技术测定大室别藻苔虫线粒体基因组全序列

线粒体基因组的获得传统上通常是采取长PCR结合鸟枪法或步移法测序。近年来新一代测序技术蓬勃发展,以454,Solexa和SOLiD测序平台为代表。应用新一代高通量测序技术(Solexa)并结合巢式PCR扩增,完成了大室别藻苔虫(Membranipora grandicella)的线粒体基因组全序列。大室别藻苔虫线粒体基因组是目前国际上获得的第一条苔藓动物软壁亚目线粒体基因组全序列,基因组全长为15861 bp,比已完成的4种苔藓动物线粒体基因组略大。大室别藻苔虫线粒体基因组包含13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因和20个转运RNA基因。通过与已测得的苔藓动物进行比较,发现目前已完成的5个苔藓动物线粒体基因组的基因排列顺序显著不同。苔藓动物线粒体基因组基因排列的比较,今后可能会成为探讨该类群系统演化关系的重要信息来源。     

S7核糖体蛋白基因片段序列变异与花鲈属鱼类系统发育研究

对中国和日本海域花鲈属的3个种:花鲈(Lateolabrax maculatus)、鲈鱼(L. japoni-cus)和高体鲈(L. latus)的S7核糖体蛋白基因片段序列进行了扩增和序列测定,分析比较了3个种23个个体间的序列差异。在456bp的S7核糖体蛋白基因片段中,3个高体鲈个体中出现了3种单倍型,种内个体间有2个碱基差异;7个花鲈个体中出现了7种单倍型,种内个体间有21个碱基差异;13个鲈鱼个体中出现了12种单倍型,种内个体间有22个碱基差异。结果表明,花鲈属S7核糖体蛋白基因片段序列具有丰富的遗传信息,在亲缘关系较近的物种间也存在显著的序列差异,基于S7核糖体蛋白基因片段序列的NJ和ME系统树经1000次重复抽样检验后得到相似结果,表明S7基因内含子2是适合于研究分子系统发育的分子标记。利用Modeltest选取最佳核苷酸替代模型构建的NJ树表明:花鲈属鱼类由高体鲈分化,花鲈与鲈鱼的亲缘关系很近,而与高体鲈的亲缘关系较远。     

对虾白斑综合症病毒vp15基因的RNA干扰研究

VP15是对虾白斑综合症病毒(WSSV)的一种核衣壳蛋白,以往的研究表明VP15属DNA结合蛋白,具有潜在的浓缩包装病毒基因组的功能.利用RNAi技术将vp15基因沉默,来研究vp15基因沉默后对WSSV增殖及结构的影响.体外合成了vp15基因的特异双链RNA(vp15-dsRNA)和非特异双链RNA(gfp-dsRNA),分别与WSSV混合共注射淡水原克氏螯虾.在感染后24、36、48 h,每个实验组分别取病虾步足肌肉,样品用Trizol试剂盒提取RNA用于RT-PCR检测、用病毒检测试剂盒提取DNA模板用于荧光定量PCR分析.另外每组随机选取1只虾,取中肠,用于树脂包埋组织超薄切片分析.逆转录PCR分析结果显示vp15-dsRNA能特异性敲除vp15基因转录表达,实时荧光定量PCR分析结果显示vp15-dsRNA干扰vp15基因的表达能有效抑制WSSV病毒粒子的增值.此外,利用树脂包埋组织超薄切片电子显微镜技术观察发现vp15基因被干扰后病毒粒子数量上明显降低并且引起病毒粒子包装异常.通过vp15基因特异dsRNA干扰,有效抑制了WSSV病毒增殖,此外进一步阐明VP15蛋白的功能及其在病毒组装方面的重要作用,对进一步了解病毒组装以及病毒防治具有重要的意义.     

pH对SPE-HPLC-ESI-Q-TOF-MS检测海水中小分子活性物质的影响研究

海水溶解有机物(dissolvedorganicmatter,DOM)中含有的生物活性物质在海洋生态系统中作用巨大,但因缺乏适合的分离提取方法而严重阻碍了对其不同组分在生态系统中作用的探索。固相萃取法对富集提取海水DOM十分有效,在用其提取海水DOM时,海水pH对活性物质提取效果的影响很大,但目前针对海水的这种影响尚存在很大争议。本文以天然近海海水作为基质,探究不同pH条件下用亲水-疏水平衡(hydrophilic-lipophilicbalanced,HLB)固相萃取小柱萃取海水中活性分子的提取效率,并使用高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(HPLC-Q-TOF-MS)在负离子(ESI-)模式下检测解析提取物的组成。研究结果表明,当海水样品pH为中性和强酸性时都能获得较好的提取效率,随着pH的降低,提取物质谱的整体响应值降低,但可识别的谱峰数目增加,提取出有机物的分子量和性质差异都更广泛。分析提取物分子在范克雷维伦(van Krevelen)图和质荷比-氢碳比(m/z-H/C)图上的分布发现,中性条件适合提取饱和度较高的小分子化合物,而具有生物活性的带有不饱和基团的化合物及蛋白质、糖类等生物大分子在强酸性提取条件时提取效果和分辨率更好。综合提取效率、有效峰数目和分子组成特征考虑,用HLB固相萃取小柱提取近海海水中的小分子活性物质时,将海水样品pH调节为2较为适宜。     

海水养殖中原生动物病原虫的鉴定- Ⅱ粘孢子虫的研究及鉴定方法 "

粘孢子虫是海水养殖中常见的危害性原生动物类群之一.该文综合介绍一套适用于粘孢子虫研究及鉴定的方法;粘孢子虫的标本采集、标本保存、观察与描述、研究技术以及特征性鉴别与量度的图解式方法;若干现代技术,并作初步讨论.     

Reflectivity template,a quantitative intercept-gradient AVO analysis to study gas hydrate resources – A case study of Iranian deep sea sediments

Presence of gas hydrate and free gas in Iranian part of Makran accretionary prism changes the elastic properties of unconsolidated sediments and produces sharp bottom simulating reflectors (BSRs) which are observed on the 2-D seismic data. Different methods have been applied to estimate the gas hydrate and free gas saturations in marine sediments based on seismic measurements. Most of these methods are based on relating the elastic properties to the hydrate and free gas saturations and remotely estimating their concentration. In this regard, using the effective medium theory (EMT) which was developed for different modes of hydrate distribution is more considered among other rock physics theories. The main concern about saturation estimations based on EMT is that the velocities of the hydrate-bearing sediments primarily depend on how they are distributed within the pore space. Therefore, understanding the modes of hydrate distribution (at least cementing or non-cementing modes) is necessary to decrease the estimation uncertainties.The first intention of paper is to investigate amplitude variation versus offset (AVO) analysis of BSR to determine the hydrate distribution modes. The results from the probable saturation revealed that if the hydrate cements the sediment grains, BSR would show the AVO class IV and if hydrate does not cement the sediment grains, then BSR would show either the AVO class II or class III depending on the free gas saturation just beneath the BSR. The second intention of paper is to introduce some templates called reflectivity templates (RTs) for quantitative study of hydrate resources. These templates are provided based on the EMT to quantify the hydrate and free gas near the BSR. Validation of this approach by synthetic data showed that a reliable quantification could be achieved by intercept-gradient RTs, only if these attributes are determined with a high accuracy and good assumptions are made about the mineralogical composition and porosity of the unconsolidated host sediments. The results of this approach applied to a 2-D marine pre-stack time migrated seismic line showed that less than 10% of the gas hydrate accumulated near to the BSR in anticlinal-ridge type structure of Iranian deep sea sediments. The free gas saturation near to the BSR by assuming a homogeneous distribution was less than 3% and by assuming patchy distribution was about 3–10%.     

繁茂膜海绵中具有促进细胞粘附成团作用蛋白质的分离纯化研究

用凝胶层析和离子交换层析方法从黄海的繁茂膜海绵(Hymeniacidon perleve)中分离得到一种蛋白质D1,相对分子质量为2,3ku,pI为6．6。纯化的蛋白质富含疏水性氨基酸和酸性氨基酸。研究表明蛋白质D1对繁茂膜海绵细胞培养表现出很强的使海绵细胞贴壁且快速粘附成团的作用。凝集实验表明该蛋白对人的A、B、O、AB血,兔和鼠的红细胞没有凝集活性。     

海洋真菌多样性的研究进展

海洋微生物作为海洋生物的一个组成，有其独特的特性，耐盐性不能作为区分海洋型与陆生型微生物的标志。本文对海洋真菌的的界定、数量、附着基质、生态类型以及其产生的生物活性物质做了概述。