| 浒苔(Ulva prolifera)核糖体基因簇单元全长序列的克隆与分析 |
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| 引用本文： | 沈伟杰,缪晓翔,何 渊,韩红宾,王宗灵,穆新武,沈颂东.浒苔(Ulva prolifera)核糖体基因簇单元全长序列的克隆与分析[J].海洋科学进展,2019,37(3). |
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| 作者姓名： | 沈伟杰 缪晓翔 何 渊 韩红宾 王宗灵 穆新武 沈颂东 |
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| 作者单位： | 苏州大学基础医学与生物科学学院,江苏苏州,215123;自然资源部第一海洋研究所,山东青岛,266061;中国海洋大学海洋环境与工程学院,山东青岛,266061;江苏省骆马湖渔业管理委员会,江苏宿迁,223800 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 核糖体基因簇单元全长序列对于藻类分子鉴定与分类具有重要意义,而浒苔(Ulva prolifera)作为形成我国黄海绿潮的主要物种,其核糖体基因簇单元全长序列的克隆还未见研究报道。本研究通过分子克隆技术成功扩增了浒苔的核糖体基因簇单元全长序列。浒苔核糖体基因簇单元全长序列为8 948 bp,其中18S rDNA 1 760 bp,28S rDNA 3 259 bp,ITS1 205 bp,5.8S rDNA 160 bp,ITS2 176 bp和IGS 3 388 bp。对各部分序列的碱基组成进行分析后,我们发现ITS1,ITS2和IGS序列对胞嘧啶具有明显的偏好性,而18S rDNA和28S rDNA序列对鸟嘌呤具有明显的偏好性。浒苔核糖体基因簇单元全长序列的GC含量为54.12%,其中ITS1、ITS2和IGS序列的GC含量比保守序列的GC含量高,这表明内转录单元间隔区序列和基因间间隔区序列比保守序列变异率更高,进化速率更快。另外,IGS序列中发现大量简单的直接重复序列、串联重复序列、短对称序列和回文序列。浒苔核糖体基因簇单元全长序列可为其分类及分子鉴定提供有效的工具。
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| 关 键 词： | 浒苔 18S rDNA 28S rDNA ITS1 ITS2 5.8S rDNA IGS 核糖体基因簇 |
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