深海化能极端环境中劳盆拟刺铠虾(Munidopsis lauensis)的全长转录组测序分析

劳盆拟刺铠虾(Munidopsis lauensis)是一种十足目铠甲虾, 能够适应深海化能合成生态系统的极端环境, 但是其已知基因序列信息却很少。为此, 采用PacBio平台的SMRT测序技术对来自南海台西南冷泉劳盆拟刺铠虾的肝胰腺、鳃、肌肉和肠混合组织进行了三代全长转录组测序。通过聚类、校正、去冗余之后共获得28 811条高质量isoform, 平均长度为2 086 bp, N50长度为2 275 bp。使用Nr、SwissPort、KEGG、KOG数据库对转录本序列进行功能注释, 共有20 616 (71.56%)条isoform得到注释。进一步高级注释共获得21 848个蛋白编码序列, 共预测到537个转录因子、6 430个长链非编码RNA和10 060个SSRs位点。KEGG通路分析发现两条可能与劳盆拟刺铠虾适应深海化能极端生境相关的通路, 分别为过氧化物酶体通路和谷胱甘肽代谢通路。其中, 共有180条isoform被发现参与编码过氧化物酶体通路中的31个关键酶, 213条isoform参与谷胱甘肽代谢通路中19个关键酶的编码。基于全长转录组数据, 利用同源比对、功能结构域预测及系统发育树构建等方法对劳盆拟刺铠虾谷胱甘肽S-转移酶(GST)基因家族进行挖掘与鉴定, 共发现属于theta、delta、mu、kappa四种亚家族的20条GST候选序列。通过对劳盆拟刺铠虾全长转录组测序、功能注释和环境适应相关的重要基因及通路的分析, 不仅丰富了深海组学数据资源, 也为进一步揭示甲壳动物适应深海化能极端环境的分子机制奠定了基础。     

云南米虾研究及新种的描述

本文报道了云南省的米虾共9种,其中包括4新种。标本采于1983年3—6月。其新种为:1.滇池米虾:额角上缘和后缘的齿均多,且其末端有1/3—1/2的无齿区。2.异指米虾:额角上、下缘的齿均多,第三步足雄性指节较雌性宽阔,且刺也显著粗大。3.长棍米虾:第二腹肢的雄性附肢特别延长而多刺。4.喻氏米虾:额角下缘齿数显著多于葛氏米虾。     

匙指虾新种记述

本文报道匙指虾二新种和一新亚种。新种为异足新米虾Neocaridinaheteropodasp nov 和紫金拟米虾Paracaridinazijinicasp nov ,新亚种为同刺新米虾Neocaridinaeuspinosahomospinasubsp nov 。     

中国的葛氏米虾及其相似种

葛氏米虾Caridina gregoriana生活在云贵高原。经研究,发现它有几个近似种。喻兆琦1938年报道的葛氏米虾,作者认为是两个不同种,但都不是葛氏米虾,应是它的近似种。其一于1985年已证实是分布于滇东南的喻氏米虾Caridina yui;另一的许多重要性状都明显地不同于葛氏米虾,由于其雄性第三、四步足掌节腹缘并不膨大,故命名为狭掌米虾(新种)Caridina leptopropoda sp. nov. 1989年作者发现的是仅生活在跨四川与云南两省泸沽湖的尖肢米虾Caridina acutipoda。1983年5月采自云南楚雄的标本,其许多特征与葛氏米虾有别,认为是新种,因雄附肢周缘列生成对小刺而命名为双刺米虾Caridina bispinosa。     

海中的红衣主教——趣话龙虾

说起龙虾,人们大都会油然生起羡慕之情。龙虾长的名副其实,几分像龙,几分像虾,这便是它亦龙亦虾的特征。龙虾在虾类家族中是个“族长”,向有“虾中之王”的美称。我国有中国龙虾、波纹龙虾、密毛龙虾、锦绣龙虾、杂色龙虾、日本龙虾、少刺龙虾和长足龙虾等8种。个体最大为锦绣龙虾,重4公斤     

DNA条形码技术在仔稚鱼鉴定中的实践

对物种准确鉴定是进行生物多样性研究的前提。为提高物种鉴定的准确性,文章采用DNA条形码技术结合形态学对长江口仔稚鱼样品进行种类鉴定。结果表明,44个样品中,通过线粒体COI基因的分析鉴定有17个种、1个属;部分形态上难以鉴定的种类,如虾虎鱼科的矛尾虾虎鱼、斑尾刺虾虎鱼、睛尾蝌蚪虾虎鱼、褐吻虾虎鱼和斑点竿虾虎鱼,可通过DNA条形码实现有效鉴定;形态较为相似的种类,通过DNA条形码可鉴定到种,淡水鲤科的有青鱼、鲢、鳊,鲻科的有龟鮻和前鳞龟鮻。利用DNA条形码技术结合形态进行仔稚鱼种类的鉴定,能提高仔稚鱼鉴定的精确度。     

长额虾总科分类系统学研究概况及我国长额虾总科研究展望

１长额虾总科简介长额虾总科 (Ｐａｎｄａｌｏｉｄｅａ)属节肢动物门甲壳动物软甲亚纲十足目腹胚亚目真虾次目 ,包括长额虾科(Ｐａｎｄａｌｉｄａｅ)和小海虾科（Ｔｈａｌａｓｓｏｃａｒｉｄｉｄａｅ）两个科。该类群动物体多侧扁 ;头胸部比例较对虾总科者大 ,头胸甲发达 ,完全包被头胸部各体节 ;额角发达而长 ,某些种类额角极长 ;第一触角多具柄刺 ,第二触角鳞片发达 ;眼有柄 ;大颚具臼齿和门齿 ,大颚须通常３节 ;胸部附肢特化为颚足与步足 ,其中颚足３对 ,步足５对 ,第二颚足具７节 ,末节侧面附在第六节上 ,第三颚足具有或不具有外肢 ,第…     

养虾池常用药物对沙蚕的毒性试验

沙蚕养虾能增大对虾规格、提高对虾产量、降低饵料成本、防止池底污染［１］。但目前仍有许多养虾者，自觉或不自觉地利用清池药物将养虾池内的沙蚕杀死，造成一定的损失。为找到虾池常用药物对沙蚕的安全浓度，笔者于１９９２年５～６月用漂白粉、茶子饼、ＣｕＳＯ４、生石灰对沙蚕的毒性进行了试验。１材料和方法１．１试验材料日本刺沙蚕（Ｎｅａｎｔｈｅｓｊａｐｏｎｉｃａ）［２］取自寿光县第二水产养殖公司１１１号养虾池，选用健康、肢体完整的个体，规格２．５～３．５ｃｍ（ＣｕＳＯ４毒性试验沙蚕规格４．５～５．５ｃｍ）。漂白…     

日本刺沙蚕的生态特性及在对虾养殖中的应用

日本刺沙蚕(Neathesjaponica)的生态分布、繁殖发育、摄食等习性非常适合对虾养殖的需要,是对虾养殖中较理想的大型活体生物饵料品种。将其移植到对虾养成池中,既能摄食对虾残饵、粪便等有机污染物,也能被对虾摄食。这样既净化水质,改善养殖环境,减轻养殖废水对海洋的污染,又能降低养虾成本,促进对虾生长,提高对虾自身抗病能力。具有明显的生态效益和经济效益。本文对日本刺沙蚕的生态分布、繁殖发育习性及其在中国对虾养殖中的应用进行了研究,以期对沙蚕资源的开发利用及水产养殖有所帮助。1　生态特性日本刺沙蚕个体较大,成体体长一般为1…     

日本刺沙蚕的性信息素研究

日本刺沙蚕（Ｎｅｒｅｉｓ ｊａｐｏｎｉｃａ）广泛分布于中国沿海，是鱼、虾的优良饵料，冬末春初敏殖时离开河口向盐较高的海区移动。与多齿围沙蚕，褐片阔沙蚕等其它沙蚕不同，日本刺沙蚕在繁殖过程中不出现完全变态，但是与其它沙蚕一样，其繁殖过程也受一组性信息素控制。从雌性熟的日本刺沙蚕体腔液中提取并鉴定出一种有生物活性的挥发性物质－辛二烯－［３，５］－酮－［２］，这种化合物可以增加群浮个体在配子释放之前婚舞     

人工养殖曼氏无针乌贼(Sepiella maindroni)繁殖生物学特性研究

采用常规生物学方法和统计回归分析,研究了养殖曼氏无针乌贼卵巢成熟系数(GSI)的变化规律和个体生殖力与其主要形态指标之间的相互关系.结果表明,曼氏无针乌贼春苗100日龄时GS/达到最高(12.2%±3.25%),秋苗140日龄时GSI达到最高(13.7%±3.69%).曼氏无针乌贼秋苗的体质量相对生殖力(F<,W>)极...     

大通湖中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)自然生产潜力估算模型探讨

人放天养的中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)质量好、个体大、耐运输、肉质鲜美,是优质高档蟹的代表,但产量严重不足。建立一套湖泊中华绒螯蟹自然生产潜力估算的模型来估算湖泊中华绒螯蟹自然生产潜力,确定放养量,以达到湖泊中华绒螯蟹稳产已迫在眉睫。本文根据近20年来作者对湖泊中华绒螯蟹放养的经验,结合灰估理论,提出蟹自然生产潜力:W=[B1K1C1/R1+B2K2C2/R2]·(B1+B2)2/B12+B2和蟹种放养量:W0=P0[B1K1C1/R1+B2K2C2/R2]·U/P估算模型,并与生产实践进行求证。其结果与生产实践存在较好的一致性。其估算结果可作为指导湖泊中华绒螯蟹生产的依据。     

Report of Prionospio complex (Annelida: Polychaeta: Spionidae) from China's waters, with description of a new species

Nine species of Prionospio complex are recorded from China’s waters, including one new species and six newly recorded species. Prionospio (Prionospio) pacifica sp. nov., is characterized by having first and forth pairs of branchiae pinnate, second and third pairs of apinnate, ventral crest on Setiger 9 and dorsal crests on Setigers 10—25. Apoprionospio kirrae (Wilson, 1990), Prionospio (Aquilaspio) convexa Imajima, 1990, Prionospio (Minuspio) multibranchiata Berkeley, 1927, Prionospio (Prionospio) bocki Sderstrm, 1920, Prionospio (Prionospio) dubia Maciolek, 1985 and Prionospio (Prionospio) paradisea Imajima, 1990 are recorded for the first time from China’s waters.     

Optical properties of the red tide in Isahaya Bay,southwestern Japan: Influence of chlorophyll a concentration

Remote sensing reflectance [R _rs(λ)] and absorption coefficients of red tides were measured in Isahaya Bay, southwestern Japan, to investigate differences in the optical properties of red tide and non-red tide waters. We defined colored areas of the sea surface, visualized from shipboard, as “red tides”. Peaks of the R _rs(λ) spectra of non-red tide waters were at 565 nm, while those of red tides shifted to longer wavelengths (589 nm). The spectral shape of R _rs(λ) was close to that of the reciprocal of the total absorption coefficient [1/a(λ)], implying that the R _rs(λ) peak is determined by absorption. Absorption coefficients of phytoplankton [a _ph(λ)], non-pigment particles and colored dissolved organic matter increased with increasing chlorophyll a concentration (Chl a), and those coefficients were correlated with Chl a for both red tide and non-red tide waters. Using these relationships between absorption coefficients and Chl a, variation in the spectrum of 1/a(λ) as a function of Chl a was calculated. The peak of 1/a(λ) shifted to longer wavelengths with increasing Chl a. Furthermore, the relative contribution of a _ph(λ) to the total absorption in red tide water was significantly higher than in non-red tide water in the wavelength range 550–600 nm, including the peak. Our results show that the variation of a _ph(λ) with Chl a dominates the behavior of the R _rs(λ) peak, and utilization of R _rs(λ) peaks at 589 and 565 nm may be useful to discriminate between red tide and non-red tide waters by remote sensing.     

红沿河海域常见水母的食物组成分析——基于稳定同位素和脂肪酸标记法

为了探究不同种类水母对浮游食物网的摄食影响,采用碳氮稳定同位素和脂肪酸标记法,研究分析了渤海红沿河海域常见的4种小型水母(伞径直径5 cm:卡玛拉水母Malagazzia carolinae、球形侧腕水母Pleurobrachia globosa、帽铃水母Tiaricodon coeruleus、半球美螅水母Clytia hemisphaerica和3种大型水母(伞径10—200cm:沙海蜇Nemopilema nomurai、海月水母Aurelia aurita)和白色霞水母Cyanea nozakii)的食物组成。结果表明,不同种类水母的食物组成存在差异。其中卡玛拉水母、球形侧腕水母、帽铃水母、半球美螅水母和白色霞水母均偏肉食食性,食物组成中动物性食物所占比例更高,高于海月水母与沙海蜇。在食物粒径谱上,帽铃水母和半球美螅水母较大粒径的食物比例均高于小粒径的悬浮有机物(POM)比例。卡玛拉水母和球形侧腕水母各个粒径食物比例接近。大型水母中,白色霞水母的食物中大粒径的浮游动物的比例高于海月水母,更高于沙海蜇。由此看来,小型水母和大型的白色霞水母的暴发会直接影响大中型浮游动物数量,海月水母的暴发对不同大小的浮游生物均会产生一定的影响。而沙海蜇的暴发会大量摄食1 mm的小型浮游生物和POM,对大中型浮游动物以及更高营养层生物(鱼类等)的影响可能是通过蜇伤以及饵料竞争导致的。因此,不同种类水母暴发对浮游生物的影响存在差异。本研究从摄食角度初步探究了水母对海洋生态系统物质循环和能量流动的影响,为水母暴发的灾害防治提供了数据支持。     

褐菖鲉(Sebastiscus marmoratus)幼鱼生物学表型对体质量的影响效应

探究影响水产养殖动物体质量的关键生物学表型性状组合,进而揭示其体质量增长对策,对指导水产养殖动物的种质甄别与科学养殖具重要现实意义。随机选取象山西沪港海域板式网箱内养殖3个月的褐菖鲉幼鱼同生群个体60尾为研究对象,以全长(X₁)、体长(X₂)、体宽(X₃)、体高(X₄)、头宽(X₅)、侧线长(X₆)、尾柄高(X₇)、体质量(BW)、净体质量(NW)、内脏质量(W₁)、肠质量(W₂)、肝质量(W₃)、胃质量(W₄)、鳃质量(W₅)、心质量(W₆)为生物学测定指标,采用多元分析方法定量研究了体尺性状和称量性状对体质量的影响效应。结果表明:(1)经统计,所涉称量性状测定值较体尺性状更显离散,两者变异系数的波动范围分别为38.27%~89.86%和13.86%~17.78%,排序分别为W₄>W₁>W₆>W₂>W₅>W₃>NW>BW和X₃>X₄>X₆>X₅>X₂>X₇>X₁;经计算,消化脏器与内脏间的质量比呈W₃>W₄>W₂ (P<0.05);(2)相关分析显示,所涉体尺性状和称量性状均与BW呈极显著相关(P<0.01),两者相关系数波动范围分别为0.414~0.990和0.899~0.961,排序分别为NW>W₃>W₁>W₆>W₅>W₂>W₄和X₁>X₄>X₂>X₅>X₆>X₃>X₇;(3)经通径分析,被保留的称量性状组合和体尺性状组合的直接作用排序分别为NW>W₃>W₂>W₄>W₆和X₄>X₅>X₆>X₇;经决定程度分析和复相关分析,称量性状组合对BW的总决定系数和复相关指数均为0.989,体尺性状组合则均为0.961;(4)经偏回归分析,分别获得了基于称量性状组合和体尺性状组合的BW估算方程。研究结果可为褐菖鲉速生型种质遴选与科学养殖提供参考。     

舟山近海日本囊对虾野生群体与越冬养成群体形态性状对体重和肉重影响的比较

于舟山近海日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)海捕野生群体和露天池塘越冬养成群体中各随机选取150尾作为测定样本,依次测量其体重(Y1)、肉重(Y2)、体长(X1)、头胸甲长(X2)、胸宽(X3)、胸高(X4)、第二腹节长(X5)、第二腹节宽(X6)、第二腹节高(X7)、尾节长(X8)、尾节宽(X9)、尾节高(X10)、眼径(X11)、眼窝距(X12)、额剑长(X13)、额剑上缘锯齿数(X14)等16项表型性状,并采用相关分析、通径分析和偏回归分析等方法定量研究了日本囊对虾形态性状对野生海捕群体与露天越冬养成群体体重和肉重的影响效应。结果表明:(1)两实验测定群体的体重和肉重与本研究中除X14外的其它形态性状的相关系数均达到极显著水平(P0.01);(2)经通径分析,海捕野生群体被保留的形态性状与体重和肉重的复相关指数分别为0.944和0.837,露天越冬养成群体被保留的形态性状与体重和肉重的复相关指数分别为0.955和0.907,其中影响露天越冬养成群体体重和肉重的核心变量均为X1,重要变量依次为X2和X6,影响海捕野生群体体重和肉重的核心变量分别为X1和X2,重要变量均为X6;(3)经多元回归分析,得出了用于估算海捕野生群体体重和肉重的回归方程以及估算露天越冬养成群体体重和肉重的回归方程。     

南海大鹏湾盐田海域骨条藻数量的多元分析

１９９０年及１９９１年３月３０日－５月３０日，在南海大鹏湾盐田海域设点测定骨条藻数量及各环境要素，以逐步回归，主成分分析及判别分析的方法，分析该海区骨条藻数量与环境因子的关系。１９９０年４、５月与１９９１年４，５月骨条藻数量差异与该期间环境因子值差异显著有关；初步提出用三维主成分分析图及判别分析方程作为盐田海域骨条材料潮预报的方法。     

海水酸化对米氏凯伦藻和盐生杜氏藻种群增长和种间竞争的影响

大气中CO_2浓度升高导致的海水酸化改变了海洋生物赖以生存的化学环境,将对其生长、繁殖和代谢产生深远影响。本研究采用实验生态学的方法,以米氏凯伦藻(Karenia mikimotoi)和盐生杜氏藻(Dunaliella salina)为研究对象,探究在海水酸化条件下两种微藻种群增长和种间竞争关系的变化。结果发现:(1)在单培养体系中,随着二氧化碳浓度升高,米氏凯伦藻的环境负载能力(K)升高,而对其生长率进入拐点的时间(T_p)、内禀增长率(r)、进入指数增长期(T_(Ep))和静止期的时间(T_(Sp))均无显著性影响;对盐生杜氏藻而言,二氧化碳浓度升高显著降低了盐生杜氏藻的T_p和r值,而对其K、T_(Ep)、T_(Sp)均无显著性影响;(2)在共培养体系中,两种微藻的K值均受到显著抑制,与单培养体系相比差异显著(P0.05);二氧化碳升高改变了两种微藻的竞争关系,微藻之间的竞争表现为向有利于米氏凯伦藻的方向发展。(3)米氏凯伦藻去藻过滤液对盐生杜氏藻产生抑制作用,二氧化碳浓度升高加剧了这种抑制作用。     

Criteria for aging and sexing New Zealand oystercatchers

Criteria based on external characters are presented for aging and sexing the three New Zealand species of oystercatcher, Haematopus ostralegus finschi Martens, 1897, H. unicolor Forster, 1844, and H. chathamensis Hartert, 1927. Four classes are discerned: juveniles have brown dorsal plumage, a brown iris and grey legs; second‐year birds have an orange‐red iris and pale pink legs; sub‐adults have a dull red iris and pink legs; adults have a scarlet iris and bright coral pink legs. The three species can be sexed by discriminant analysis of the sexually dimorphic characters bill length (x ₁), bill length:bill depth (x ₂) and bill length:bill width (x ₃). Linear functions and discriminating values for predicting sex are :

H. ostralegus finschi 0.46x ₁+3.15x ₂+2.94x ₃, 77.41;

H. unicolor 0.12x₁+6.52x₂+2.85x₃ , 58.05; and

H. chathamemis ‐0.93x ₁+1.50x ₂+7.48x ₃, ‐20.86.

Similarly, the sexes of immature H. ostralegus finschi can be predicted :

juveniles 0.73x₁+ 5.76x ₂ + 3.10 _x3 116.57;

second‐year birds 0.57x ₁+5.12x ₂+ 0.98x ₈, 84.84; and

sub‐adults 0.55x ₁+1.88x ₂+ 1.08x ₃, 65.90.’